民国九十四年一月三日(2005.1.3)
海协会致函海基会，对海基会辜董事长振甫先生逝世特致哀悼。
民国九十四年一月三日(2005.1.3)
对海协会来函表达辜董事长振甫先生辞世慰问，海基会复函海协会表示谢忱。
民国九十四年一月十五日(2005.1.15)
两岸春节包机协商在澳门举行，双方达成共识，包括：包机时间从1月29日到2月20日；大陆航点为北京、上海、广州，台湾航点为台北（中正机场）、高雄（小港机场）；双方各可有6家航空公司飞行，各执行24次航次来回；不须中停第三地，但须飞经香港情报区。
民国九十四年一月廿九日(2005.1.29)
两岸春节包机首航，两岸八家航空公司的十八架次班机往返两岸，共计载客2000余人。
民国九十四年二月二日(2005.2.2)
海协会副会长孙亚夫、副秘书长李亚飞在代表参加汪道涵先生对辜振甫先生的吊唁活动後离台。李亚飞在机场对媒体表示希望海基会能够在辜先生「中国的」「善意的」「服务的」的创会宗旨下﹐在「九二共识」的基础上尽早地重新与大陆海协会多合作。
民国九十四年三月一日(2005.3.1)
宜兰县苏澳港籍渔船「海龙001号」在台湾淡水富贵角外海四十五海里附近海域作业时因船身破裂、船舱进水而沉没，造成五人死亡、二人失踪，其中六人为大陆渔工事件，海协致函台湾「海峡两岸人民服务中心」，要求转告台湾有关方面协助处理善後，福建红十字会也与台湾红十字组织进行联系。
民国九十四年三月卅一日(2005.3.31)
中共中央政治局常委、全国政协主席贾庆林表示，应该坚持体现一个中国原则的「九二共识」，争取在「九二共识」的基础上谈起来，以利於改善和发展两岸关系。
民国九十四年四月六日(2005.4.6)
中共民航协会常务理事、海峡两岸航空运输交流委员会副理事长浦照洲在致台北市航空运输商业同业公会改选换届贺函中提出，希望就「节日化」、「周末化」、「常态化」包机的相关问题，尽快与台湾同行进行新一轮沟通。
民国九十四年四月十三日(2005.4.13)
行政院大陆委员会发言人游盈隆表示，中共当局既然承认两岸交流议题应有公权力的介入，必须与台湾政府协商，却又刻意排除与政府互动，中共在政治上惯常以切割台湾内部的方式，对台统战与分化的算计非常明显，更凸显中国意识形态的盲点，是两岸交流的真正障碍。
民国九十四年四月十三日(2005.4.13)
中共国务院台办发言人在例行发布会上表示，院愿意与认同「九二共识」、反对「台独」、主张发展两岸关系的台湾各党派、团体和代表性人士寻求协商解决问题的新途径。欢迎他们来大陆开展交流和对话，就两岸「三通」、建立更紧密经贸关系安排及李伴同胞关心的所有问题交换意见，共同推动两岸关系改善和发展。
民国九十四年四月十六日(2005.4.16)
中共国务院台办主任陈云林透过新闻发布方式表示，中国大陆方面将对两岸新闻交流采取更加开放的政策，大力推动两岸的新闻单位互设常驻机构。
民国九十四年五月二日(2005.5.2)
正进行「南泰专案─海洋夥伴、阳光之旅」的陈水扁总统重申，只要在民主、和平、对等三原则下，两岸之间的正式接触、对话、协商、谈判，随时都能展开。并强调，为降低两岸紧张情势，应及早建立两岸军事安全互信谘商机制。
民国九十四年五月三日(2005.5.3)
中共中台办副主任王在希记者会说，在一个中国原则基础上，双方可优先讨论结束敌对状态的问题。只要是大家能够在一个中国原则基础上坐下来谈，什麽问题都可以谈，包括导弹的问题。
民国九十四年五月四日(2005.5.4)
陆委会吴钊燮主委表示，只要促进两岸交流的事情，陆委会都会推动，「扁胡会」也不排除，两岸一定要坐下来谈，但前提是和平、民主和对等。
