民国九十八年一月二日(2009.1.2)
海峡交流基金会董事长江丙坤表示，根据海基会与大陆海峡两岸关系协会的规划，今年上半年的协商议题仍以技术性、经贸性议题为主，暂时不会涉及政治性议题。
民国九十八年一月七日至十日(2009.1.7-10)
海峡交流基金会发布新闻稿表示，海基会董事长江丙坤率团前往深圳、东莞、广州及南京等地探访台商，并与大陆海峡两岸关系协会会长陈云林会面。
民国九十八年一月八日(2009.1.8)
海峡交流基金会与大陆海峡两岸关系协会在广州举行台商座谈会，听取台商在大陆生产经营的问题，以及对两岸经济交流合作的意见和建议。
民国九十八年一月九日(2009.1.9)
海基会董事长江丙坤会见广东省副省长万庆良时表示，为解决台商融资难题，他愿意提供台湾中小企业信保基金成立和运作机制资料，协助大陆各地方政府成立类似担保机制，解决两岸中小企业融资难题。目前已有上海、昆山愿意成立担保公司。
民国九十八年一月九日(2009.1.9)
大陆海峡两岸旅游交流协会发布公告，推出大陆居民赴台旅游新措施，将旅游团人数下限，由「十人以上」改为「五人以上」；将旅游团在台停留期间，由「不超过十天」改为「不超过十五天」。
民国九十八年一月十日(2009.1.10)
海基会与大陆海协会在南京召开长三角地区台商座谈会，了解台商对当前台资企业生产经营的情况和加强两岸经济交流合作的意见和建议。海基会董事长江丙坤、海协会常务副会长郑立中等出席。
民国九十八年一月廿二日(2009.1.22)
大陆海协会宣布，河北等12个省(自治区)成为大陆居民赴台旅游的第二批开放区域。加上首批开放的区域，大陆目前共有25个省、直辖市的居民可申请赴台旅游。
民国九十八年一月廿二日(2009.1.22)
行政院大陆委员会发言人刘德勳表示，陆委会正式授权海基会，去函海协会，表达希望协商包括金融、定期航班与陆资来台三项议题。其中金融议题方面，主要是银行、证券期货与保险监理备忘录（MOU）。
民国九十八年二月十九日(2009.2.19)
中共国台办副主任郑立中强调，三次江陈会确定由大陆举办；暂时不会触及签订CECA的问题。
民国九十八年二月廿四日(2009.2.24)
海基会发布「对综合性经济合作协议之基本态度」一文指出，目前主管机关经济部刻正根据我国产业政策发展需要，会同陆委会积极研议中，尚未形成具体的协商策略与方案，更未授权海海基会展开协商。
民国九十八年三月四日(2009.3.4)
大陆海峡两岸关系协会会长陈云林出席全国政协大会时对记者表示，由於两岸两会协商已经制度化，预计下半年将再次前往台湾与海基会董事长江丙坤进行会谈。
民国九十八年三月五日(2009.3.5)
大陆海峡两岸关系协会会长陈云林接受新华社专访时表示，要持续深化两岸交流合作、推进协商谈判。海协会将以继续完善两岸直接「三通」、推动两岸经济关系正常化为今年协商的工作重点，进而推动签定综合性经济合作协议，逐步建立具有两岸特色的经济合作机制。今年上半年，两会将就开通两岸空中定期航班、加强两岸金融合作暨建立两岸银行、证券、保险及货币领域合作机制、共同打击犯罪以及两岸双向投资问题展开协商与对话，争取上半年在大陆举办的第三次两会领导人会谈中签署一批新的协议。
民国九十八年三月六日(2009.3.6)
海峡交流基金会董事长江丙坤表示，第三次江陈会高层对话中将针对两岸经济合作架构协议（ECFA）交换意见，若取得对方同意，再讨论是否纳入第四次江陈会协商议题。目前能确定的是，将会针对共同打击犯罪与司法互助、定期航班、金融合作3项议题进行协商。
民国九十八年三月九日(2009.3.9)
海峡交流基金会举办成立18周年庆祝活动，董事长江丙坤表示，海基会未来将继续推动两岸制度性协商，希望今年上半年能完成有关两岸共同打击犯罪、司法互助，以及定期航班和金融等议题。
