民國九十七年一月一日(2008.1.1)
陳水扁總統主持開國紀念典禮時指出，「中華人民共和國憲法」序言，明確表示：「台灣是中華人民共和國神聖領土的一部分。」對岸不但堅決否定「中華民國」的存在，更極力打壓、封殺台灣做為一個主權國家應有的國際地位與生存空間。過去的7年多，中國部署在海峽對岸的戰術導彈，最新的數字也已增加到1328枚。中國解放軍並已完成「對台作戰三階段任務準備」，近日更研議在台灣海峽劃設「防空識別區」及在海峽中線西側劃定新的航線，一再挑戰台海的現狀，企圖片面改變台海的現狀。
民國九十七年一月一日(2008.1.1)
行政院大陸委員會針對陳總統元旦談話，對北京當局提出五點呼籲：
一、我們呼籲中國共同促進兩岸和平與發展，攜手推動兩岸關係正常化。
二、我們呼籲北京當局移除「一中框架」之政治障礙，展開兩岸和平對話與促進兩岸發展。
三、我們呼籲北京當局記取教訓，不要恐嚇台灣民主與威脅國際和平。
四、我們呼籲北京當局立即停止對台灣武力威脅與片面改變台海現狀之挑釁作為。
五、我們呼籲北京當局停止政治考量，儘速恢復多項兩岸經貿事務性議題的談判。
民國九十七年一月一日(2008.1.1)
行政院大陸委員會針對有關大陸觀光客吳亞林尋求台灣政府提供政治庇護，特發布新聞稿表示，大陸人民以觀光事由來台，如須延長在台停留時間，依大陸地區人民來台從事觀光活動許可辦法，於合法停留期間內，訂有得延期之相關規定。另當事人主張政治庇護，涉及相關機關權責，須由相關機關會商認定。
民國九十七年一月二日(2008.1.2)
陳水扁總統接受法國「法蘭西24（France 24）國際新聞台」駐北京特派員Sebastien Le Belzic專訪時表示：以台灣的名義加入聯合國，要進行公民投票，不但是台灣民主鞏固深化非常重要的一部分，它所代表的是非常重要的民主價值與基本人權，要在台灣這塊土地上能夠更進一步深耕與茁壯。也顯示台灣是一個主權國家，台灣絕對不是中國的一部分，也不是中華人民共和國的一省，或者是她的地方政府。並強調，兩岸要接觸、對話、協商，首先中國必須要尊重台灣是個主權國家的事實與現狀；其次，中國必須要尊重2,300萬台灣人民的自由意願與選擇；再者，任何的爭端與分歧都必須要透過和平方式來解決，絕不可訴諸武力或其他非和平手段；最後，有關兩岸協商必須要基於對等地位，不能有一大一小，或北京當局是中央政府、而台北方面只是地方政府，這樣一個不對等的談判與協商也是無法簽署兩岸和平協議的。
民國九十七年一月八日(2008.1.8)
行政院大陸委員會陳明通主任委員於年終記者會宣布，為維護來台依親中國配偶的工作權及家庭收益，將以「身分從嚴、生活從寬」原則研議放寬工作限制，讓中國配偶可以經由獲得工作維持家庭生計。
民國九十七年一月十日(2008.1.10)
行政院大陸委員會童振源副主委出席港澳觀選團選前座談會致詞時表示，中國當局一再經由媒體進行無理的謾罵，並蠻橫的與「法理台獨」劃上等號，全盤否定全體台灣人民意志的展現。而以台灣名義加入聯合國的民主公投，更與改變國號或修憲無關，也沒有違背陳總統所作「四不」的承諾，中國當局卻一再給予嚴厲的打壓，一方面奢言「寄希望於台灣人民」，一方面卻又不斷以極其卑劣的方式打壓台灣的國際生存空間，正凸顯其兩岸政策思維的荒謬與不理性。
民國九十七年一月十一日(2008.1.11)
行政院大陸委員會陳明通主任委員參加「2007兩岸交流印象獎」頒獎典禮時表示，為了突破政治瓶頸，唯有推動兩岸關係正常化，亦即國家定位正常化，相互承認對方的存在，如此不管是貨幣清算機制、兩岸監理機制的簽訂與談判，都不再是問題。未來不論誰執政，北京當局都得面對這個政治議題的解決，尋求兩岸關係的正常發展。
民國九十七年一月十三日(2008.1.13)
行政院大陸委員會劉德勳副主委於記者會指出，對於兩岸三通直航的部分，陸委會持續在做，包括開放小三通、春節包機以及節慶包機等，其中「節慶包機」有10週是可以飛往大陸，因此台灣飛機一年內有五分之一的時間，是可直接往返大陸。開放兩岸直航需要很多配套措施，例如開放之後，台灣總體經濟、產業的協助等效益，以及開放後對台灣的影響甚深，因此需要進行詳細的評估。
民國九十七年一月十三日(2008.1.13)
行政院大陸委員會發布新聞稿，呼籲國際社會共同督促中國信守對於香港普選權的承諾。陸委會表示，民主是普世價值，對於任何地區追求民主的活動，國際社會的任一份子都有權也應該加以關心；陸委會同時指出，香港全面普選的落實，不僅有助於強化香港特區政府的管治能力，也可作為中國推動民主普選的試點，中國當局如果再以任何藉口推延香港普選，將喪失民心，自毀國際信譽，陸委會特別呼籲國際社會持續關切香港民主進程的問題。
民國九十七年一月十五日(2008.1.15)
陳水扁總統在瓜地馬拉參加僑宴致詞時表示，中國對台灣的軍事威脅和外交打壓隨著其經濟力量的成長，變本加厲，無所不用其極。但我們不能任人欺負，我們要用公投票作為台灣加入聯合國最大的推力，用公投、用直接民主的方式勇敢地向全世界、向中國表達我們的聲音。
民國九十七年一月廿一日(2008.1.21)
行政院大陸委員會陳明通主任委員表示，陸委會正在研擬開放中國旅客來台觀光模式，規劃開放中國旅客以搭乘國際觀光郵輪方式，經第三地來台旅遊。
民國九十七年一月廿二日(2008.1.22)
針對中國操作世界衛生組織（WHO）執委會議事程序，未經充分討論即蠻橫封殺將我納入國際衛生條例（IHR）範疇乙案，行政院大陸委員會發布新聞稿指出，中國不斷濫用政治暴力，對國際組織予取予求，粗暴打壓台灣的國際生存空間。在事涉台灣2,300萬人民及全球衛生健康權益至巨的WHO中，中國誆稱照顧台灣人民健康，除每年阻撓我提出之參與案外，私下與WHO簽定瞭解備忘錄限制台灣與WHO的接觸，更在近期藉由去年6月正式施行的IHR，對我進行新一波的政治壓迫，包括延宕通報9月份泰國毒玉米筍的食品安全事件，要求WHO不得直接與我方相關單位聯繫，枉顧我民眾生命安全及健康權益。12月更操作在IHR相關文件中將台灣八港口納入中國境內，再次暴露中國處心積慮矮化台灣主權地位的蠻橫行徑。
民國九十七年一月廿二日(2008.1.22)
行政院大陸委員會劉德勳副主任委員發布「我應積極推動『難民法』立法，落實人權立國理念」專文指出，近年來大陸人民以未經許可入境方式來臺尋求庇護，係以個案查證是否確有參與大陸民主運動之事實，並參照聯合國1951年難民地位公約、各國立法例及我國「難民法」草案之意旨，作妥適之處理。
民國九十七年一月卅日(2008.1.30)
針對中國暴風雪災情及對台商可能影響，行政院大陸委員會發布新聞稿指出，根據我方瞭解，部分在大陸台商已因為這次雪災造成產品生產、運輸及供銷上的影響，整體受災狀況仍在掌握中。陸委會表示，我政府單位已針對相關情況進行處理與因應，並密切關注我台商、台生等在中國受災的情況。陸委會呼籲中國方面應對在大陸的我方人民進行必要協助與支援。
民國九十七年二月三日(2008.2.3)
行政院大陸委員會陳明通主任委員嚴詞駁斥中國中台辦、國台辦對我舉辦入聯與返聯公投之惡意批判與威脅。陳主委鄭重強調，中國當局誆稱「兩岸之間的矛盾和分歧，完全可以在兩岸關係和平發展過程中，通過平等協商加以解決」。但八年來，在我方不斷積極釋出善意要求下，北京當局仍舊強硬堅持「一個中國原則」前提框架，拒絕與我進行對等協商，中國對我公投的批判，只是再次驗證其眛於兩岸現實及台灣民意反應，企圖以製造與我協商的謊言與假像，誤導國際視聽及台灣內部情勢發展。
民國九十七年二月四日(2008.2.4)
行政院大陸委員會發言人劉德勳在記者會宣佈，自1月28日起，放寬中國籍配偶在申請定居時，所需檢附財力證明的種類，未來中國籍配偶除依據原有規定的「相當財產足以自立或生活保障無虞」證明文件外，專業技能證明、同住家屬收入總額或是台灣籍配偶相應不動產等，也能作為證明。
民國九十七年二月四日(2008.2.4)
行政院大陸委員會公佈「2007年兩岸關係各界民意調查綜合分析」指出，在台灣民眾的感受中，北京當局對台灣政府及台灣人民都是不友善的。去年底，民眾認知中國對我的敵意態度更達到新高。此外，中國軍事力量的擴張及制定「反分裂國家法」等作為，絕大多數的民眾亦認為是對台灣敵意的表現。調查顯示，如何透過交流互動追求台海的和平與穩定，是台灣民眾對發展兩岸關係的主要目標與期待。
陸委會表示，有關國家前途與定位的看法，絕大多數民眾都同意「台灣是一個主權獨立的國家」、「台灣的未來應由台灣人民自己決定」、「台灣不是中華人民共和國的一部分」，也認為「中共沒有權利過問及干預台灣內部事務（如正名、憲改等）」。七成以上民眾支持「以台灣名義加入聯合國」，而大多數民眾都不滿中國對台灣的外交打壓，並認為中國應承擔搶奪我邦交國造成兩岸關係惡化的責任。
陸委會表示，中國設定「一個中國」原則作為處理兩岸問題的前提條件，無法為台灣主流民意所接受。民調也顯示，民眾普遍認為兩岸目前不對稱的資金與人員流動是不正常的現象。
民國九十七年二月五日(2008.2.5)
行政院大陸委員會發布新聞稿，對於新加坡「海峽時報」中國首席特派員程翔先生，獲得中國方面提前釋放乙事表示歡迎，陸委會也表示，與程先生同樣因為新聞採訪或爭取言論自由，而遭受到中國方面監視、軟禁、秘密拘捕與不公開審判的人士為數仍多，尚需國際各界共同關注。
民國九十七年二月十四日(2008.2.14)
