针对与国防息息相关的两岸关系发展，总统则表示，三年来政府改善两岸关系已获得实质成果，包括海峡和平曙光乍现、两岸开放後带来的经济社会获益、加入区域经济整合，以及与美国恢复高层互信等；过程中，政府未曾丝毫牺牲中华民国主权、台湾尊严以及人民福祉，其中两岸签署16项协议都是基於「以台湾为主、对人民有利」原则。总统说，此一作法亦获得国际社会一致肯定，因为我们化解了东亚仅存的两个冲突点之ㄧ，与朝鲜半岛形成强烈对比；因此，政府会继续推动两岸关系和解制度化，同时增加中华民国对国际社会的贡献，使其他国家感受到中华民国是一个爱好和平、与人为善、乐於助人的国家。
总统并再度重申，他任期中推动两岸关系，一定会坚持在中华民国宪法架构下，维持「不统、不独、不武」的台海现状，并在「九二共识、一中各表」的基础上推动两岸和平发展；事实上，经过三年半的运作，证明这些原则不仅是维护台海和平、促进两岸共荣的重要基础，更能恰如其分地维持海峡两岸和平，不会趋向冲突对立，「如果没有这些基础，未来的情况将令人担忧」。
总统最後期勉国军继续秉持「不贪财、不怕死、爱国家、爱百姓」的黄埔精神，让国军持续精壮，以扞卫中华民国主权、保卫台湾安全、维护台湾尊严并促进民众权益。
【总统府新闻稿】