民国九十八年三月九日(2009.3.9)
大陆海协会会长陈云林接受中新网专访时表示，今年将以继续完善两岸直接「三通」、推动两岸经济关系正常化为协商工作的重点，进而推动签订综合性经济合作协议，逐步建立具有两岸特色的经济合作机制。根据两会制度化协商惯例，今年上半年将在大陆举办的第三次两会领导人会谈，双方初步确定此次会谈重点商谈两岸空中定期航班、加强两岸金融合作、两岸共同打击犯罪暨司法联系与协助等议题，并就两岸双向投资问题进行对话，争取签署一批惠及两岸同胞的新协议。
民国九十八年三月十二日(2009.3.12)
海基会副董事长兼秘书长高孔廉表示，第三次「江陈会」的四项议题，包括共同打击犯罪、金融合作、定期航班与陆资来台等，政府将在对等尊严、务实稳健、对台湾有利的原则及基础上，完成协商签署协议。
民国九十八年三月十七日(2009.3.17)
大陆海峡两岸关系协会会长陈云林在2009年第5期「求是」杂志，发表题为「开创两岸关系和平发展的新局面」的文章，表示，坚持大陆和台湾同属一个中国，是两岸协商谈判的政治基础，坚持「九二共识」就是坚持双方对於大陆和台湾同属一个中国的认同。有了这一政治基础，两岸双方就能够建立互信、搁置争议、求同存异、共创双赢，两岸协商就能够有效推进。「台独」分裂势力及其活动是两岸关系发展和两岸协商谈判的最大破坏力量，必须坚决予以反对和遏制。
民国九十八年三月廿一日(2009.3.21)
海基会董事长江丙坤出席「第三届海峡两岸客家高峰论坛」时指出，目前陆委会已授权海基会协商的议题有两岸金融合作签署银行、证券期货、保险监理三项了解备忘录（MOU），以及定期航班、陆资来台、两岸共同打击犯罪。
民国九十八年三月廿三日(2009.3.23)
海基会发表新闻稿表示对「综合性经济合作协议」之基本态度指出，海基会的角色，主要是联系安排工作，至於实质协商内容，则由政府相关部会官员与大陆对口部门的官员面对面直接商谈。
民国九十八年三月廿五日(2009.3.25)
海基会召开董监事会议，江丙坤董事长表示，4月开始，海基会与大陆海协会将有一连串的互动，包括海协会副会长安民将率经贸访问团来台参访，落实两会常态化交流；以及两会将举行第三次「江陈会谈」，就两岸共同打击犯罪及司法互助、定期航班、金融合作与陆资来台等四项议题进行协商。
民国九十八年四月六日至十二日(2009.4.6-12)
大陆海协会副会长安民率「海协会经贸交流考察团」抵达台湾，进行为期七天的访问。
民国九十八年四月十八日(2009.4.18)
海基会高孔廉副董事长在两会「预备性磋商」致词时表示，今年两会进行的第三次「江陈会谈」，将就定期航班、金融合作、共同打击犯罪、陆资来台四项议题进行协商。
民国九十八年四月廿五日(2009.4.25)
大陆海协会常务副会长郑立中和海基会副董事长高孔廉共同主持工作性磋商，就两岸空中定期航班、两岸金融合作、两岸共同打击犯罪及司法互助三项议题，以及大陆资本赴台投资等事宜进行最後沟通。
民国九十八年四月廿六日(2009.4.26)
第三次「江陈会谈」在大陆南京正式召开。海基会江董事长丙坤与大陆海协会陈会长云林代表双方签署「海峡两岸共同打击犯罪及司法互助协议」、「海峡两岸金融合作协议」以及「海峡两岸空运补充协议」等3项协议，双方并就共同推动陆资来台投资获致共识。
民国九十八年四月廿六日(2009.4.26)
海基会在南京会谈协议签署仪式後举行记者会，海基会董事长江丙坤表示，两岸经济合作架构协议，将来可通过两会安排，让相关部门讨论，只要两岸有共识，随时都可以作为新的两会会谈议题。而副董事长兼秘书长高孔廉则指出，关於陆资赴台投资问题，台湾方面会在未来1到2个月内公布陆资赴台的相关规定和配套措施，内容包括投资项目及投资方式。
民国九十八年五月廿六日(2009.5.26)