陳水扁總統出席「2008年大陸台商春節聯誼活動」致詞時表示：今年1月1日中國開始實施「企業所得稅法」和「勞動合同法」，使得台商的生產成本大幅增加，台商有必要及早做好升級與轉型的規劃。現在也是台商分散經營風險，考慮回台加碼投資的最好時機，為協助台商的回流，政府已成立「促進台商回台投資專案小組」，做為提供投資資訊、開發投資機會、申請投資優惠及排除投資障礙等服務的窗口。我們竭誠歡迎我們台商朋友重新投資台灣、加碼台灣，將營運、研發、創新及高階的生產留在台灣，真正做到「深耕台灣、佈局全球」的目標。
民國九十七年二月十四日(2008.2.14)
行政院張俊雄院長出席「大陸台商春節聯誼餐會」致詞時表示，政府為協助台商面對當前經濟的困境，已指示經濟部成立「台商投資回台服務辦公室」。而他在擔任海基會董事長期間，特別也指示海基會相關部門將幫助台商回國投資列為重點工作，以加強為台商服務。張院長指出，台商朋友所關心的資金、土地、勞工等問題，行政院相關部會也提出很多幫助企業經營的新措施。
民國九十七年二月廿日(2008.2.20)
行政院大陸委員會陳明通主任委員受訪時表示，政府儘可能放寬小三通適用對象，但無法全面開放、不限身分開放，擴大小三通的政策重點，應是如何讓金馬人民受惠才是關鍵。
民國九十七年二月廿二日(2008.2.22)
陳水扁總統接見出席「中國人權與2008奧運國際論壇」外賓致詞時表示，台灣的民主發展經驗，絕對可以提供給中國人民最好的希望與典範，台灣的政府與人民，也願意盡最大的努力來促進中國的民主化。唯有中國真正轉型成民主的國家，區域的和平才有希望，台灣與中國的關係才能真正得到解決，世界的和平也才有可能。
陳總統也表示，希望中國政府不僅是主辦一場奧運盛會，也不是透過舉辦奧運的理由，來整肅、逮捕異議份子，而是藉由這個機會，真正改善人權、實踐奧林匹克的和平精神與公平和諧的運動家風範。
民國九十七年二月廿六日(2008.2.26)
陳水扁總統出席「眾神護台灣、加入聯合國」活動致詞時表示，公民投票是鞏固和深化台灣民主很重要的一步，不管是「入聯」、「返聯」，或者是兩案都過關，這絕對是台灣人民和台灣民主最偉大的勝利和成就。如果因為分裂投票致使兩案都沒過關，會向全世界傳達一個非常嚴重錯誤的消息，讓國際社會誤會，台灣人民對加入聯合國、對捍衛自己的基本人權完全不重視。
民國九十七年二月廿六日(2008.2.26)
陳水扁總統接見美國企業研究院(AEI)「台灣政策工作小組」共同主席薛瑞福（Randall Schriver）及卜大年（Dan Blumenthal）時表示，台灣要參與WHO、要參與UN，當然會涉及到主權的問題，但這也是台灣2300萬人民的衛生人權、政治人權、集體人權，只談人權而不談主權，是不可能的事情。一樣的道理，我們談台灣的外交處境、台灣的國際空間，也沒辦法避開主權的討論，因為外交的核心就是主權。所以，除非台灣放棄自己的國家主權，或者矮化、地方化我們的國家主權，否則台灣要在中國的壓力、杯葛、阻擋之下，要有怎麼樣一定的外交空間，那是緣木求魚的事情。
民國九十七年二月廿六日(2008.2.26)
陳水扁總統出席「97年工商團體春節聯誼會」活動致詞時表示，為鼓勵台商回流，投資台灣、加碼台灣，政府已成立「促進台商回台投資專案小組」，做為提供投資資訊、開發投資機會、申請投資優惠及排除投資障礙等服務的單一窗口。行政部門將儘速研議讓更多台商能補辦報備和登記的積極性寬免方案。只要台商願意回台投資，在現有法規基礎上，可以做更彈性的規定，考量在一定違規投資金額內，有意願回台投資的台商，可以從輕處理。
民國九十七年二月廿七日(2008.2.27)
行政院大陸委員會陳明通主任委員接受媒體訪問時表示，「選舉包機是一個新的議題，勢必跟北京重新談判」。如果對岸真正有誠意，就趕快恢復三項議題（客運包機、貨運包機、觀光）的談判，因為技術問題已談完，若能趕快進行，台商就可以搭包機回台投票。陳主委同時強調，應更考慮的是台商每日的生活，所以客貨包機、觀光客應趕快談成。
民國九十七年三月三日(2008.3.3)
陳水扁總統接受公共電視「台語晚間新聞」專訪時表示，民主就是台灣的未來、台灣的命運，應該由2300萬台灣人民才有權利來作主，不能由任何國家、任何政黨、任何政權替台灣人民做決定。公民投票就是直接的民主、真正的民主，就是2300萬台灣人民應該有權利與自由，透過公投的民主程序來向世界發聲。
民國九十七年三月四日(2008.3.4)
行政院大陸委員會發布新聞稿重申，台灣為主權獨立國家，國號為中華民國，台灣主權屬於台灣2300萬人民，決不接受中國片面所提「一個中國原則」的兩岸定位及政治框架，也絕不接受在此一前提框架下任何非對等的方式發展兩岸關係。並呼籲中國應立即停止對台武力恫嚇及國際打壓，務實地面對中華民國的存在，並儘快恢復各項議題的協商與溝通，更不應誤判台灣民意及兩岸情勢發展、妄圖破壞、干預台灣民主過程，否則中國勢將為自己錯誤決策與作為負擔嚴重後果。
民國九十七年三月五日(2008.3.5)
行政院長張俊雄在行政院院會中裁示，為讓未向政府申請或補辦許可的台商能夠適時返回台灣投資，經邀集相關單位研議後，決定再次推動台商補辦許可措施，以追求台灣經濟與大陸台商的雙贏。本次補辦許可作業，特別採取突破性的作法，在行政權限範圍內，由主管機關在常態化台商罰鍰及補正許可作業的架構下，對於願意回台補辦許可的大陸台商僅處以象徵性的罰鍰，以快速、有效且有力地回應大陸台商需求。
民國九十七年三月五日(2008.3.5)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，中國官方近期以來對台論調反映其企圖影響我即將舉行的選舉及公投的發展，更企圖對我選後兩岸關係互動模式先行劃定框架與方向。陸委會表示，兩岸應在不預設任何政治條件下，儘速恢復互動與對話是我方一貫立場，但中國片面設置「一個中國原則」政治前提及未來「一國兩制」的終局框架，早已悍然納入「反分裂國家法」的條文，不會改變，所謂平等協商只是流於空談。
民國九十七年三月六日(2008.3.6)
陳水扁總統參加「眾神護台灣，加入聯合國」繞境活動致詞時表示，我們共同的盼望是不再作國際孤兒、我們要成為聯合國的會員、成為國際社會的一員，因為如果我們不是聯合國的會員，我們不能參加聯合國附屬機構所造成的問題很多，包括聯合國海洋法公約不能簽署、不能加入教科文組織、世界衛生組織等等，不僅出海捕魚漁民的生命財產權益不能得到保障，我國世界第一級的文化遺產無法登記為人類文化遺產、嚴重衝擊國人醫療衛生，讓國人多付出生命與健康的代價、也影響我國的經濟。因此我國要加入聯合國不是僅為了政治因素，也是為了我國漁民權益、文化議題、醫療衛生及經濟發展。
民國九十七年三月七日(2008.3.7)
陳水扁總統接受日本「朝日新聞」國際版主編市川速水(Ichikawa Hayami)專訪時表示，中共認為兩岸要對話、要協商，就必須接受北京當局設定的前提，這樣就不是真正的對等。過去我們提出兩岸對話協商的四原則，包括主權、民主、和平、以及對等。
民國九十七年三月七日(2008.3.7)
陳水扁總統接見「歐洲議會對中國關係代表團」團長史特克斯(Dirk Sterckx)時表示，入聯公投並非所謂的「法理台獨」的公民投票，而是希望藉由公投的民主程序，向全世界發出臺灣希望成為聯合國大家庭一員的心聲與期待，也向全世界說明2300萬台灣人民在聯合國的代表權，絕非中國所能代表或取代；尤其「反分裂國家法」通過即將屆滿3週年的前夕，公投更可表達台灣反對中國希望藉由威嚇或武力方式，達成將台灣併吞為中華人民共和國的地方政府、地方行省的意圖。
民國九十七年三月七日(2008.3.7)
經濟部完成「違法在大陸地區從事投資或技術合作案件裁罰基準」及「在大陸地區從事投資或技術合作審查原則」之修正作業，大陸台商回台補辦許可將自3月10日開始受理申請。
民國九十七年三月十二日(2008.3.12)
行政院張俊雄院長在院會提示，同意開放國內銀行的OBU及海外分支機構可以辦理大陸地區境內交易所產生之應收帳款收買業務，並得將其辦理授信業務的對象，擴及第三地區法人在大陸地區的分支機構。同時在維持OBU及海外分支機構對大陸台商授信不得逾其資產淨值合計數之30％的上限比率之餘，為擴大其辦理授信業務之彈性空間，不須區分有、無擔保，授信風險由銀行自行控管。
民國九十七年三月十二日(2008.3.12)
行政院大陸委員會陳明通主任委員於海基會「兩岸人民急難服務中心」成立大會致詞時表示，海基會在處理民眾在大陸旅行，以及大陸人士來台觀光發生的急難案件上，展現可觀的績效，並累積寶貴的經驗。而「兩岸人民急難服務中心」的成立，為完善兩岸急難救助工作大步邁前的重要里程，有助兩岸急難救助工作，並為未來兩岸推動常態化、制度化的急難協處機制，開啟契機。
民國九十七年三月十三日(2008.3.13)
陳水扁總統以「給民主一個機會－用公民投票為台灣加油」為題在自由時報發表專文表示，即將舉行的「入聯」與「返聯」公投，不但是一次向全世界發聲，表達台灣人民渴望加入聯合國、積極參與國際社會的決心與意志，同時它更是一次「反戰爭、反侵略、反併吞」的公民投票。
民國九十七年三月十四日(2008.3.14)
行政院大陸委員會發布「大陸配偶在臺逾期停居留處置方案之新聞參考資料」指出，為保障兩岸婚姻家庭團聚權益，陸委會已會同相關機關研議完成大陸配偶在臺逾期停居留處置方案，准予逾期停居留之大陸配偶申請辦理延期。本處置方案業經行政院核定，將由移民署訂定相關處理要點後，於近期公告實施。
民國九十七年三月十四日(2008.3.14)
