民国九十年一月一日(2001.1.1)
陈水扁总统发表元旦祝词强调，台湾内部对如何建构未来两岸关系的策略虽缺乏共识，但是对於要求中共扬弃对台文攻武吓，以及以和平方式进行建设性对话的立场并无二致。
民国九十年一月一日(2001.1.1)
依据「试办金门马祖通航实施办法」，即日开始试办金马小三通。
民国九十年一月二日(2001.1.2)
「小三通」官方金厦通航参访团从金门料罗港顺利启航。
民国九十年一月三日(2001.1.3)
陆委会主委蔡英文表示，「小三通」的成功是「大三通」能否顺利上路的关键，政府绝对无意以「小三通」来拖延「大三通」的进程。
民国九十年一月六日(2001.1.6)
行政院六日至七日在台北召开全国经济发展会议，结论包括：因应加入世贸组织，检讨调整「三通」的「通商」政策，合理开放大陆货品进口，并开放陆资企业来台投资服务业；在平等互惠原则下，与大陆方面展开两岸通航协商；加强两岸科技交流，扩大引进大陆产业科技人才。
民国九十年一月十一日(2001.1.11)
陆委会主委蔡英文於会见美国在台协会理事主席卜睿哲时表示，我方仍然希望海基会、海协会的协商机制能够尽快恢复，将来在一定条件下，两岸的政府人员也能坐下来交换意见。
民国九十年一月十二日(2001.1.12)
陈水扁总统表示，他心中的「统合」就是欧盟模式，其中具有主权、自由、自愿三大意义。
民国九十年一月十九日(2001.1.19)
中共国务院副总理钱其琛於「全国台办主任会议」中指出，要进一步推动两岸经济、文化交流与人员往来，促进早日实现两岸直接「三通」。
民国九十年一月廿二日(2001.1.22)
陆委会针对钱其琛「江八点」六周年讲话，发表三点声明，重申愿与中共当局坐下来谈，彼此不预设前提与立场，针对两岸共同及各自关心的问题展开沟通对话。
民国九十年一月廿二日(2001.1.22)
中共在北京举行「江八点」发表六周年座谈会，中共国务院副总理钱其琛称，「两岸同胞都是中国人，大陆和台湾都是中国的领土，大陆方面追求和平统一，而所主张的一个中国，是包括大陆和台湾在内的一个中国」。
民国九十年一月廿九日(2001.1.29)
陆委会主委蔡英文表示，立法委员曹尔忠与大陆「福建省马尾经济文化交流中心」签订合作协议的行为，是民间性的沟通，没有生效与否的问题。此乃因为「小三通」的协商属於中央政府职权，地方协商不可能取代官方协商。
民国九十年二月六日(2001.2.6)
第一艘首航台湾金门的大陆厦门客轮，完成了往返金、厦的历史性航程。
民国九十年二月八日(2001.2.8)
首批中共「新华社」来台驻点记者范丽青、陈斌华抵达台北，展开为期一个月的驻点采访。
民国九十年二月廿日(2001.2.20)
行政院院长张俊雄在立法院的施政报告中表示，过去政府实施的「戒急用忍」政策，随时空条件变迁，已到必须调整的时刻。行政院已经指示经济部及相关部会就两岸经贸政策全面检讨，将朝「积极开放，有效管理」方向调整。
民国九十年二月廿三日(2001.2.23)
行政院长张俊雄在立法院表示，「国统纲领」是两岸关系的重要文件，不过，这几年两岸互动情势有所变化，确有必要再进行思考，惟目前并无调整「国统纲领」急迫性。
民国九十年三月一日(2001.3.1)
海基会董事长辜振甫赴海基会视察业务，在答覆记者询问时强调，一九九二年会谈期间，两会曾先後交换十三个版本的表述方案，随後并有口头表述方案，中共称双方已达成「两岸均坚持一个中国原则」的共识，但我方所理解的共识却是「一个中国各自以口头表述」，随後即搁置该项争议。