民国九十四年六月七日(2005.6.7)
陆委会主委吴钊燮表示，张俊雄的个性、处事风格及从政历练，一直都是以和解代替对抗，所以由他担任海基会的职务，对於两岸关系的改善，以及中国大陆对民进党和两岸关系的看法，有可能会有改观的效果。吴钊燮也说，张俊雄未来也将是两岸政治性议题的首席谈判代表。至於其他多元的谈判议题则是委托其他机构作为代表。
民国九十四年六月十三日(2005.6.13)
行政院长谢长廷出席「大陆台商协会联谊餐会」时宣布，政府将委请台北市航空运输商业同业公会协助联系安排协商两岸货运包机，就「双向、对飞、不中停」模式进行规画；委请外贸协会协助联系安排协商台湾农产品销往大陆；并透过适当组织安排协商大陆人民来台观光事宜。
民国九十四年六月十四日(2005.6.14)
陆委会主委吴钊燮强调，对於涉及公权力事项，坚持政府主管官员「实质参与」的过程，但对参与的形式与名义，应可采取务实弹性的做法处理。
民国九十四年六月十四日(2005.6.14)
陆委会主委吴钊燮指出，政府将在建立完整配套的基础上，优先推动「货运包机」、「台湾农产品输销大陆」及「大陆人士来台观光」三项两岸协商议题。如果大陆方面作出正面、具体的回应，两岸就可以进行协商，以利及早作出相关安排。
民国九十四年六月十五日(2005.6.15)
国台办记者会，发言人李维一表示，希望台湾方面同意民间行业组织就两岸客运直航问题进行沟通和做出安排，「与此同时，我们也愿意就两岸货运包机一事充分交换意见。」「为方便两岸往来和方便旅游，客运包机已经成为最现实、最迫切（需要）解决的问题。」
李维一指出，中国商务部所辖的海峡两岸经贸交流协会在六月一日向台湾省农会等台湾农业组织发出邀请，欢迎这些机构尽快组团访问北京，就台湾水果零关税销售大陆等技术性问题进行商谈。
民国九十四年七月一日(2005.7.1)
海峡交流基金会董事长张俊雄在接受记者专访时表示，两岸必须要有制度化的协商，来打破僵局。张俊雄说，两岸对话既然这麽重要，就应该先把有关「九二共识」，「一个中国」原则等这些复杂的政治议题搁置在一边，多展开接触对话。
民国九十四年七月六日(2005.7.6)
行政院长谢长廷在院会表示，两岸应严肃面对共同打击犯罪问题，并尽速展开协商，不要让两岸政治情势成为犯罪者的避风港；包括执法人员的定期互访、犯罪情报的交流机制、刑事通缉犯的查缉和遣返等，这些作业都非常需要加强，尽速与对岸协商。
民国九十四年七月十八日(2005.7.18)
吴钊燮主委强调，未来陆委会也会努力邀请对岸就实质性议题进行协商，包括共同打击犯罪、偷渡犯遣返、货币清算机制、台商投资保障协议、避免双重课税、金融监理机制等议题。他说，只要不预设任何前题，台湾愿意与大陆方面就任何非政治议题协商，进而慢慢朝向政治性议题进行讨论。
民国九十四年七月廿八日(2005.7.28)
陆委会主委吴钊燮宣布，政府正式委托外贸协会，就台湾生鲜水果输销大陆的相关问题以及采取更便捷的措施，和中国大陆的相关机关进一步联系，在了解中方的意向与相关的政策後，希望可以及时展开协商，并作成更适当的安排。
民国九十四年七月廿九日(2005.7.29)
陆委会发言人游盈隆记者会中表示，两岸交流关键问题，仍需回归双方公权力，或由政府同意的机构洽商；唯有双方面对面坦诚对话，安排相关事宜，最後才能适当协商。
民国九十四年八月三日(2005.8.3)
行政院长谢长廷宣布：同意两岸货运、重要节日客运包机直航等事宜，授权与大陆展开同步商谈。
民国九十四年八月十二日(2005.8.12)