行政院大陸委員會陳明通主任委員指出，「一法兩公報」是台灣人民命運的鎖鍊。陸委會指出2005年3月14日中國政府通過「反分裂國家法」，片面界定兩岸關係現狀，以「中國內戰遺留問題」的說法，企圖否定台灣與中國互不隸屬的現實，同時更設定將以「非和平」方式，做為解決台海問題的選項。北京在通過「反分裂國家法」後，就邀請在野黨主席訪問中國，並推出「連胡」與「連宋」兩個公報，形成「一法兩公報」的新對台框架，企圖逐步完成統一臺灣的最高戰略目標。
民國九十七年三月十五日(2008.3.15)
行政院大陸委員會針對中國以武力鎮壓西藏抗爭活動，代表中華民國政府發表強烈譴責。陸委會指出，中國以軍警、坦克對付和平示威的西藏人民，造成嚴重衝突與傷亡，再次印證中國惡劣的人權紀錄，中國強硬蠻橫行徑只讓台灣人民真正認清，北京專制政權絕對不會以「和平」方式處理兩岸問題。
民國九十七年三月十八日(2008.3.18)
對於中國總理溫家寶提到中國反對台灣入聯公投一事，陳水扁總統表示，台灣不是中國的一部分，更不是中華人民共和國的一省，中華人民共和國與台灣是各自獨立、互不隸屬的國家，這是事實、也是現狀，中華人民共和國從來沒有統治過台灣一天。台海的現狀就是台灣是一個主權獨立的國家，不是中國的一部分。
民國九十七年三月十八日(2008.3.18)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，中華民國是一個民主、自由、獨立的國家，主權屬於台灣2300萬人民，而台灣的前途也只有台灣2300萬人民有權決定。中華人民共和國從未擁有對台灣的主權，中國政府自然也無權干預、決定台灣的政治地位，大陸的13億人民也無權共同決定台灣的前途與命運。 並重申，政府願在總統大選後就雙方共同關切的議題進行平等協商，但不能接受中國單方面設定的「一中」前提。這是我們一向堅持的立場，希望北京當局徹底移除「一中」框架，儘速恢復目前停滯中的各項議題協商。
民國九十七年三月十九日(2008.3.19)
行政院張俊雄院長在行政院院會中裁示，將春節「小三通」返鄉專案常態化，未來只要是經大陸台商協會出具證明，在大陸地區投資事業的負責人與聘僱員工，及其配偶與直系親屬，都可以經「小三通」往來兩岸。院長也表示，院會也通過試辦「小三通」相對旅遊方案，大陸地區人民到金門、馬祖旅遊人數，初期將以現行配額每日總計680人為目標，並在此一基礎上相對開放同等數額的台灣地區人民在金門、馬祖停留後轉赴大陸觀光旅遊，若實施成效良好，再逐步擴大配額。
民國九十七年三月廿日(2008.3.20)
陳水扁總統接見各國來台觀選團致詞時表示，兩岸關係的最大癥結，在於中國無法承認台灣是主權獨立國家的事實，除一再於聯合國及其他國際舞臺宣稱台灣為中華人民共和國的一部分或一省之外，也自稱可以在聯合國代表2300萬的台灣人民，並刻意向國際社會誤導、曲解聯合國2758號決議文。這是台灣2,300萬人民不分黨派、不分顏色所無法接受的，而中國的說法不但與事實不符，美日歐盟等民主國家也紛紛表達無法接受之意。
民國九十七年三月廿日(2008.3.20)
陳水扁總統接見美國戰略暨國際研究中心(CSIS)觀選團成員時表示，中國領導階層推動兩岸和平協議的簽署，是有條件的，就是要台灣接受一個中國的原則，如果這樣，簽署兩岸和平協定絕對是緣木求魚。從最近中國血腥鎮壓西藏無辜的人民，相信更多的台灣人民愈來愈沒辦法相信，與中國簽訂所謂的和平協定真的可以帶來台海的永久和平。
民國九十七年三月廿日(2008.3.20)
行政院大陸委員會陳明通主委出席行政院新聞局舉辦之國際媒體來台觀選記者會時表示，從西藏事件觀之，北京並不會因為舉辦奧運、經濟崛起，就放棄以武力解決紛爭，國際社會應正視中國的非和平崛起及軍力的大幅擴張，具體要求中國停止使用武力，以保障並維護人權自由與區域和平安全。
民國九十七年三月廿七日(2008.3.27)
行政院大陸委員會發布聞稿，感謝美、日、英、德、加及歐盟等國際社會，對台灣選舉的民主成就及兩岸關係良性發展的期許，給予正面肯定與支持，並呼籲中國政府必須正視台灣的民主體制，承認中華民國存在的事實，在「對等、尊嚴、互惠」的原則與既有的協商基礎下，排除片面設置的政治前提障礙、撤除對台飛彈部署及國際生存空間的擠壓，積極、務實與我建構兩岸實質對話與交流互動的平臺，進而創造兩岸良性互動之契機。
民國九十七年三月廿八日(2008.3.28)
陳水扁總統接見美國在台協會理事主席薄瑞光（Raymond F. Burghardt）時表示，「九二共識」是不存在的，北京不但反對「一中一台」，也反對「兩個中國」，未尊重台灣或中華民國為主權國家，也未同意「一中」用以指稱「中華民國」。
民國九十七年四月二日(2008.4.2)
行政院大陸委員會陳明通主任委員表示，開放人民幣在台灣全面兌換必須簽訂清算機制，涉及政治因素，困難度相對高一點，但我方已做好準備。只要中國確定開放觀光客來台旅遊，雙方簽訂相關協議，在完成兩岸人民關係條例第38條的修訂後，就能實現人民幣局部兌換措施。
民國九十七年四月四日(2008.4.4)
行政院大陸委員會發言人劉德勳副主任委員在記者會表示，根據當初兩岸透過委託協商單位所達成的協議，兩岸包機型態只有四種，分別是節慶包機、貨運包機、醫療包機與人道包機。週末包機並不在這四項專案包機範圍內，而當初協議上明文規定，將來若有任何調整都必須透過協商處理。
民國九十七年四月六日(2008.4.6)
行政院大陸委員會陳明通主任委員表示，新華社日前談及九二共識時，出現中英文版本不同的情形，顯示中國的一個中國政策是內外有別，而除非中國在國際場合正式承認一中各表，確實面對中華民國存在，兩岸的政治僵局才能有解。
民國九十七年四月七日(2008.4.7)
行政院大陸委員會於委員會議就「擴大『小三通』規劃方案」法規修正及執行事宜之辦理情形提出報告，陸委會指出，「擴大『小三通』規劃方案」所涉相關配套措施均已完備，相關措施已自本年4月1日起執行，將於實施一段期間後，視實施成效適時進行檢討。
民國九十七年四月十日(2008.4.10)
陳水扁總統主持國安高層會議，就推動我國參與「世界衛生組織」（WHO）作出裁示強調，2300萬台灣人民生命與健康的基本人權不應該被剝奪。台灣人民有權要求以平等的身分參與WHO相關的機制、會議與活動。成為WHO的會員是全民共同的期盼，也是朝野一致的共識，這個目標不能夠輕言棄守，但是在未能入會之前，政府也將極力爭取台灣能以觀察員的身分出席WHO大會。
民國九十七年四月十二日(2008.4.12)
行政院大陸委員會陳明通主任委員，對副總統當選人蕭萬長先生與中國國家主席胡錦濤會面乙事指出，未來兩岸協商互動應堅持在不設任何前提之情況下進行，才能維護台灣辛苦得來的民主成就、國家應有的主權尊嚴，及台灣2300萬人民之福祉，進而達到兩岸互惠、互利及雙贏的局面。未來各項議題的協商與推動，都應在政府規劃及評估的既有基礎下具體推動，兩岸間任何人都不應排除政府公權力的參與，私下進行協商。
民國九十七年四月十三日(2008.4.13)
陳水扁總統出席凱達格蘭學校第五屆校友大會時表示，兩岸對話、協商必須秉持「主權、民主、和平、對等」4大原則，才可能符合台灣人民的利益。然而，中國對台灣所持的是「五化政策—矮化、地方化、邊緣化、去主權化與去政府化」，從這點來看博鰲論壇與胡蕭會，值得關注。
民國九十七年四月十五日(2008.4.15)
陳水扁總統視導海軍陸戰隊致詞時表示，對岸中國從來不放棄以武力犯台遂行併吞台灣的野心，19年來，每年的軍事支出都以兩位數字大幅成長，台海軍事的均衡不但已向中國傾斜，而中國迅速的軍備擴張也已經超過其自身防禦之所需，朝向區域軍事霸權的地位而邁進。總統並指出，歡迎並支持任何有助於台海和平、安全與穩定的作為，但更堅信強大的自我防衛能力而非寄望敵人片面的善意，才是捍衛與確保台海永久和平唯一的屏障與基礎。
民國九十七年四月十七日(2008.4.17)
陳水扁總統接見來台出席「台灣主權地位」國際研討會外賓時表示，海峽兩岸，台灣與中國，或中華民國與中華人民共和國，一邊一國，彼此是兩個各自獨立、互不隸屬的主權國家，絕非一個分裂、分治的中國。而兩岸關係的正常化，必須堅守「主權、民主、和平、對等」四大原則。對於主權的爭議不能自我設限、自我矮化，而變成實質擱置主權、放棄主權。
民國九十七年四月十八日(2008.4.18)
行政院大陸委員會企劃處張良任處長接受採訪時表示，因應當前中共利用各種手段，對台實施軍事、外交、經濟、文化等心理層面的分化與降低敵情意識，我方不能輕忽中共心理戰對國人製造多元與分歧的影響，而「反三戰」即是在強化全民國防意識，透析中共各策略背後陰謀的反制手段，使國人認清中共企圖，建構堅實的心理防線。
民國九十七年五月十三日(2008.5.13)
陳水扁總統對中國大陸四川汶川地區發生的震災表達關切之意，並表示台灣身為國際社會的一份子，願意秉持「人飢己飢、人溺己溺」的精神，配合國際社會積極投入救災與重建的行列。
民國九十七年五月十三日(2008.5.13)
行政院大陸委員會陳明通主委說明統籌協調四川震災協助情形持表示，會積極地進一步暸解四川台商情況，海基會也發動台商協會及全聯會等團體進一步協助救援。我方也向海協會表達我方願促請台灣搜救人員前往協助的意願。只要對方同意我方搜救人員前往，願意用包機方式，讓國內救援團體可以直飛四川協助災區的受困民眾。
民國九十七年五月廿日(2008.5.20)
中華民國第12任總統馬英九在就職慶祝大會以「人民奮起，台灣新生」為題，發表就職演說呼籲，兩岸不論在台灣海峽或國際社會，都應該和解休兵，並在國際組織及活動中相互協助、彼此尊重。兩岸人民同屬中華民族，本應各盡所能，齊頭並進，共同貢獻國際社會，而非惡性競爭、虛耗資源。並將以「尊嚴、自主、務實、靈活」作為處理對外關係與爭取國際空間的指導原則。
