內政部入出國及移民署定於96年1月2日成立，該署最重要的任務為對外籍及大陸配偶之輔導，在認知上外籍或係大陸配偶，均為台灣社會之一份子，如何使其順利融入台灣社會，適應在地生活，是當前政府積極努力之目標。
該署將強化對新移民之照顧與輔導，如何落實外籍與大陸配偶照顧輔導措施，該署列為重點工作之一，將依生活適應輔導、醫療優生保健、保障就業權益、提昇教育文化、協助子女教養、人身安全保護、健全法令制度及落實觀念宣導等重點工作及具體措施，積極辦理，並透過政府及民間資源的整合，建構多元照顧輔導措施，使新移民順利適應我國社會，與國人共創美滿婚姻生活。
內政部也定期檢討各相關機關執行情形，落實使新移民能迅速融入我國社會，加強辦理職業訓練與輔導，保障新移民就業權益，協調相關社政機構，提供適時社會扶助措施，保障人身安全，強化新移民之自主性，以確實保障新移民之人權；另外該署也將積極加強宣導國人抱持「和諧共存、文化學習」態度以及「尊重包容」的胸襟，幫助新移民們順利在台灣落腳生根，讓新移民為台灣社會注入多元新文化。
內政部部務會報通過修正「大陸地區人民在臺灣地區依親居留長期居留及定居數額表」（草案），草案中之依親居留數額每年為12,000名，相較於舊制配額每年約7,200名（每年3,600名加上排配超過4年者約3,600名），新制比舊制數額多出5,000名，顯見新制較舊制更為寬鬆，惟該草案尚須送行政院大陸委員會委員會議討論後，報請行政院核定後才據以施行。依據近三年統計結果，每年依親居留申請件數平均為13,000件，扣除申請要件不符者，新制每年依親居留數額訂為12,000名尚屬合理，且應符實際需求，大陸地區配偶依親居留新制，已充分考量大陸地區配偶之需求，爾後將視社會經濟狀況定期檢討數額之合理性，適時加以調整。至於長期居留階段，與工作權有關，並無設限之規則，亦即不限數額。