- 有相对多数(32.8%)的民众认为林案对海基、海协两会以後交往有负面影响，亦有相对多数(43.8%)的民众认为对未来两岸民间交流有负面影响。
- 有相对多数(41.4%)的民众，认为未来两岸协商的议题应以低政治议题(包括经济性议题和事务性议题)为优先，以政治性议题为优先者，仅占18.6﹪。
- 自认为是「台湾人」的比率较七月份调查上升了4.4个百分点，第四度超越自认两者皆是的比率。
- 倾向独立(含「尽快宣布独立」及「维持现状，以後走向独立」)的比率小幅扬升至二成，并第三度超过倾向统一（含「尽快统一」及「维持现状，以後走向统一」）的比率。
调查结果各项百分比如下：
(一) 民众的统独立场（如图一、图二）
主张广义维持现状(包括「维持现状，看情形再决定独立或统一」、「维持现状，以後走向统一」、「维 持现状，以後走向独立」、「永远维持现状」)的民众仍占绝大多数(73.6%)，惟历次调查结果皆维持在八成左右，此次则稍降。另无反应者比率上升。
主张「维持现状，看情形再决定独立或统一」是六种意见里的最大多数(占30.5%)。惟自八十六年十一月的42%，逐渐下降。主张狭义的维持现状(「永远维持现状」)者占15.3%，与今年四月以来的调查比较，无太大变化。
值得注意的是，倾向於统一的比率(含「尽快统一」及「维持现状， 以後走向统一」者约占一成六)，经过此事件後，第三度(前两次分别为八十五年三月、八十六年八月)少於倾向独立的比率(含「尽快宣布独立」及「维持现状，以後走向独立」，约占二成)。
(二) 民众的自我认同
有关民众对自我认同的看法，有38.4%的民众认为自己「既是台湾人也是中国人」，有38.9%的民众认为自己是「台湾人」，有16.4%的民众认为自己是「中国人」。与七月份的调查结果比较，自认是台湾人的比率上升了4.4个百分点，为自八十一年调查以来，第四度超越两者皆是的比率(前三次分别为八十六年九月、八十六年十一月、八十七年四月)。
(三) 民众认知大陆对我敌意
大多数的民众(60.8%)认为大陆当局对我政府是不友善的(含「非常不友善」和「不友善」)，与七月调查结果相当。有半数以上(52.7%)的民众认为大陆当局对我人民是不友善的(含「非常不友善」和「不友善」)，比七月调查结果上升10个百分点，是本年四月以来调查结果的最高点，与八十六年八月的调查结果相当。显示民众因林案而感受到大陆当局对我民众的敌意态度有升高的趋势。
(四) 民众对於林滴娟事件的看法
有高达90.7%的民众知道林滴娟议员在大陆不幸遇害这事件。对於大陆方面处理林案的方式，有46.5%的民众表示不满意，18.9%的民众表示满意，29%的民众无反应。其中不满意的原因，依序为：大陆方面处理草率、办案不认真(28.3%)，消息不流通、报导不确实(25.8%)，拒绝让海基会人员去大陆协助处理後事(8.6%)，及不尊重家属意见解剖林的遗体(8.2%)。
(五) 民众对海基会处理此事件的看法
有72.9%的民众认为我方海基会应该接受林滴娟家属的要求，派人到大陆帮忙处理後事，只有5.4%的民众认为不应该。
(六) 民众对海协会抨击海基会反应的看法
对於大陆海协会来函表示，海基会利用林滴娟事件扩大两岸分歧、制造事端的说法，有67.8﹪的民众表示不同意，只有6.8﹪的民众表示同意。
(七) 对未来两岸交流的影响
对於林案对海基、海协两会以後交往的影响，有32.8%的民众认为有负面影响，有11.0%的民众认为有正面影响，有28.3﹪的民众认为没有影响。
而林案对未来两岸民间交流的影响，有43.8%的民众认为将有负面影响，有10.6%的民众认为会有正面影响，有25.5﹪的民众认为没有影响。
经过此事件後，有33.6%的民众认为两岸民间交流的速度应该维持不变，有25.0%的民众认为应放慢，有15.1﹪的民众认为应该加快。其中认为应放慢交流者，亦以经济交流为最多(占57.8%)，其次为观光探亲(5.7%)和政治交流(5.1%)。认为应该加快交流者，若按项目细分，则以经济交流最多(占27.4%)，其次为政治交流(11.3%)和文教交流(11.2%)。
(八) 对两岸协商议题的看法
对未来两岸协商的议题，有46%的民众赞成我们政府除了经济性、事务性的问题外，也可就政治性的问题与中共进行协商。与七月份的调查结果比较，下降了六个百分点。至於何者优先？认为应以经济性议题为优先者，占21.4%；以事务性议题为优先者，占20.0%；以政治性议题为优先者，占18.6%；三者比率接近，但有高达34.2%之民众无反应(无意见、不知道或拒答)。