民國九十七年五月廿一日(2008.5.21)
馬英九總統在國際媒體記者會中表示，黨對黨接觸可作為兩岸關係之第二軌道，此一軌道當然不致於與現有軌道（海基海協）衝突。同時，也將落實「不統、不獨、不武」的政策。「不統」表示，在我的任期內，我將不會與中國大陸談及兩岸統一議題。其次，「不獨」表示，我將不會支持推動法理台獨。而「不武」應該不需要解釋了。因此，我提過，我將在中華民國憲法架構下維持台海現狀，我們將維持現狀，而台灣地位也將維持現狀。
民國九十七年五月廿一日(2008.5.21)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在立法院表示，她所認識的九二共識就是一中各表，一中各表就是九二共識；並希望兩岸人民關係條例第三十八條能儘速修訂，以便人民幣兌換趕上七月份中國觀光客來台與週末兩岸包機政策。
民國九十七年五月廿二日(2008.5.22)
馬英九總統與國內媒體茶敘致詞時表示，歡迎陸資入台，當然歡迎的是所謂「投資設廠的投資」（green-field investment），而不是股市或短期、短線的炒作，包括房地產，尤其是愛台12項建設的部分。
民國九十七年五月廿二日(2008.5.22)
針對中共正式回應我國第12任總統就職演說相關內容，陸委會新聞稿指出，兩岸應繼續秉持「擱置爭議、追求雙贏」的原則，促成兩岸兩會制度化協商的早日恢復，共同開啟和平共榮的歷史新頁。
民國九十七年五月廿三日(2008.5.23)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在與外國媒體駐台記者會面時指出，如果大陸國台辦主任陳雲林有意訪台，我方表示歡迎。並表示，兩會復談將優先以周末包機和大陸觀光客來台為優先協商的議題，至於其他議題，要視兩會復談之後的情勢再做決定。復談地點只要雙方同意，就沒問題。至於新華社、人民日報恢復駐點的可能性，原則上陸委會並不持反對立場。
民國九十七年五月廿四日(2008.5.24)
馬英九總統與中國國民黨吳伯雄主席等訪陸團成員茶敘時表示，未來與大陸官方的溝通管道是陸委會透過海峽交流基金會與大陸的海峽兩岸關係協會進行協商，這是政府委託的民間團體所建立的管道。中國國民黨與中國共產黨於三年前所建立的平台是第二管道，可以輔助第一管道在推動兩岸政策上所做的努力，對這樣的發展，政府表示歡迎並支持。
民國九十七年五月廿九日(2008.5.29)
行政院大陸委員會新聞稿指出，兩岸務實協商是建立互信的重要步驟。陸委會強調，兩岸回歸制度化協商，是我方長久以來堅持的政策立場，未來兩岸的協商互動將依法行政，回歸制度面的規範，使兩岸關係逐步朝向有利於雙方建立互信的方向發展。並重申，海基會是政府唯一授權與中國大陸協商涉及公權力議題的機構，5月26日政府已經正式授權海基會就兩岸包機與開放大陸人士來台觀光等三項議題，與海協會進行協商，這是雙方建立互信與促進兩岸良性互動的第一步。
民國九十七年五月廿九日(2008.5.29)
馬英九總統在總統府接見美國聯邦眾議員史蜜特女士(Jean Schmidt)時表示，台灣所扮演的是「和平締造者」而非「麻煩製造者」，他將以維護台灣自主性與尊嚴為基礎，盡力改善兩岸關係，創造對等溝通與和平協調的平台。
民國九十七年六月四日(2008.6.4)
馬英九總統發表「六四」19週年感言表示，真誠關心大陸13億同胞的福祉，由衷盼望中國大陸能繼續走向自由民主均富的大道，為兩岸關係長遠的和平發展，創造雙贏的歷史條件。
民國九十七年六月五日(2008.6.5)
馬英九總統接受日本讀賣新聞專訪時表示，在兩岸共同市場成立之前，需要有很多步驟。包機週末直航跟大陸觀光客來台，只是其中的一小步而已。雙方將來在交通方面變得更方便以後，各方面的交流一定會變得更頻繁，也需要有非常複雜、龐大的配套措施，這些都需要一步一步來協商完成。我們也期待未來在飛彈部署的議題上，大陸方面應該把我方的想法能夠考慮在內；未來要與對方協商的議題，當然是先經濟、後政治，所謂政治可能包括軍事議題在內，如果是要真正達成和解的話，將來勢必要談兩岸的和平協議。
民國九十七年六月九日(2008.6.9)
馬英九總統接見海峽交流基金會協商代表團時表示，此次兩會協商項目之一的週末包機直航議題，將來還會擴大到平日包機與班機直航協商議題，往後也有許多的細部項目需要進一步討論，因此更加凸顯建立制度化管道的重要性。這次依據「九二共識」來恢復協商，雙方都同意用這樣的共識來進行，這也是「擱置爭議、求同存異」非常重要的意義。
民國九十七年六月九日(2008.6.9)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員會見台聯黨主席黃昆輝時強調，確保台灣的主體性，以及護衛台灣人民的利益，已是國內最大的共識，陸委會將盡一切努力去調和各種立場與主張，以求取共識上最大的公約數。
民國九十七年六月十日(2008.6.10)
馬英九總統參加2008年大陸台商端午節座談時表示，期許兩岸兩會正式協商恢復之後，可以帶動各項議題的協商。未來台灣金融機構登陸、投資保障機制、避免雙重課稅、高科技規格設定、爭端解決機制等議題都應好好談。
民國九十七年六月十日(2008.6.10)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員出席「2008年大陸台商端午節聯誼座談活動」指出，將依「台灣為主，對人民有利」的施政原則，以台灣為核心，以全球為視野，推動「兩岸經貿動態調整」，開創兩岸經貿協商新時代。
民國九十七年六月十日(2008.6.10)
行政院大陸委員會發表「中華民國政府對現階段開展兩岸協商之政策說明」指出，政府將在「以台灣為主、對人民有利」的前提下，在「九二共識」的基礎上，恢復海基、海協兩會制度化的協商機制，與大陸展開協商。我們期待兩岸能秉持「擱置爭議、追求雙贏」的原則，在兩會恢復制度化協商後，共同為兩岸利益尋找平衡點，使兩岸關係邁向一個新的境界。
民國九十七年六月十日(2008.6.10)
行政院大陸委員會發布新聞稿表示，在兩岸尚未簽定雙邊貨幣協定之前，先試辦開放小規模、有限度的人民幣現金兌換，讓大陸旅客可以將攜帶的人民幣，兌換成新台幣在台使用。
民國九十七年六月十二日(2008.6.12)
馬英九總統接見美商康寧公司董事長暨執行長魏文德（Wendell Weeks）時表示，兩岸需要制度化的協商機制，也應尋求更穩定的局勢，新政府一直傳達給鄰近國家一個訊息，即我們是「和平的締造者」。
民國九十七年六月十二日(2008.6.12)
行政院長劉兆玄表示，希望兩岸秉持「擱置爭議、追求雙贏」的原則下，共同努力實現週末包機與陸客來台兩大政策。
民國九十七年六月十二日(2008.6.12)
行政院大陸委員會劉德勳副主任委員指出，歡迎大陸海峽兩岸關係協會會長陳雲林在適當時機訪台，並表示，在海基會與海協會的往來架構中，原本就有兩會負責人互訪機制。希望陳雲林接任海協會會長後，兩會也恢復制度性的聯繫協商機制。
民國九十七年六月十四日(2008.6.14)
馬英九總統接見海峽交流基金會協商代表團時表示，此次兩會進行的週末包機與陸客來台談判，已有好的開始，但仍有新航路、貨運包機及平日包機議題有待進一步協商，希望海基會應依議題優先順序，排定未來的協商議程，讓兩岸直航發揮最大的效益。而此次海基、海協兩會所建立的制度化溝通管道，未來可視議題重要性，以多樣性、分層次的方式進行協商、討論，如此也可以加速談判的進度。
民國九十七年六月十四日(2008.6.14)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員表示，海基會代表團謹守對等、尊嚴原則，依據政府授權，與大陸海協會完成協商，並簽署「海峽兩岸包機會談紀要」及「海峽兩岸關於大陸居民赴台灣旅遊協議」，圓滿完成任務，對未來兩岸展開制度化協商的持續推進奠定基礎；週末客運包機和大陸觀光客來台在近期內可望開始實施，也使貨運包機的後續協商有明確依據。
民國九十七年六月十八日(2008.6.18)
馬英九總統接受「紐約時報」專訪時表示，在一、兩年內快速開展台灣與中國大陸的經貿關係，不只是週末的包機直航及增進觀光交流。在經濟議題獲得解決之後，才會討論其他方面的問題，包括台灣被限制的「國際空間」的問題及台灣海峽的安全問題。並重申在兩岸的和平談判之前，有必要先撤除飛彈以結束法理上的敵對狀態。
民國九十七年六月十九日(2008.6.19)
馬英九總統出席工商協進會會員大會時強調，在兩岸關係上，政府應儘量排除對經濟活動不必要的政治干擾，未來台灣也希望和大陸商談綜合經濟協定。
民國九十七年六月廿四日(2008.6.24)
行政院長劉兆玄在立法院接受質詢時表示，海基會和海協會兩會會談已經恢復正式管道，將來陳雲林來台之前，兩會之間，對所有細節包括稱呼都會協商；所有的單位與對方協商討論時，要堅持尊嚴和國格。
民國九十七年六月廿五日(2008.6.25)
馬英九總統接見由美國前國防部長裴利（William Perry）率領的「美中戰略安全議題訪問團」時表示，我們是和平締造者，會追求台灣海峽的和平與穩定。改善與中國大陸的關係，會先從經濟領域開始，逐漸涵蓋到國際空間，以及雙方未來可能討論的和平協定。