陆委会副主委兼发言人游盈隆在例行记者会中宣布，政府已在2日正式发函委请台北市航空运输商业同业公会，针对两岸客货运包机同步协商一事，与中国大陆方面的对口单位，展开先期联系安排相关事宜。
民国九十四年八月十六日(2005.8.16)
陆委会发布新闻稿表示：中共国台办主任陈云林(16)日就两岸货客运包机发表谈话，这项谈话基本上已正面回应8月3日行政院谢院长的谈话，陆委会对此表示欢迎，也希望大陆方面能够言行一致，尽早与台湾方面就货客运包机相关事宜展开协商。
民国九十四年九月二日(2005.9.2)
大陆民航总局有关主管部门批准台湾长荣、中华、立荣、华信4家航空公司飞越大陆空域的申请。
民国九十四年九月三日(2005.9.3)
针对大陆批准台湾四家航空公司飞越中国大陆空域的申请，陆委会发言人游盈隆表示欢迎并希望这种良性互动能继续延伸到双方货客运包机的协商，以利及早作成安排。
民国九十四年九月十九日(2005.9.19)
陆委会发布新闻稿指出，要进一步促进两岸经贸关系正常化，实现全面性直接双向的经贸往来，首须中共当局调整错误的对台政策，并停止分化台湾内部的不当作为，并针对我方所提出之三项优先协商议题，包括货客运包机、台湾农产品输销大陆及大陆人民来台观光，作出积极、正面、具体的回应，以引导两岸关系逐步回到正轨，进而开启两岸沟通协商的新时代。
民国九十四年九月廿八日(2005.9.28)
中共国台办例行记者会，发言人李维一表示，从即日起，台湾记者在大陆驻点采访的时间由现行的每次1个月延长至每次3个月。
民国九十四年九月廿九日(2005.9.29)
陆委会吴钊燮主委在立法院表示，任何中国官员要来进行交流，陆委会政策立场是，一切都按照正常程序来办理。
民国九十四年十月四日(2005.10.4)
海基会致函海协会，慰问龙王台风在福建地区造成的灾害。
民国九十四年十月十三日(2005.10.13)
陆委会吴钊燮主委出席「亚太安全的旧挑战与新发展」论坛接受访问时说，中共领导人胡锦涛曾说「凡是对台湾人民有利的事，他们都会做，并努力做好。」目前我方所提的协商，不仅是对台湾人民有利，对中国大陆人民也有利，也有助於两岸关系，中共应认真的与台湾展开各项协商。
民国九十四年十月廿五日(2005.10.25)
中共中央政治局常委贾庆林在纪念台湾光复60周年大会上表示，在「九二共识」的基础上，我们愿意与任何人或任何政党进行对话和谈判，什麽问题都可以谈。
民国九十四年十一月一日(2005.11.1)
陆委会新闻稿指出，中共国家旅游局长邵琪伟等一行，是由我方观光协会邀请，并在政府主管机关的许可之下，应邀前来台湾访问并考察观光景点。因此，呼吁各界应该要以宽大的心胸与和善的态度来面对邵局长一行，支持政府，促成大陆人民可以早日来台湾观光，争取两岸互惠双赢的目标。
民国九十四年十一月三日(2005.11.3)
陆委会副主委黄伟峰表示，中国大陆民航总局台港澳办公室主任浦照洲发函台北市航空运输商业同业公会理事长范志强邀请商谈两岸春节包机，同时也包括货客运包机。陆委会认为，浦照洲的来函正可以证明，两岸的授权单位在过去一直有持续沟通的默契。
民国九十四年十一月四日(2005.11.4)
陆委会发布新闻稿指出，推动货客包机是政府的既定政策，也由行政院谢院长在今（94）年6月13日及8月3日分别作过政策上的宣示，陆委会也已委请台北市航空运输商业同业公会作为协商的连系窗口，相关部门亦努力推动协商相关事宜。2005年两岸在澳门协商春节包机，双方虽有不同立场及考量，仍可以就「双向、对飞、不中停」之春节包机运作方式达成共识并顺利启航，这证明两岸只要能够秉持此一精神共同努力，无论是2006年的春节包机乃至货客包机，都能及早完成协商，取得成果。