民国九十年三月五日(2001.3.5)
中共「国务院总理」朱熔基於「全国九届人大四次会议」上表示，大陆将继续执行「和平统一、一国两制」的基本方针和「江八点」。并在坚持「一个中国」的原则下，继续推动两岸对话与谈判，发展两岸经济文化交流和人员往来。
民国九十年三月九日(2001.3.9)
陆委会在海基会成立届满十周年之际表示，过去十年来在两岸协商方面，海基会一直是政府处理两岸涉及公权力事宜唯一的授权管道。
民国九十年三月廿一日(2001.3.21)
中共「国台办经济局长」何世忠率大陆经贸访问团来台访问期间表示，大陆当局不容许台商一方面在大陆捞钱，一方面在台湾支持「台独」，并对我政府「戒急用忍」政策提出批评。
民国九十年三月廿三日(2001.3.23)
中共「国家主席」江泽民接受华盛顿邮报专访时表示，两岸统一不适用邦联或联邦制。
民国九十年三月廿四日(2001.3.24)
中共「国务院副总理」钱其琛於对台宣传工作会议中再次重提了「新三句」，即坚持世界上只有「一个中国」，大陆和台湾同属於「一个中国」，中国的主权和领土完整不可分割。
民国九十年三月廿六日(2001.3.26)
陆委会主委蔡英文表示，目前两岸应该先以经贸互动做为建立双方互信的基础。
民国九十年四月九日(2001.4.9)
劳委会公布实施「大陆地区配偶在台湾地区停留期间工作许可及管理办法」。
民国九十年四月廿七日(2001.4.27)
海基会董事长辜振甫於「辜汪会谈」届满八周年纪念谈话中表示，两岸只有面对面的沟通对话，才能求同存异、消除误解，更可以增进互信，找到进一步合作空间，他并再度诚挚邀请大陆海协会会长汪道涵来台访问。
民国九十年五月十五日(2001.5.15)
经济部部长林信义在记者会上表示，政府对大陆经贸「戒急用忍」政策将作调整，未来产业赴大陆投资项目，将由目前正面表列，改采负面表列方式，但对电厂投资案，仍不开放。
民国九十年五月廿一日(2001.5.21)
陈总统五月廿一日至六月五日赴中美洲邦交国进行「合作共荣，睦谊之旅」。
民国九十年五月廿七日(2001.5.27)
陈总统於「合作共荣，睦谊之旅」在瓜地马拉与随行记者茶叙时，提出两岸「新五不政策」：（一）军售、过境美国不是对中共的挑衅；（二）中华民国不会错估、误判两岸情势；（三）台湾不是任何一个国家的棋子；（四）政府从来没有放弃改善两岸关系的诚意与努力；（五）两岸关系不是零和关系。
民国九十年五月卅日(2001.5.30)
行政院院会通过「台湾地区与大陆地区金融业务往来许可办法」部分条文修正案，开放国际金融机构分行办理两岸金融业务直接往来，并允许国内金融机构赴大陆设立代表人办事处。
民国九十年五月卅日(2001.5.30)
中共「国台办发言人」张铭清表示，海峡两岸僵局至今没有打破，与台湾领导人不承认「一个中国」有密切相关。
民国九十年五月卅一日(2001.5.31)
日本产经新闻报导，中共正准备在福建省东山岛进行陆海空军与战略飞弹部队联合演习，其购自俄罗斯的苏恺廿七战斗机也在参加之列，这项大规模登陆演习，是以台湾为假想对象，进行波状攻击，目标是模拟夺取台海制空权。
民国九十年六月一日(2001.6.1)
陆委会发表港澳白皮书指出，期望中共以宏观、长远的视野，务实地处理台港澳关系，进而建立正常化的联系协调机制。并乐见港澳均能成立驻台机构，建立相互往来的新架构，共创「四赢」的局面。
民国九十年六月六日(2001.6.6)