民國九十七年六月廿五日(2008.6.25)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在接見美國訪賓時指出，有尊嚴的參與國際組織及國際活動是台灣人民的一致期望，但中國大陸目前對於我方參與世界衛生組織的方式及國際組織的名稱上仍施加諸多限制，令人遺憾。賴主委呼籲，北京當局應務實正視兩岸現實，切實體認台灣人民的想法，在台灣參與國際組織及國際活動上展現具體善意，希望見到台灣在國際社會有「真正的空間」。
民國九十七年六月廿六日(2008.6.26)
行政院長劉兆玄出席「中華民國工業協進會第2屆第4次會員代表大會」致詞時強調，中國大陸是我國廠商對外投資金額最大的基地，也是第一大的出口市場，因此我們要務實推動兩岸經貿，推動兩岸經貿動態的調整，同時要開創兩岸經貿協商的新時代。
民國九十七年六月廿六日(2008.6.26)
為打造台灣為「亞太資產管理與籌資中心」、促成兩岸金融監理機制運作，行政院會通過放寬兩岸金融往來之相關措施，行政院金管會副主委張秀蓮說明調整放寬陸資投資之措施：
一、基金型態之外國機構投資人免出具聲明書，不再要求外資提出資金非來自大陸地區之聲明。
二、開放台港ETF(指數股票型基金)相互掛牌，開放國內業者募集之ETF可至香港上市，同意香港ETF來台上市交易。
三、開放香港交易所掛牌企業得來台第二上市(櫃) 暨發行TDR(存託憑證)等有價證券。
四、開放證券商直接投資大陸基金管理公司、期貨公司及間接投資大陸證券公司，並開放期貨商直接、間接投資大陸期貨公司，以及證券投資信託事業直接、間接投資大陸基金管理公司。
五、放寬基金投資涉陸股之海外投資限制。
民國九十七年六月卅日(2008.6.30)
馬英九總統參加陸海空軍將官晉任布達暨授階典禮致詞時表示，中國大陸 對台灣是威脅，也是機會。維護台灣安全不僅要建軍備戰，也要減少外來威脅。
民國九十七年六月卅日(2008.6.30)
行政院大陸委員會委員會議通過行政院新聞局所提恢復大陸新華社與人民日報來台駐點案，大陸媒體來台駐點的期限也由目前一個月，延長為三個月。
民國九十七年七月一日(2008.7.1)
馬英九總統參加雙和醫院落成啟用致詞時表示，隨著週末包機直航，爭取醫療與觀光結合，將是未來的主要目標。而將來飛航時間減少後，屆時台灣與許多大陸城市將成為一日生活圈，將增進兩岸人民友誼。
民國九十七年七月二日(2008.7.2)
馬英九總統主持「97年三軍五校院聯合畢業典禮」時表示， 20多年來兩岸關係的演變，讓我們瞭解到中國大陸既是一個威脅、也是一個機會。
民國九十七年七月二日(2008.7.2)
行政院劉兆玄院長與國際媒體茶敘時表示，兩岸直航基本上是為了交通、商業、旅遊等等的方便，屬於經濟方面的政策。
民國九十七年七月三日(2008.7.3)
馬英九總統接見索羅門群島、宏都拉斯、諾魯、多明尼加駐聯合國常任代表時表示，就職後開始推動與過去不同的大陸政策，希望能在許多方面緩和台灣海峽的緊張情勢，改善與中國大陸的關係，而台灣也不再被國際社會孤立，這也是推動兩岸關係非常重要的考量。
民國九十七年七月三日(2008.7.3)
行政院大陸委員會發布新聞稿表示，行政院院會通過「放寬縣市長赴大陸地區交流規劃方案」，將過去僅得申請赴大陸參加國際組織所舉辦之國際會議或活動，擴大得參加與縣市政業務相關交流活動或會議；同時簡化審查時間為於預定出發日1週前，逕向內政部提出申請審查。
民國九十七年七月九日(2008.7.9)
針對台灣在奧運會的名稱問題，行政院大陸委員會張良任副主任委員表示，「中華台北」是兩岸奧委會在1989年達成的共識。「中華台北」行之有年，不能因為今年由北京主辦奧運就任意變更，這種作法「十分不妥」，也和台灣的認知有相當差異，政府堅決反對。
民國九十七年七月十日(2008.7.10)
行政院劉兆玄院長指示交通部及相關部會，持續積極推動兩岸週末包機及大陸觀光客來臺政策，請各相關部會就相關作業流程再行檢視，包括各機場的海關、入出境、檢疫、安檢等（CIQS）之作業流程與人力配置等軟硬體設施，檢討有無再精進的空間，務期對兩岸運輸與旅遊提供更優質的服務。
民國九十七年七月十六日(2008.7.16)
馬英九總統接見中小企業協會代表時表示，新政府所推動的兩岸週末包機與大陸觀光客來台只是第一步。未來會就雙方關切的問題，包括最短距離直航、海運直航、貨運包機、投資保障、避免雙重課稅、雙方科技規格的協議，乃至爭端解決的機制，逐步納入協商議程中。
民國九十七年七月十六日(2008.7.16)
馬英九總統接見世界台灣商會聯合總會回國訪問團時表示，政府推動直航、放寬對中國大陸投資上限等，是為了台灣的發展，因為這將有助於讓那些已赴中國大陸投資的台商回流。而隨著兩岸直航帶來的便利性，台商發展的空間也會增加。
民國九十七年七月十七日(2008.7.17)
行政院劉兆玄院長對「深耕臺灣、連結全球－大陸投資金額上限鬆綁及審查便捷化方案」提示，務實推動兩岸經貿，是台灣在全球連結環境中經濟進一步提升的重要關鍵。大陸投資金額上限的鬆綁，是兩岸經貿動態調整重要之ㄧ環；完全取消跨國企業在台灣的子公司對大陸投資金額的限制，以提升台灣在國際和亞洲區域經貿體系的地位。
民國九十七年七月十七日(2008.7.17)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員會見大陸籍配偶時表示，大陸配偶的權益，未來作法可歸納為三個原則，一是讓真實婚姻的配偶容易入境。二是假結婚、人頭買賣要嚴格阻絕。三是夫妻生活基本的權利，包括工作權和其他社會權利，政府有責任加以保障。
民國九十七年七月十九日(2008.7.19)
馬英九總統接受美國有線電視新聞網（CNN）專訪時表示，兩岸能夠直接飛航，是重要且是歷史性的一件大事，這只是一個起步，因為臺灣仍希望與對岸商談國際空間、和平協議等議題。
民國九十七年七月廿一日(2008.7.21)
行政院大陸委員會發布新聞稿表示，新政府的兩岸政策始終堅持「以台灣為主、對人民有利」的基本原則，以務實積極的態度面對兩岸關係新的發展；兩岸政策鬆綁的政策目標，在強化台灣與國際的連結，提升台灣的國際能見度，進而彰顯台灣主體性，增進2300萬人民的福祉。
民國九十七年七月廿三日(2008.7.23)
行政院劉兆玄院長出席中華民國工商協進會工商早餐會時表示，今年年底前，陸續完成67項的法規鬆綁，明年則有142項議題將陸續推動鬆綁。其中，兩岸經貿法規鬆綁將列為工作重點，鬆綁範疇包括開放兩岸貨運包機、證券及期貨業投資大陸、陸資來台投資生產事業等。
民國九十七年七月廿四日(2008.7.24)
馬英九總統接見日本中華聯合總會訪賓時表示，我方期許自己成為「和平締造者」，不會片面改變目前中華民國在憲法架構之下的現狀，這也是他在就職演說中特別強調兩岸關係是「不統、不獨、不武」，在他任內不會與對岸談判統一問題、不支持法理台獨以及反對武力解決兩岸問題的理念。
民國九十七年七月廿四日(2008.7.24)
針對中共國台辦表達願意遵守兩岸奧會在1989年所簽署的協議，行政院大陸委員會發布新聞稿表示，為展現我方積極營造兩岸關係和諧，建構必要共識與秩序的誠意，提議雙方可以在1989年協議的既有基礎上，進行必要的意見交換與進一步的溝通，以尋求妥善解決問題的共識。
民國九十七年七月廿九日(2008.7.29)
馬英九總統訪視行政院大陸委員會時表示，對大陸的開放措施會逐步推出，但並不代表政府鼓勵台商一定要去大陸投資，而是讓台灣在國際化過程中與國際接軌，將原先比較欠缺的部分補起來，提供一個更自由、更方便的環境讓外商與台商揮灑，這才是最重要的。
民國九十七年七月卅日(2008.7.30)
馬英九總統為我國參加「2008年北京奧林匹克運動會」代表團授旗，致詞時表示，海峽兩岸都能夠以「擱置爭議、共創雙贏」的精神，讓本來可能阻礙這次運動選手參賽的事件能夠在峰迴路轉、雨過天青之後圓滿落幕。
民國九十七年七月卅一日(2008.7.31)
行政院院會通過金管會公布「海外企業來臺上市鬆綁及適度開放陸資投資國內股市方案」，除放寬海外企業來臺上市資格及籌資限制，並適度開放大陸機構投資人來臺投資證券期貨。
民國九十七年八月一日(2008.8.1)
馬英九總統接見即將離任的澳大利亞商工辦事處代表華適文(STEPHEN WATERS)時表示，如果台灣在國際上繼續被孤立，兩岸關係就不可能順利發展，同時兩岸在國際上也應相互合作、彼此尊重，而不要惡性競爭、消耗不必要的資源。想要兩岸在國際社會上停止沒有意義的惡性競爭，不僅由外交上解決，也要從兩岸關係著手。
民國九十七年八月四日(2008.8.4)
馬英九總統訪視外交部時表示，「活路外交」基本的理念就是希望為中華民國的外交尋找一個出路，具體的方法就是看能不能在兩岸關係當中，在國際社會方面，找出一個雙方可以互動的模式。並希望能夠在雙邊關係上做到「和解休兵」，雙方不要在對方的邦交國去進行惡性競爭，不浪費資源來挖對方的邦交國。如果兩岸都認為雙方應該「擱置爭議、求同存異、正視現實、共創雙贏」的話，就應該有機會在國際場域也達成某些共識。
民國九十七年八月七日(2008.8.7)
北京奧運應變小組召集人、行政院大陸委員會張良任副主任委員針對北京奧運發表三項聲明表示，國人都非常重視國際空間問題，大家都希望我們能夠參與國際空間、擴大國際空間，任何有參與機會，我們都不能夠放棄，都要極力的爭取，而奧會也是我們參與國際空間的一種表現，所以我們的選手絕對會全力爭取參與這樣的國際盛會；希望北京奧運能夠順順利利舉辦、風風光光收場，也希望民眾多關心選手表現，多替他們加油，不要為了政治紛紛擾擾影響多年來苦練的成果；期待選手勇奪金牌創造佳績，唯有好的成績才是擴展國際空間最好的力量。