民国九十四年十一月六日(2005.11.6)
中国国民党将邀请中共国台办主任陈云林於十二月间访台，陆委会主委吴钊燮表示，这个邀请是由国民党智库提出，属於文教交流，但陈云林位居中国对台政策主管官员，其身分特殊，除了必经的内政部境管局的联审程序外，为维护安全及行程安排顺畅考量，中国方面应派出工作层级人员来台与台湾政府，或是基於过去海峡交流基金会与中国海峡两岸关系协会磋商辜汪往访的经验，由两会就此事进行必要的协商，陆委会坚持这些磋商，将是审酌申请案能否得到准许的必要程序。而即使陈云林以民间学者身份申请访台，只要他是中国大陆高阶层官员，都必须要经过双方政府的沟通与安排。
民国九十四年十一月六日(2005.11.6)
陆委会发布新闻稿表示，本次中共国家旅游局局长邵琪伟一行应台湾观光协会邀请来台参访，目的非常单纯；邀请单位以及各地接待该团的业者及服务人员，都能善尽地主之谊，展现台湾最美好的一面。陆委会表示，开放大陆旅客来台观光案能有今天的发展，各界热心人士的共同协助，是重要因素之一，对此，陆委会一并表达感谢之意。
民国九十四年十一月十一日(2005.11.11)
陆委会发布新闻稿指出，就申请案中所列的行程来看，陈云林等人刻意回避与我政府部门接触的意图十分明显，到目前为止，我们并没有看出本案对两岸关系会产生什麽正面的意义。1998年辜振甫前董事长赴大陆，以及1999年汪道涵先生计画来台之前，都经过两岸政府部门完整与缜密的规划安排，并且透过海基、海协经由政府授权的管道做过多次正式的协商，事先做必要的准备。辜、汪两位名义上均属民间人士，但基於两岸政府各自的授权，尚且都有此安排，陈云林等国台办大批官员申请来台一事，更需要由双方政府部门做先期的协商。我们会邀请国台办立即派员与我们展开正式协商，若中国方面有困难，我方也可以派员组团赴中国与他们协商，这也是政府在实质审查本案之前必要的程序。
民国九十四年十一月十四日(2005.11.14)
海基会致函大陆海协会，希望协商中共中央台办主任陈云林访台事宜。函中表示，若大陆方面有困难，台湾方面可派员组团赴大陆协商。
民国九十四年十一月十四日(2005.11.14)
海巡署金门海巡队执行「晴空专案」，在驱离两艘越界中国大陆渔船时，遭其中「闽晋渔0二四二」号渔船反抗与袭击，大陆渔民连船依违反两岸人民关系条例、刑法妨害公务等罪嫌移送金门地检署侦办。
民国九十四年十一月十六日(2005.11.16)
两岸航空运输企业联谊会在澳门举行，共同磋商2006年春节两岸包机直航事宜。
民国九十四年十一月十六日(2005.11.16)
陆委会主委吴钊燮在立法院表示，陆委会要求陈云林来台参加国共论坛前，两岸应先协商，不是为了阻挠两岸交流，而是希望透过协商建立两岸正常化的程序；如果政府同意不设协商条件，对公权力及国家安全都会造成危害，协商「是必要的程序」。
民国九十四年十一月十六日(2005.11.16)
陆委会发布新闻稿指出，据各方讯息显示，大陆各地近期已有11个省相继发现禽流感疫情讯息，但是迄今中共官方仅针对部分个案做零星与隐晦的说明，所片段公布的也只有6个省，这种作法对全球防疫而言，是个危险的警讯。保障人民的健康与安全是政府不可推诿的责任，我政府对防治禽流感一事已做好各项周延的准备，但两岸交流密切，人员往来频繁，陆委会亦呼吁中共当局应该以更为积极、主动的作法来处理禽流感相关疫情的透明化问题，以免成为全世界防范疫情的缺口。
民国九十四年十一月十七日(2005.11.17)