交通部民航局宣布，鉴於台港双方尚未谈妥新航约，为使台港航线继续正常营运，双方已签署延约协议文件，将旧约效期从6月12日展延至今年12月31日止。
民国九十年六月七日(2001.6.7)
中共外交部发言人孙玉玺称，中共的基本主张是实现「和平统一」，只要台湾提出接受「一个中国」原则，两岸可就如何缓和当前的台海紧张局势进行商谈，包括如何撤离中共在福建部署的导弹等任何议题，均可透过谈判方式解决。
民国九十年七月五日(2001.7.5)
陆委会发布「开放大陆地区人民来台观光政策规画及推动」说帖指出，政府已完成「大陆地区人民来台从事观光活动许可办法」草案，大陆人士来台观光将采「总量管理」方式循序渐进，并以「团进团出」模式进行。
民国九十年七月八日(2001.7.8)
总统府经济发展谘询委员会召开首次筹备会议，「促进两岸经贸交流、根留台湾」列为五大讨论议题之一，题纲包括：一、两岸经贸与国家安全；二、检讨两岸投资规范；三、两岸通航之时机与条件；四、建立资金回流机制；五、加速WTO与两岸贸易之因应调整。
民国九十年七月十日(2001.7.10)
海基会去函大陆海协会，请其协调大陆有关单位尽速协助查缉「杀戮人」传真恐吓勒索信函嫌犯遣返。
民国九十年七月十日(2001.7.10)
中共国家主席江泽民在北京中南海接受俄罗斯伊塔－塔斯社和国营ORT电视网访问时称，不能承诺放弃对台动武，尤其是对「外力」及台湾内部反中共主权者动武。
民国九十年七月十二日(2001.7.12)
中共「国务院副总理」钱其琛於会见我新党民意代表等成员一行时，提出「一国两制」的七项内容：一、继续使用台币；二、继续保有军队；三、单独关税区；四、继续保持政府架构；五、不拿台湾一分钱，不会调动台湾资金；六、台湾人民、企业家保有原有财产；七、人事自主，不派任何官员到台湾。
民国九十年七月十三日(2001.7.13)
陈水扁总统表示，「一国两制」是要将台湾「香港化」，制度、自由、人权都必须得到中共当局的同意才算数。这样的「一国两制」，绝大多数台湾人民都不能接受。
民国九十年八月六日(2001.8.6)
海基会去函大陆海协会，就大陆渔船擅入我方海域并使用不法渔具作业事，协调大陆相关单位严格约束大陆地区渔民。
民国九十年八月十四日(2001.8.14)
内政部修订发布「大陆地区专业人士来台从事专业活动许可办法」部分条文修正案，大陆科技人士来台停留，期限延长为三年。
民国九十年八月廿六日(2001.8.26)
经济发展谘询委员会议同意以包裹方式通过两岸组共同意见，包括：推动两岸经贸发展之基本原则、积极开放两岸经贸及投资（「戒急用忍」政策之松绑）、建立两岸资金流动的灵活机制、加入WTO与两岸「三通」、积极推动大陆人士来台观光及两岸协商问题。
民国九十年八月廿八日(2001.8.28)
华盛顿时报报导，据美国最新情报显示，中共陆续在福建、浙江等沿海地区增设M族短程战术弹道导弹，从今年四月的三百枚於今扩增超过三百五十枚，美侦察卫星同时发现，浙江江山地区七月间出现新的M族导弹基地。
民国九十年九月三日(2001.9.3)
中共外交部发言人朱邦造在北京与外籍记者聚会时警告称，外资公司如果与台湾政府官员直接接触，很可能将失去在中国大陆的商机。
民国九十年九月五日(2001.9.5)
行政院会通过「试办金门马祖与大陆地区通航实施办法修正案」，增订试办通航期间，基於大陆政策需要，中华民国船舶得经交通部专案核准由澎湖进入大陆地区。
民国九十年九月廿一日(2001.9.21)