民國九十七年八月十五日(2008.8.15)
外交部發布新聞稿表示，聯合國專門機構是各國共同處理全球性議題最重要的平台，有必要依據「普遍化」原則，讓國際社會所有成員都有參與的機會。因此，我國政府誠摯呼籲國際社會支持台灣的國際參與，並籲促中方體認台灣2,300萬人民的想法與期望，以善意及彈性回應我爭取參與聯合國專門機構的各項努力。
民國九十七年八月廿三日(2008.8.23)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在芝加哥全美台灣同鄉聯誼會年會上演講指出，過去三個月，政府改善兩岸關係的政策已有進展，雙方都有善意要改善關係，這是歷史性的跨越，兩岸都必須把握促進台灣海峽安定及和平的契機。
民國九十七年八月廿四日(2008.8.24)
馬英九總統在金門發表談話時強調，衝突時代已經結束，和解共榮的時代來臨，兩岸和解休兵，讓金門從二十世紀的兩岸殺戮戰場，蛻變成二十一世紀臺海的和平廣場。小三通全面正常化後，金門廈門勢必形成共同生活圈。金門與廈門興建大橋將在年底完成評估。未來金門與廈門將是兩岸和解之門、和平之門與合作之門。
民國九十七年八月廿五日(2008.8.25)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，總統所提給予大陸人民赴金馬觀光旅遊落地簽證或多次入境簽證的政策方向，主要考量因素是基於兩岸平等互惠原則（目前大陸方面已在11個城市給予我方落地簽），以及希望藉此增加大陸旅客到金馬觀光之誘因，減少兩岸直航後對金馬小三通之衝擊，因此，在不中轉至台灣的前提下，對於來金馬觀光旅遊的大陸旅客給予簽證上的便利。未來辦理落地簽之大陸旅客仍需經過內政部移民署及相關機關之審查許可，只是審查程序更為簡便、時間更短。此一有限度、便利大陸旅客入出境的試驗性措施，已充分兼顧國家安全，不致產生部分人士所指可能引發國安漏洞等問題。
民國九十七年八月廿七日(2008.8.27)
馬英九總統接受遠見雜誌專訪時表示，開放兩岸教育可以讓海峽兩岸的青年學生彼此認識，也有助於兩岸未來和平，並可解決我們招生不足的問題。
民國九十七年八月廿七日(2008.8.27)
馬英九總統接見第37屆台美「當代中國」研討會與會美方學者沙特（Robert Sutter）教授時表示，新政府上任後提出外交休兵的構想，希望台灣的國際關係也能像兩岸關係一樣有和解的機會，避免海峽兩岸在國際社會為了爭取對方的邦交國進行惡性競爭。
民國九十七年八月廿七日(2008.8.27)
外交部發布新聞稿指出，中共駐聯合國代表王光亞稱中國大陸與「世界衛生組織」（WHO）秘書處，在2005年所簽署之「諒解備忘錄」，已為我醫療衛生專家參加WHO之技術性會議及活動提供便利，並不正確。事實上，我仍無法充分參與WHO各項會議及活動，亦無法與WHO建立直接聯繫及互動，與我方期待仍有差距。
民國九十七年八月廿八日(2008.8.28)
行政院大陸委員會劉德勳副主委表示，兩岸若能共同參與國際活動與國際組織，將有助於兩岸建立互信，擱置爭議，降低誤解。而兩岸在國際組織與國際活動中，透過相互協助與彼此合作，相互尊重的立場，將使兩岸對國際社會都能有更多的貢獻，也能讓兩岸朝向和平的方向發展。
民國九十七年八月廿八日(2008.8.28)
行政院大陸委員會公布最新民調，顯示大部分民眾認知新政府上任以來，兩岸關係已趨平穩。根據這項調查結果，超過半數民眾（50.6%）對政府維持兩岸和平穩定的能力感到有信心；有過半數（52.2%）民眾認為兩岸關係跟過去一年比起來，變得緩和。關於兩岸協商的安排，高達73%的民眾贊成應該先處理經濟問題，以後再談政治議題；而在「強調對等尊嚴」與「追求實質利益」二者中，有51.6%的人認為兩者一樣重要。
民國九十七年九月一日(2008.9.1)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，賴幸媛主任委員在接見日本平成國際大學法學部長酒井正文教授一行時表示，新政府大陸政策思維，就是希望透過兩岸雙方的務實交流、兩岸關係的改善，以獲致台海穩定及東亞區域和平。
民國九十七年九月二日(2008.9.2)
馬英九總統出席「全民國防教育日」表揚大會時強調，共軍仍以千餘枚飛彈對準我們，對台灣安全構成相當程度的威脅。因此，面對威脅，國軍沒有鬆懈戰備的理由。而兩岸關係有威脅，也有機會，我們要努力把威脅極小化，把機會極大化。
民國九十七年九月二日(2008.9.2)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，賴幸媛主任委員在與媒體茶敘中表示，美方對於台灣「拓展國際空間」及「有意義參與國際事務」等議題，表示理解與支持。
民國九十七年九月三日(2008.9.3)
行政院大陸委員會發布新聞稿表示，推動「小三通」正常化接下來幾個重點工作包括： （一）適度開放大陸人民也能運用「小三通」管道進出台灣。 （二）因應金門、馬祖與對岸廈門、馬尾及福州一帶逐漸發展成為生活圈，將在人員入出、貿易、航運往來提供較大的方便，特別是在行政程序上的簡化及時效的加快。（三）實施澎湖常態化「小三通」。
民國九十七年九月三日(2008.9.3)
馬英九總統接受墨西哥「太陽報」系集團董事長瓦斯蓋茲(Mario Vázquez Raña)專訪時表示，兩岸政策可以「三不」與「三要」來形容，「三不」就是「不統、不獨、不武」，「不統」的意思是不會跟中共討論有關兩岸統一的問題，「不獨」是不會追求法理上臺灣的獨立，「不武」則是反對使用任何武力來解決台灣問題的方案。
民國九十七年九月三日(2008.9.3)
行政院劉兆玄院長與中小企業座談時表示，政府已規劃兩岸和平策略，實踐馬總統的「擱置爭議、創造雙贏」政見，從兩岸週末包機的開啟及一系列的措施，相信將可達到兩岸和平的局面。
民國九十七年九月三日(2008.9.3)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員接見德國國會議員塞巴斯提安(Mr. Wilhelm Josef Sebastian)時表示，對政府而言，改善兩岸關係與拓展國際空間同等重要。政府大陸政策的主要目標為追求台海及區域的和平及穩定。倘若中共持續在國際上打壓我國，對逐漸回溫的兩岸關係將有不利影響。而新政府上任以來在兩岸方面所推動的各項經貿鬆綁措施，旨在與國際連結，健全國內投資環境，鼓勵台商回流，以帶動我國經濟發展。因此，新政府政策過度向大陸傾斜的說法是不正確的解讀。
民國九十七年九月三日(2008.9.3)
行政院大陸委員會發布「12億川震捐款滯台」澄清新聞稿指出，經兩岸兩會多次函電往返，雙方逐漸確認台灣捐款主要將運用在長期的災後重建之用。而政府對四川震災善款之運用，主要是考量大陸整體川震重建規劃之執行計畫，務必要將善款透過兩岸兩會聯繫平台做好安排後，才能獲得捐款人士和各界的信賴。
民國九十七年九月四日(2008.9.4)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，賴幸媛主任委員在接受「亞洲週刊」專訪時強調，新政府成立之後，兩岸互動的主體已經不再是兩岸政府，而是包括雙方的人民；兩岸互動的範圍也不再限於兩岸之間的往來，而是全方位的互動。因此，兩岸雙方應該多溝通，尋求解決方案，並且要有「同理心」，以增加交集與共識，降低彼此對立，減少誤會。
民國九十七年九月四日(2008.9.4)
行政院院會通過大陸委員會提報的「『小三通』正常化推動方案」，進一步放寬「小三通」人員、航運、貿易等往來限制。相關政策調整措施將於今年9月30日前完成並付諸實施；澎湖「小三通」常態化預訂於10月中旬開始實施。
民國九十七年九月十日(2008.9.10)
馬英九總統視導東沙島時表示，改善兩岸關係，最主要的目的是降低台海緊張、追求台海和平，一方面讓周邊國家對台灣所扮演區域和平的角色有深入瞭解；一方面可使兩岸不必在緊張的氣氛中進行交流。新政府推動所有的政策都是以「以台灣為主、對人民有利」原則作為一切施政的依據。政府在推動兩岸關係的同時，絕對不會在建軍戰備上有任何鬆懈，在外交上推動「兩岸和解、外交休兵」，也不會因而減弱鞏固邦交國、提升與無邦交國家實質關係的努力。
民國九十七年九月十日(2008.9.10)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員出席「開創雙贏：台港澳交流與發展」研討會致詞時表示，今年520新政府成立後，台港澳關係已逐漸升溫，各項交流互動也漸朝向積極正面的方向發展。近期兩岸四地關係的突破性發展，是難得的機遇，賴主委強調應該把握機會，為台港澳關係的正常化鋪路，並期待雙方本於互惠互利原則，致力推動有利台港澳民眾福祉的措施，增進台港澳的互動及官方正常往來。
民國九十七年九月十一日(2008.9.11)
對於中方使用「中國台北」稱呼我方，外交部發言人陳銘政在記者會表示，1991年APEC在討論中國大陸、中華民國、香港入會時曾簽署備忘錄，其中已有界定中華民國參與APEC的名稱，當時協定的名稱是「Chinese Taipei」，但並未規範中文譯名。如果要使用中文譯名，外交部堅持「中華台北」的名稱。
民國九十七年九月十四日(2008.9.14)