海基会董事长江丙坤表示，两会协商议题必须由行政院大陆委员会偕同相关部会凝聚共识，才会向大陆方面提出。因此，目前第四次「江陈会谈」仅针对避免双重课税、渔业劳务合作、农产品检验检疫、产品标准化检测与认证合作等四项议题，民众关切的互设办事处不在议题中。
民国九十八年五月廿七日(2009.5.27)
海基会公布川震重建我方捐款使用情形，去年9月12日已将政府机关所开设之「中国大陆四川震灾捐款专户」所募得的新台币12亿元，转赠大陆海协会，并指定用於「社区重建」及「校园重建」项目。海协会亦函告我方捐款使用情形，并表示我方捐款多用於校园重建，援助项目或已完成规划，或已进入施工阶段。
民国九十八年六月一日(2009.6.1)
海基会邀集大陆各地台协会长、台企负责人、政府相关部会首长等参加大陆台商端午联谊活动，行政院长刘兆玄也出席晚宴。
民国九十八年六月九日(2009.6.9)
大陆海协会理事周宁率领的大陆司法交流参访团拜会海基会，并就共同打击犯罪及司法互助的有关业务问题，与台湾方面专家进行座谈。
民国九十八年六月十六日(2009.6.16)
大陆东莞发生台商2死1重伤事件，海峡交流基金会经贸处长陈荣元表示，已去函海峡两岸关系协会请求协助，目前也正协助家属前往大陆处理後事。
民国九十八年六月廿四日(2009.6.24)
海基会江丙坤董事长在第七届董监事第三次联席会议致词时表示，对於两岸协商，总统指示应秉持「三先三後」的原则，即「先易後难、先急後缓、先经後政」，第三次江陈会谈，已将「两岸农产品检疫检验、两岸避免双重课税、两岸渔业劳务合作及两岸标准检测及认证合作」等四项议题，列为第四次会谈优先协商议题，但是若主管机关有实际需要，并且和对方达成共识，也可随时增加。
民国九十八年七月五日(2009.7.5)
海基会副董事长高孔廉率团前往青岛，进行环渤海湾的探访台商之旅，并向大陆官商界人士说明台湾开放大陆资金赴台投资方案。
民国九十八年七月九日(2009.7.9)
海基会副董事长高孔廉出席长春台协座谈会时指出，两岸在洽签双向投资保障协定前，不妨可先将过去国、共平台上的「台商权益保障工作会谈」，移往海基、海协平台，以便即时回应大陆台商需求。
民国九十八年七月十四日(2009.7.14)
海峡交流基金会董事长江丙坤率「关怀川震重建暨台商访问团」，到四川汶川地震灾区访问。
民国九十八年七月十八日(2009.7.18)
海峡交流基金会和大陆海峡两岸关系协会深圳共同举办台商座谈会，就加强两岸经济合作、协助台资企业纾困与发展，携手应对国际金融危机等问题，听取在大陆投资的部分台商和台资企业代表的意见和建议。
民国九十八年七月廿三日(2009.7.23)
海协会长陈云林出席「华晶科技新品发表会」时表示，「第四次江陈会」「地点不重要，重要的是双方共同准备好讨论的题目。」
民国九十八年七月廿八日(2009.7.28)
海协会新闻交流参访团拜会海基会，并参加两岸新闻资讯交流座谈会。海基会副董事长高孔廉在会谈中表示，两岸要进一步迈向和平发展，不仅要靠两会正式的协商机制，也要靠两岸媒体发挥正面报导的力量，才能不断扩大良性循环的效果。
国台办新闻局局长杨毅则表示，希望两岸双方本著先易後难的原则，推动两岸新闻交流实现正常化，推动尽早实现两岸媒体互设常驻机构。
民国九十八年七月廿九日(2009.7.29)
海基会董事长江丙坤表示，自从台湾公告两岸间接贸易投资办法以来，双方还有很多经贸事项需要商谈，等谈完经贸议题後，文化教育等交流是未来两岸协商的课题。
民国九十八年八月二日(2009.8.2)
由大陆国台办新闻局长杨毅所率领的海协会新闻交流参访团结束在台参访行程，返回大陆。
民国九十八年八月四日(2009.8.4)
大陆「第十八届海峡两岸关系学术研讨会」在江苏南京举行，主题为「两岸关系和平发展的机遇与挑战」。