中共国台办主任陈云林等有意申请集体来台案，海峡交流基金会继14日去函中国海峡两岸关系协会後，今天再度接受政府嘱托，致函海协会，希望海协会转告有关方面确认，尽速明确回应，以利办理後续事项。
民国九十四年十一月十八日(2005.11.18)
两岸红十字组织合作将9日高雄「祥全顺」在金门外海域生产作业时遭行驶货轮撞击遇险的船员送回台湾。
民国九十四年十一月十八日(2005.11.18)
海基会发函慰问大陆江西省九江、瑞昌等地发生强震所造成人员伤亡与财产重大损失。
民国九十四年十一月十八日(2005.11.18)
陆委会宣布两岸同意在今年春节包机的基础上，将继续开办春节包机，航线仍会飞越香港。2006年春节包机期间自1月20日至2月13日，共25天，相关安排参照2005年春节包机运作模式办理，惟大陆航点除上海、北京、广州外，增加厦门；营运班次从48班增加至72班（双方各飞36班）；承载对象除2005年所涵盖之台商负责人、员工及其眷属外，2006年扩大至持有双方合法入出境证照之台湾地区居民。
民国九十四年十一月十八日(2005.11.18)
陆委会发布新闻稿指出，中共国台办主任陈云林及国台办官员等一行61人受财团法人国家政策研究基金会邀请来台参加「两岸经贸文化论坛」一案，经内政部警政署入出境管理局所召开「大陆专业人士来台参观访问联合审查会」审查，基於「两岸关系现况」、「国际惯例」和「改善两岸关系的目的」三项因素决议不予许可。
民国九十四年十一月廿九日(2005.11.29)
台澳（澳门）通航协议前由我方台北市航空运输商业同业公会与澳门航空公司签署，其效期将於本（94）年11月29日届满，双方已於11月29日签署文件展延现行协议有效期至明（95）年5月30日，在展延期间，如果台澳双方已就新协议达成共识即可取代现行协议。
民国九十四年十一月廿九日(2005.11.29)
陆委会发布民意调查结果显示，有85.4％的民众赞成「国内各政党与中国大陆进行交流时，应优先维护台湾整体的利益」的说法。对於中共高层官员来台访问乙事，则有高达74.4％的民众认为有关人民权益的事情应该先与政府协商。此外，亦有超过半数（54.9％）的民众赞同两岸协商应由政府主导，才能更全面地考量台湾整体的利益。
民国九十四年十一月廿九日(2005.11.29)
WTO非正式团长会议讨论香港部长会议宣言草案初稿，大陆代表团提出部长会议应有单独一段文字，说明「新入会员国」享有弹性待遇，我方代表团代表林义夫发言支持大陆方面有关新入会员国待遇的建议。
民国九十四年十二月一日(2005.12.1)
陆委会主委吴钊燮宣布，政府已经核准香港文汇报记者来台驻点采访，并欢迎香港文汇报尽速完成驻点作业程序，如果还有其他香港和中国大陆媒体有申请在台驻点意愿，陆委会乐观其成。
民国九十四年十二月二日(2005.12.2)
海基会召开第六届董监事会，通过董事长张俊雄、秘书长游盈隆的续任案。
民国九十四年十二月五日(2005.12.5)
陆委会主委吴钊燮对华府媒体表示，政府正在考虑成立新的民间组织，以便与中国大陆所委托的新民间组织「海峡两岸旅游交流协会」对口，协商开放观光事宜。吴主委也呼吁，两岸在协商时，能够采取澳门模式，由政府官员坐上谈判桌来进行协商。他说，如果很多经贸议题能够透过澳门模式来协商的话，那麽我们这边是可以具体的及有弹性的，来做这些对两岸都好的事情。
民国九十四年十二月五日(2005.12.5)
海基会成立「律师志工团」，由熟悉两岸法律律师轮流值班，回答民众两岸法律问题。
民国九十四年十二月七日(2005.12.7)