行政院大陸委員會針對大陸輸入的「三鹿牌」奶粉遭受三聚氰胺污染一事，發表聲明指出，大陸方面透過海協會通報我方海基會。此一過程已發揮兩岸制度化聯繫管道在緊急事務通報方面應有的功能。而為根本解決食品安全的問題，我方建議兩岸應儘速就大陸輸入我方之食品及商品之安全管理相關事宜，進行協商，並建立貿易、商品檢驗及衛生主管部門之直接聯繫管道與及時通報系統，以有效維護民眾健康權益。
民國九十七年九月十五日(2008.9.15)
行政院劉兆玄院長對大陸「三鹿」毒奶粉流入台灣市場的事件，裁示未來凡中國大陸進口的乳製品均逐批檢驗。並指示陸委會，發函大陸官方單位，強調「台灣不能接受中國不把關食品安全」的立場，呼籲大陸負起嚴格檢驗出口產品安全的責任。
民國九十七年九月十六日(2008.9.16)
行政院劉兆玄院長出席「2008年大陸台商秋節座談聯誼活動」時表示，務實推動兩岸經貿關係將是台灣經濟能否進一步提升的重要關鍵，這段期間政府鬆綁台商赴大陸投資上限提高到60﹪等種種鬆綁措施與促進投資作為，都是希望釋放民間的活力，使兩岸經貿關係正常化發展，促進台灣經濟的繁榮成長。
民國九十七年九月十六日(2008.9.16)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員參加大陸台商秋節聯誼會時表示，開放台商擔任大陸政協委員是國家法律與體制的問題，依據現行法律規定，國人是不能擔任大陸地區黨務、軍事、行政或具政治性機關、團體之職務或為其成員。
民國九十七年九月十八日(2008.9.18)
外交部發布新聞稿，對聯合國總務委員會未將我國參與聯合國組織之提案列入議程表示遺憾。外交部重申，聯合國專門機構接納臺灣2300萬人民之參與，將有助臺海兩岸建立互信，增進亞太地區之和平、穩定及繁榮。希望我2300萬人參與國際組織活動的基本權利應受到國際社會的重視。並鄭重呼籲大陸當局展現彈性與智慧，促成兩岸在國際社會彼此尊重，和解共存。
民國九十七年九月廿二日(2008.9.22)
行政院大陸委員會劉德勳副主委在立法院指出，陸委會將修改「兩岸人民關係條例」，放寬大陸配偶來台制度與工作權，並適度採認大陸學歷及開放陸生來台就學。
民國九十七年九月廿四日(2008.9.24)
行政院大陸委員會發布新聞稿指，賴幸媛主任委員在接受「天下雜誌」專訪中表示，第一次江陳會談象徵兩岸兩會制度性協商的恢復。現在雙方已有每半年舉行一次江陳會的默契。
民國九十七年九月廿四日(2008.9.24)
行政院大陸委員會關於「大陸學歷採認」，發布新聞稿說明政策立場表示，政府對於大陸高校學歷的採認，將有嚴謹的評估及驗證措施，針對大陸高校學術水準進行評估，訂定適度採認門檻，並嚴格進行學歷證件的驗證程序。而對或將產生吸引臺灣學生赴大陸就學的效應與對我高等教育產業造成一定程度的衝擊，政府部門在研處相關教育開放政策時，將會秉持「循序漸進」的原則，審慎研擬具體可行的作法逐步推動。
民國九十七年九月卅日(2008.9.30)
馬英九總統出席世界台灣商會聯合總會閉幕典禮時指出，為了要促進兩岸和平，新政府上任後立即恢復中斷10年的兩岸協商，並完成週末包機直航、大陸觀光客來台、擴大小三通及開放兩岸進一步投資，主要的目的就是要讓兩岸關係正常化，進一步將台灣變成全球創新中心、亞太經貿樞紐、台商營運總部。
民國九十七年十月五日(2008.10.5)
馬英九總統出席97年全國青年政策大聯盟會議時表示，承認大陸學歷不代表開放陸生來台考證照，大陸學生若沒有台灣身分證則無法參加證照考試，且政府目前也沒有開放的計畫。
民國九十七年十月五日(2008.10.5)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在「中華兩岸婚姻促進會」舉辦的研討會致詞時表示，陸委會在照顧中國大陸籍配偶權益上，秉持三原則，即真的配偶可以進來、假結婚及人頭買賣阻隔在外、保障夫妻生活基本權益。而涉及大陸配偶工作權及居留權放寬問題，將修改兩岸人民關係條例，但因仍牽涉其它配套措施，須分階段處理。
民國九十七年十月六日(2008.10.6)
行政院大陸委員會於委員會議提報修正「試辦金門馬祖與大陸地區通航實施辦法」部分條文報告案，並說明相關修法重點如次：恢復金馬澎設籍6個月以上居民申辦「金馬證」；放寬大陸地區人民得循「小三通」管道赴金門、馬祖就讀推廣教育學分班；明訂以旅行事由至金門、馬祖、澎湖觀光之大陸地區人民，核發臨時入境停留通知單（即落地簽證）或多次入出境許可證；明訂來臺從事商務、專業交流的大陸地區人民，可經由「小三通」中轉至臺灣本島，同時修正延長大陸旅客停留澎湖期間，並配合澎湖擴大專案貨運直航範圍，增訂相關法源依據。
民國九十七年十月八日(2008.10.8)
馬英九總統接受日本「世界雜誌」總編輯岡本厚專訪時表示，推動兩岸關係的原則是「以台灣為主、對人民有利」；改善跟中國大陸的經貿關係，目標是希望把經貿關係正常化，然後進一步緩和雙方在國際上的摩擦，讓台灣能夠得到合理的國際空間，最後希望跟大陸簽訂和平協定，終止兩岸的敵對狀態，讓台灣海峽真正變成和平、繁榮的大道。
民國九十七年十月八日(2008.10.8)
行政院劉兆玄院長出席由陸委會所舉辦的歡迎港澳人士來台慶祝中華民國97年國慶茶會，致詞時表示， 520以來，新政府以非常積極的態度推動台港澳關係的改善與提升，我們鼓勵台港澳民間各層面的交流與合作，也願意大幅提升官方性質的交流與互動。
民國九十七年十月十日(2008.10.10)
馬英九總統出席中華民國各界慶祝97年國慶大會致詞時表示，五二○之後，政府在民意的支持下，迅速恢復中斷十年的兩岸對話，大幅緩和兩岸的緊張關係，對區域的穩定與和平做出明顯的貢獻，也讓我們得到包括美國、日本、歐盟、東南亞與紐澳等國在內國際社會的肯定。
總統表示，目前在主權問題上，兩岸仍存在分歧，我們希望雙方運用智慧，共同擱置爭議，並設法將兩岸的政治和解，逐步擴大到國際社會，讓兩岸不需要在國際間衝突對立，創造台灣、大陸與國際社會的三贏。
民國九十七年十月十三日(2008.10.13)
行政院大陸委員會發布「政府於近期舉行第二次『江陳會談』之說明」指出，第二次「江陳會」之目標，就短期而言，在積極開創互利互惠的兩岸關係；就長期而言，在循序建構和平穩定的兩岸關係。希望第二次「江陳會談」能夠：一、簽署有利台灣及兩岸關係的相關協議。二、透過江陳對話與協商尋求解決各界關注的議題。三、邀請陳雲林來台親身體會台灣多元特質及國人的民主素養。
民國九十七年十月十八日(2008.10.18)
馬英九總統接受印度英文戰略學術季刊《印度暨全球事務》專訪時表示， 我們與大陸建立軍事互信機制或和平協議沒有時間表，兩岸周末包機與大陸觀光客來臺，是新當局成立后最優先政策。下一步是推動海空直航及兩岸經濟關係全面正常化，再來是有關兩岸國際空間及和平協議問題。
民國九十七年十月廿一日(2008.10.21)
馬英九總統參加「國軍97年重要幹部研習會」時表示，在中華民國憲法的架構下，維持台海兩岸的現狀，所採取的策略、立足點是「不統、不獨、不武」。所謂「不統」，就是在他任內，不會和海峽對岸探討有關兩岸統一的問題；所謂「不獨」，就是不會追求、也不會支持有關台灣法理獨立的任何努力；所謂「不武」，就是反對使用武力來解決兩岸之間的問題。
民國九十七年十月廿七日(2008.10.27)
馬英九總統接受中央社專訪時指出，過去政府與新加坡洽簽FTA時，除了大陸阻撓的因素外，台灣堅持「台灣經濟體」名義，也是破局的原因，台灣若以世界貿易組織（WTO）的台澎金馬獨立關稅領域，簡稱中華台北（Chinese Taipei），與其他國家洽簽FTA，也許機會就增加很多。
民國九十七年十月卅日(2008.10.30)
馬英九總統在接見海運、空運業界代表時表示，二次「江陳會」的意義可以濃縮為「正視現實、互不否認、為民興利、兩岸和平」16個字，他並重申政府一定會秉持「以台灣為主、對人民有利」的原則，為全民爭取最大的利益。
民國九十七年十月卅一日(2008.10.31)
馬英九總統在接見農漁業界代表時表示，有鑑於毒奶事件，食品安全將列為此次協商重點，未來我們希望與中國大陸間，能從商品出口前的檢驗到發生糾紛時如何求償申訴等，建立雙方都認可的體制，做好事前預防的工作。
民國九十七年十月卅一日(2008.10.31)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，政府一直都是根據兩岸發展的情勢，考量民意需求，審酌情勢推動兩岸政策。目前兩岸正在協商的海運及空運議題，也都是在過去的基礎上，循序向前推動的政策。
民國九十七年十一月三日(2008.11.3)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出， 政府的兩岸政策與其他政策同樣受到國內法律和民意的監督，且此次全程在台北舉行，更有利於國內輿論、民眾及反對黨的監督。而兩會恢復制度性協商後，一次在北京舉行，一次在台北舉行，也更能彰顯兩岸對等協商的原則。而本次陸委會授權海基會的協商範圍僅限於兩岸空運、海運、郵政合作及食品安全事務，無關兩岸政治關係的議題，亦不牽涉國家主權之變動。
民國九十七年十一月四日(2008.11.4)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在接見大陸海協會陳雲林會長時表示，兩岸互信需要逐步累積，一方面要有足夠的溝通與對話；另一方面則必需坦然面對並且尊重兩岸的既有現實。兩岸良性互動開啟了新的機會，兩岸秉持「對等、互信、尊嚴、互惠」的原則，就可以積極創造出有利於兩岸人民的可能性。