民国九十八年八月十日(2009.8.10)
大陆海峡两岸关系协会两次致函台湾海峡交流基金会，向遭受台风「莫拉克」侵袭的台湾同胞表示诚挚慰问，并愿意根据台方需要，提供必要援助。
民国九十八年八月十日(2009.8.10)
海基会回函向海协会来函对於莫拉克台风造成我方损害表达慰问表示致谢；另并就莫拉克台风造成大陆方面之损害表示深切关怀与慰问。
民国九十八年八月十二日(2009.8.12)
大陆海峡两岸关系协会向受「莫拉克」台风影响的台湾民众捐款人民币一亿零六百万元，港币五百万元。
民国九十八年八月十四日(2009.8.14)
海基会代表政府感谢大陆海协会捐助组合屋安置灾民。
民国九十八年八月十八日(2009.8.18)
在海基会的联系协调下，大陆捐赠的首批救援物资运抵高雄。海基会发言人马绍章副秘书长表示，对於大陆方面的爱心与关心，海基会代表政府及人民表达诚挚感谢。
民国九十八年八月十九日(2009.8.19)
海基会高孔廉副董事长接见大陆海协会马晓光副秘书长，代表政府和灾区民众对大陆方面积极协助赈灾表示感谢。
民国九十八年八月十九日(2009.8.19)
大陆协会副秘书长马晓光与海基会副董事长兼秘书长高孔廉会面时表示，希望海基会进一步提出救灾物资需求，包括食品、物品、台湾救灾急需的重型直升运输机等，大陆方面将倾力提供。
民国九十八年八月廿一日(2009.8.21)
大陆海峡两岸关系协会致函台湾海峡交流基金会，告知首批三名大陆技术人员将於22日晚抵达高雄，并表示，大陆方面愿意继续向台湾受灾人民提供各类救灾物资与机械（包括民用直升机），以及通过适当渠道派遣医疗队、救援队、工程建设队赴台协助救灾及灾後重建工作。
民国九十八年八月廿三日(2009.8.23)
海基会已函告海协会组合屋检测合格，并就海协会来函对於莫拉克台风遇难民众致哀、受灾民众慰问事回函致谢。
民国九十八年八月廿四日(2009.8.24)
大陆海协会马晓光副秘书长拜会海基会，代表该会捐赠三万美元给受灾严重的高雄县甲仙乡小林村。
民国九十八年九月一日(2009.9.1)
海基会江丙坤董事长会见中共上海市委访问团，代表政府和民众对大陆方面积极协助赈灾表示感谢。
民国九十八年九月四日(2009.9.4)
海基会江丙坤董事长接见海协会理事李礼辉暨中国银行台湾金融考察团时表示，两岸金融业应加强合作；江董事长并代表灾区民众与我方政府感谢中国银行台湾金融考察团代表捐助八八水灾赈灾款新台币90万元。
民国九十八年九月十七日(2009.9.17)
海峡两岸关系协会会长陈云林在「2009南京台湾名品交易会」开幕时表示，两岸双方一直在就ECFA议题接触协商中，第4次「江陈会」只要准备好了就会谈。
民国九十八年九月廿三日(2009.9.23)
海基会江丙坤董事长於第七届董监事会联席会议致词时表示，第四次「江陈会谈」预定今年年底在我方举行，目前双方均按既定的时程进行规划，相关议题也陆续展开业务沟通。
民国九十八年十月四日(2009.10.4)
海基会江董事长在「大陆台商秋节座谈联谊会」晚宴致词时表示，年底第四次会谈即将登场，将聚焦在通商的议题上，包括渔业劳务合作、农产品检疫检验、标准检测与合作、避免双重课税等四项议题，未来两岸还有很多议题。另外最受关注的就是ECFA，如何让台湾在国际区域经济整合的潮流下免於边缘化，让台湾的产品在全世界各地有公平的待遇，这是政府积极规划推动的政策与目标。
民国九十八年十月十三日(2009.10.13)
海基会发布新闻表示，该会副董事长兼秘书长高孔廉与大陆海协会常务副会长郑立中，於10月13日在杭州，针对第四次江陈会谈的各项事宜，进行程序性的商谈。
民国九十八年十月廿八日(2009.10.28)
由江丙坤董事长率团的「海基会新闻交流团」，在北京人民大会堂会见海协会会长陈云林。