依据工业总会最新调查报告显示，虽然有六成三的台商看好明年的营运绩效，但未来一年打算减资的台商首度破5%，是历年来调查罕见的现象。
民国九十四年十二月九日(2005.12.9)
陆委会黄伟峰副主委於记者会表示，根据两岸关系条例第九条之一规定，台湾地区人民不得在大陆地区设有户籍或领用大陆地区护照，若人民领取大陆地区居民证，将自动丧失中华民国台湾地区人民身分。
民国九十四年十二月十一日(2005.12.11)
陆委会主委吴钊燮表示，汕尾事件显示中国内部潜藏许多不安定因素，如果中国的社会抗争事件不断扩大，或许会影响到两岸关系，台湾必须密注意。
民国九十四年十二月十三日(2005.12.13)
「陆委会」出版《知己知彼》一书，内容涵盖大陆的社会状态、旅游游学、居住环境，以及经商投资等四大面向，希望藉此让台湾民众全面了解大陆内部的状况。
民国九十四年十二月十四日(2005.12.14)
陆委会表示，政府以「和平发展」为主轴的两岸政策并无改变，但在双方交流互动的具体作法上，仍将广纳各方意见，以符合国家总体利益之原则，来加以推动，希望中共方面不要对台湾的民意做片面与错误的解读；中共国台办主任陈云林等官员集体申请来台一事，该案政治意涵极高，应由两岸进行官方之协商，才能妥善处理本案。惟中共方面迄今不做正面回应，该申请案自无法给予许可。
民国九十四年十二月十六日(2005.12.16)
陆委会发布的民意调查结果显示，有52.3％的民众赞成应该有条件地适度开放台湾民众经「小三通」赴大陆地区，但也有50.1％的民众担心全面开放金马地区作为两岸往来的管道会影响国家安全，更有高达71.8％的民众忧虑会影响台湾对传染病的控制。
民国九十四年十二月十六日(2005.12.16)
广东省公安机关逮捕并遣返台湾重大刑事犯陈宽信及张启胜二人。
民国九十四年十二月十九日(2005.12.19)
中国国民党举办「国共经贸论坛」，内政部警政署入出境管理局召开联审会议讨论後决议，原来不予许可的处分於法并无不合，仍维持原决议，内政部将作成答辩书近日送行政院诉愿审议委员会审议，驳回国民党提起的诉愿。
民国九十四年十二月廿日(2005.12.20)
关於我国部分民间团体人士因参与WTO第6届部长会议期间之示威活动而遭香港警方拘留事，行政院大陆委员会表示，已对全程进行了解，并且於第一时间责成该会香港事务局展开协助工作，行政院谢院长随即也特别指示陆委会全力妥善处理。经多方努力後，原先被拘留的12人，已有11人先後在19日至20日凌晨陆续获释。目前台湾大学政治系学生李建诚尚被拘留，陆委会已表示会尽全力处理。
民国九十四年十二月廿三日(2005.12.23)
香港法庭裁定参与WTO第6届部长会议期间之示威活动而遭香港警方拘留之台大政治系学生李建诚可交保返台。
民国九十四年十二月廿四日(2005.12.24)
大陆海协会会长汪道涵於24日上午7时辞世，陆委会表达由衷哀悼之意。海基会亦发函海协会致意。
民国九十四年十二月廿六日(2005.12.26)
中国禽流感大流行，陆委会表示，中国当局虽然公布疫情，但公布过程都有延迟现象，是否隐匿真实疫情，已受到邻近各国及相关国际组织质疑。为因应中国大陆疫情，我政府防疫机关已拟妥「禽流感大流行防治作战动员及准备计画」，将严控疫情发展，努力保持台湾为未有禽流感疫情发生的地区。
民国九十四年十二月廿八日(2005.12.28)
海协会致函海基会，希望海基会尊重海协会长汪道涵家属有关汪会长告别仪式的意见。
民国九十四年十二月卅日(2005.12.30)
海协会致函海基会表示，受海协会汪道涵家属委托，对海基会的慰问表示谢意。