两岸两会於99年6月29日签署「海峡两岸经济合作协议」，协议文本内容为序言、五章、十六条，主要内容包括：双方将「遵循平等互惠、循序渐进的原则」，「本著世界贸易组织（WTO）基本原则，考量双方的经济条件，逐步减少或消除彼此间的贸易和投资障碍，创造公平的贸易与投资环境」；明定协议的目标及合作措施；货品贸易协议、服务贸易协议与投资协议等之後续协商范围及启动时程；经济合作范围有智慧财产权保护、金融、海关、贸易便捷化、电子商务、产业合作、提升中小企业竞争力以及经贸团体互设办事机构等领域；早期收获规定双方在协议生效後，尽速享有部分货品降免税与服务业开放利益的项目，并建立相关配套措施，例如临时贸易救济规则、临时原产地规则等；相关配套安排，例如例外条款、争端解决机制、机构安排（由双方成立「两岸经济合作委员会」）、文书格式、附件及後续协议（构成本协议的一部分）、修正、生效、终止条款等。
效益：
两岸协议执行成效专区