民国九十八年十一月三日(2009.11.3)
海基会副董事长高孔廉与大陆海协会常务副会长郑立中，针对第四次江陈会谈准备事宜，举行第二次程序性商谈。双方商定在本年12月下旬举行第四次江陈会谈前，并视实际需要再进行後续程序性商谈之後，循例举行正式的预备性磋商。
民国九十八年十一月五日(2009.11.5)
海协会会长陈云林在湖南衡阳，会见包括海基会副董事长许胜雄在内，参加「第五届湘台经贸交流合作会」的台商代表。
民国九十八年十一月十三日(2009.11.13)
海基会高孔廉副董事长赴台中拜会胡志强市长，感谢台中市对筹办第四次江陈会谈所提供之诸多协助。高孔廉副董事长兼秘书长并率海基会人员，赴相关场所勘察。
民国九十八年十一月十五日(2009.11.15)
基会高孔廉副董事长会见海协会王在希副会长率领的「文化教育交流团」，双方就两岸文化教育交流事项广泛交换意见。高副董事长表示，台湾在多年前提出「两岸交流、文化为先」的想法，因为两岸的经贸互补性虽然高，但文化互补性更高，在加强经贸交流同时，要多增加新闻、文化及教育的交流。
民国九十八年十二月十日(2009.12.10)
海基会副董事长高孔廉与大陆海协会常务副会长郑立中在福建福州举行海协会、海基会第四次副会长级预备性磋，商定两会领导人第四次会谈於12月21日至25日在台中市举行；并对第四次「陈江会」议题及协议交换意见。
民国九十八年十二月十日(2009.12.10)
海协会常务副会长郑立中在第四次副会长级预备性磋商中表示，海协会将向海基会转交3亿元人民币捐款，用於台湾灾区的桥梁、学校等公共活动设施重建。
民国九十八年十二月十七日(2009.12.17)
海基会江董事长在第四次「江陈会谈」会前记者会表示，第四次「江陈会谈」的意义，可以用「对等协商，为民谋福，完善环境，永续发展」来形容。
民国九十八年十二月十八日(2009.12.18)
大陆海协会会长陈云林表示，两会领导人在台湾举行的第二次会谈，标志著两会制度化协商机制已日渐成熟完善。两会协商在大陆和台湾轮流举行，充分体现了海协会与海基会是平等协商、互相尊重、善意沟通的。也表示，商签两岸经济合作框架协议是一个单纯的经济问题，旨在促进两岸经济共同发展，提升两岸同胞共同福祉，实现互利双赢，不涉及任何政治敏感问题。我们愿意通过两会启动专家级的协商，我们也充分尊重台湾方面的意见。
民国九十八年十二月廿一日(2009.12.21)
海基会高孔廉副董事长在两会预备性磋商致词时表示，对於未来两岸协商，有三个希望，「希望」双方能搁置争议，务实协商，不要过度政治化的引申；「希望」大陆能发挥仁者智慧，充分尊重台湾人民的想法；也「希望」大陆考量两岸规模的差异，处处从大处著眼。
民国九十八年十二月廿二日(2009.12.22)
第四次两岸两会领导人会谈签署「海峡两岸农产品检疫检验合作」、「海峡两岸标准计量检验认证合作」、「海峡两岸渔船船员劳务合作」等3项协议，累计两会共签12项协议，达成1项共识。
民国九十八年十二月廿二日(2009.12.22)
海峡交流基金会董事长江丙坤在第四次「江陈会谈」成果说明会表示，现阶段两岸协商落实推动两岸关系「先经後政、先急後缓、先易後难」的原则，让两岸的交流与互动可以在更坚实的制度基础上继续往前迈进。有关两岸避免双重课税及加强税务合作议题，将尽速透过两会安排後续协商，以便适时达成协议，完成签署；「两岸经济合作架构协议（ECFA）」列为下次会谈重要推动的议题；另外，「智慧财产权保护」也列为第五次会谈的协商议题。
民国九十八年十二月廿二日(2009.12.22)
大陆海峡两岸关系协会会长陈云林在会见行政院大陆委员会赖幸媛主任委员时表示，当前及今後一段时间，经济议题仍将是两会商谈的重点。海协会愿与海基会一起，在推进两岸经济合作的同时，逐步增加文化、教育、新闻、科技交流议题的内容。