陆委会主委蔡英文在立法院答询时强调，两岸通航或开放大陆人士来台观光等政策，涉及公权力行使问题，不宜由民间机构代表与对岸协商。
民国九十年九月廿七日(2001.9.27)
中共外交部发言人朱邦造在记者会上强调依APEC有关谅解备忘录的规定和惯例，「陈水扁不能参加上海APEC的会议」。
民国九十年九月廿八日(2001.9.28)
财政部公布核准第一、华南、彰化、中国国际商银、土地、合作金库、世华、中国信托商银等8家银行，赴大陆设立办事处。
民国九十年十月一日(2001.10.1)
大陆中华全国新闻工作者协会记者团一行16人抵台采访，此批大陆记者在新闻局发放的记者证有效期限之内，无须受限於某地，可自由於台湾境内进行与教育相关的采访活动，突破以往大陆记者来台的限制与规定。
民国九十年十月十日(2001.10.10)
陈水扁总统发表国庆致词时表示，希望对岸的领导人能够体会当前台湾主流民意所在，尽速恢复两岸对话的机制，开启协商的大门，为两岸人民新世纪的未来创造无限可能的契机。
民国九十年十月十八日(2001.10.18)
APEC记者会上中共「外交部部长」唐家璇「纠正」我方媒体不应以「中共」称呼其政权，并悍然拒绝我经济部部长林信义发言。
民国九十年十月廿日(2001.10.20)
中共国台办新闻发言人张铭清在记者会上称，如果台湾方面解除对大陆记者赴台驻点采访的「四家、两人、一个月」的限制，大陆将进一步考虑开放台湾媒体到大陆设办事处及记者站等常驻事宜。
民国九十年十月廿一日(2001.10.21)
中共国台办发言人张铭清在记者会上称，只要符合就业条件和用人单位愿接受，支持在大陆求学的台湾学生在境内就业。
民国九十年十一月一日(2001.11.1)
陈水扁总统接见美国国防部前部长柯恩时，指出中共提出承认「一个中国」原则是「九二共识」，作为复谈的前提要件，是变相拒绝对话，因为我们遍查所有文件，并无所谓该「共识」，这是中共自创，并未获得台湾同意。
民国九十年十一月一日(2001.11.1)
中共外交部发言人朱邦造在例行记者会上称，在「一个中国」原则下，台湾提出两岸合办奥运的要求，双方的奥会是可以谈的，但最後还是要经过国际奥会的批准。
民国九十年十一月七日(2001.11.7)
行政院院会通过大陆投资「积极开放、有效管理」政策，取消大陆投资个案5,000万美元上限，建立新的审查机制。
民国九十年十一月七日(2001.11.7)
行政院会宣布第二阶段两岸金融业务往来措施，决定放宽国际金融业务分行（OBU）与大陆银行直接通汇。
民国九十年十一月十二日(2001.11.12)
陆委会发表声明指出，两岸互不隶属，双方加入WTO申请案也是分开处理，入世後将是两个独立、平行、对等的会员体。希望大陆当局不要以政治干预两岸经贸关系以及WTO体系下两岸的互动，以体现WTO的自由贸易精神。
民国九十年十二月五日(2001.12.5)
中共「国台办发言人」张铭清强调，中共对台政策不会改变，欢迎台商继续到大陆投资。台湾任何政党、任何团体及人士，只要是接受「一个中国」原则及「九二共识」，主张改善和发展两岸关系，中共都愿与其打交道。
民国九十年十二月十六日(2001.12.16)
中共海协会在北京举行成立十周年酒会，汪道涵书面谈话称，两岸相继加入世贸组织，为「三通」创造有利条件，两岸应早日进行直接「三通」，加强两岸经济合作，并称台湾应承认「九二共识」以便两会及早重开对话。
民国九十年十二月廿五日(2001.12.25)
行政院金马小三通指导委员会决定，金马「小三通」试办期间展延一年。