民國九十七年十一月四日(2008.11.4)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員發表新聞稿「盼大陸掌握當前有利機遇，共同努力向前推展兩岸關係」，說明接見大陸海協會陳雲林會長，主要是向陳會長表達4個重點：首先，強調兩岸對等協商的重要性；其次，具體說明建構兩岸交流秩序的優先性；第三；提出交流協商利益要全民共享的思維；第四，提醒大陸方面應該正視兩岸的現實，把握住當前有利契機，和我們一起努力，以創造兩岸長期和平與發展的互動關係。
賴主委也表達兩岸可以在雙方經貿密切往來既有的基礎上，研商互利互惠的方式，使兩岸經貿關係趨於正常化。
民國九十七年十一月六日(2008.11.6)
馬英九總統在總統府記者會表示，政府兩岸政策基本的原則，在中華民國憲法的架構下，維持海峽兩岸「不統、不獨、不武」的現狀；而在具體的政策上，秉持「以台灣為主、對人民有利」的原則來推動，一方面要追求兩岸的和平，一方面也要維持堅強的國防。維持兩岸和平，我們採取各種方式，包括促進雙方的往來、貿易、投資、旅遊、金融，讓雙方能夠在許多方面建立良好關係，降低衝突的風險。
民國九十七年十一月六日(2008.11.6)
馬英九總統接見海基、海協兩會代表團時表示，兩岸之間仍然存在著分歧與挑戰，尤其是在台灣安全與國際空間這些問題上更是如此。希望將來兩岸能在「正視現實、互不否認、為民興利、兩岸和平」的基礎上積極處理這些分歧，並且擴大雙方合作；也希望未來兩岸還有更多高層的互訪。
民國九十七年十一月七日(2008.11.7)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在新聞局有關第二次「江陳會談」的記者會中表示，海基會在陸委會充分授權下，配合相關部會協商完成四項議題的簽署，具有下列意涵：進一步落實制度化協商機制，大幅提升兩岸互動層級，突出兩岸現階段協商重點，體現兩岸對等協商與互動的新模式，穩定兩岸關係、促進區域和平。
民國九十七年十一月八日(2008.11.8)
行政院長劉兆玄出席「97年教育奉獻獎及資深優良教師表揚大會」致詞時指出，為了促進兩岸關係的良性互動，政府將積極推動兩岸的學術文化交流，無論是在大陸學生來台就讀或修讀學位，或承認優質大陸大學的學歷，應以審慎漸進的步調推動，使兩岸雙方的學生有更多交流的機會，更多求學和發展的空間。
民國九十七年十一月十日(2008.11.10)
馬英九總統參加中華民國「第四屆全球僑務會議」開幕典禮時表示，政府提倡外交休兵，「當休則休，當進則進」，一方面要鞏固邦交國，一方面在爭取邦交國時，會與對岸達成協議，不互挖彼此的邦交國，希望在國際間也能像兩岸間和解休兵。
民國九十七年十一月十一日(2008.11.11)
馬英九總統參加慶祝工業節大會時表示，與大陸簽署四項協議是為了台灣的利益，不僅可與大陸改善關係，也可讓台灣有更多的發展機會。
民國九十七年十一月十三日(2008.11.13)
行政院劉兆玄院長在聽取大陸委員會於行政院會提出「第二次江陳會談檢討說明報告」後裁示，「第二次江陳會談」簽署4項協議，為兩岸制度化的協商管道奠定基礎，後續配套措施，請陸委會管控進度、儘早完成，並成立專案小組積極規劃未來協商事宜。並強調，雖然此次協商議題是經濟性的，但部分民眾的思考多數是政治導向，政府相關單位必須就政策、措施的推動，積極進行說明，並充分整合國內共識，後續的協商才能順利的展開。
民國九十七年十一月十三日(2008.11.13)
內政部移民署聯審會同意大陸東南衛視及福建日報社（包括旗下福建日報、海峽都市報及海峽導報）以輪替方式派人來台駐點採訪。
民國九十七年十一月十四日(2008.11.14)
馬英九總統接受「今日美國報」（USA Toady） 專訪時表示，兩岸領導人會晤之時機尚未來臨，但我們會持續與大陸發展正常化的經貿與文化關係，不會排除任何協商並簽署和平協議之可能性。但我們必須循序漸進地與大陸改善關係。首先從兩岸最基本的需求開始－運輸、郵政及其他事務，而後再擴展至其他領域。
民國九十七年十一月十五日(2008.11.15)
馬英九總統訪視東榮合作農場時再度重申，日前兩岸簽署的四項協議完全符合對等與尊嚴，中華民國是主權獨立的國家，對此他沒有任何讓步，兩岸平等互惠，也沒有任何矮化。
民國九十七年十一月十六日(2008.11.16)
馬英九總統出席「中華民國憲法學會」年度大會時表示，中華民國是一個主權獨立的國家，沒有任何人可以減損這個地位，台灣的前途等議題，當然要由全台灣2300萬人來決定。「台灣地區與大陸地區人民關係條例」很清楚區分主權與統治權，台灣地區的定義是「台灣、澎湖、金門、馬祖及中華民國統治權所及的其他地區」，大陸地區的定義是「台灣地區以外的中華民國領土」。此一定位，符合我方長期以來所主張的兩岸交往必須「對等」與「尊嚴」，同時與「以台灣為主，對人民有利」的原則也不衝突。
民國九十七年十一月十九日(2008.11.19)
馬英九總統接受「自由時報」專訪時表示，兩岸和解需要時間，在贏得和平的過程中，我們不能夠受到屈辱，不能退讓主權、尊嚴受損。大陸政策是在中華民國憲法架構下，維持台海的現狀，就是不統不獨不武，以台灣為主、對人民有利。
民國九十七年十一月廿一日(2008.11.21)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員接見「移民修法聯盟」及「中華兩岸婚姻協調促進會」代表時表示，陸委會就大陸配偶制度之調整，係秉持「反歧視原則」、「民主國家法治原則」、「不讓非法入境、假結婚者阻礙合法移民的權益原則」三項原則來修正兩岸條例。重點包括：
一、全面放寬大陸配偶工作權。
二、縮短大陸配偶取得身分證之時間。
三、增訂強制出境大陸配偶前召開審查會之規定，給予當事人陳述意見之機會。
四、取消大陸配偶繼承不得逾200萬元之限制。
五、有關父母與子女間之法律關係，改為依子女設籍地區之規定。
民國九十七年十一月廿五日(2008.11.25)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員接見歐洲議會自由黨團主席Graham Watson時表示，第二次「江陳會談」深具歷史意義，除有利於亞太局勢的和平與發展，對台灣與歐盟關係也有正面影響。
民國九十七年十二月三日(2008.12.3)
馬英九總統出席外籍記者聯誼會（TFCC）座談時指出，兩岸協商的進程是先易後難、先經濟後政治，事情要分輕重緩急，兩岸和平協議不是最急迫的議題。兩岸和平協議的前提是兩岸都有誠意改善關係，但台灣現在仍非常顧忌對岸對台部署的1000多枚飛彈，政府會堅持對岸先撤飛彈，才會簽所謂的和平協議。
民國九十七年十二月四日(2008.12.4)
行政院院會通過修正「臺灣地區與大陸地區人民關係條例」第22條草案，開放招收陸生來臺就讀大專校院與放寬大陸學歷採認。行政院也強調，政府將採取「三限六不」原則，審慎推動後續相關措施，以保障本國學生的權益。所謂「三限六不」原則就是「不加分優待」、「不會影響臺灣學生就學權益」、「不編列獎助學金」、「不允許校外打工或兼職」、「不會有就業問題」、「不得報考公職人員考試」、「限制採認之高等學校」、「限制來臺陸生總量」、「限制醫事學歷採認」。
民國九十七年十二月四日(2008.12.4)
行政院大陸委員會發言人劉德勳在記者會表示，根據兩岸人民關係條例，台灣地區居民不得出任大陸政治職務。大陸政協會議雖然為協商機構，但屬於大陸政治性組織；儘管廈門開放的是地方政協委員，但政協有其全國性組織，有其全國性政治意涵，現階段的政策方向上，台灣居民出任這項職務「並不適合」。
民國九十七年十二月四日(2008.12.4)
行政院金融監督管理委員會公告訂定「大陸地區投資人來臺從事證券投資及期貨交易管理辦法」。
民國九十七年十二月九日(2008.12.9)
馬英九總統接受美國「華盛頓郵報」（The Washington Post）駐北京分社主任Maureen Fan專訪中表示，民調顯示兩岸簽署海空直航、郵政以及擴大食品安全合作等四項協議獲得台灣民意廣泛支持。下一步將是兩岸銀行業者擴大合作，讓雙方得以彼此投資。並表示，期望台灣明年能參與5月的「世界衛生大會」（World Health Assembly），我們並非要求以台灣名義加入WHO，我們所做的是，呼籲「聯合國」檢視台灣2,300萬人民有意義參與「聯合國」專門機構的需求」。
民國九十七年十二月十一日(2008.12.11)
行政院院會通過行政院大陸委員會提出的「臺灣地區與大陸地區人民關係條例」部分條文修正草案，未來大陸配偶取得我國身分證時間將縮短為6年，同時大陸配偶在台灣可以工作，繼承遺產也不再有新台幣200萬元的限制，將使大陸配偶的工作權、身分權及財產權獲得更完善的保障。陸委會主委賴幸媛對此強調，行政院通過的兩岸條例部分條文修正草案，是針對大陸配偶制度的重大改革，也是政府落實人權保障的一大進展。
民國九十七年十二月十一日(2008.12.11)
行政院大陸委員會副主委劉德勳在記者會表示，國共論壇是非官方性、非政策性的兩岸意見交流平台，與會官員須以私人名義參加，相關結論只能當做政府政策的輔助參考。
民國九十七年十二月十二日(2008.12.12)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，兩岸兩會第二次會談簽署的四項協議，協議內容自雙方簽署之日起四十日內生效，交通部及相關機關在發布配套法規後，兩岸直航將正式實施。
民國九十七年十二月十四日(2008.12.14)
交通部基隆港務局發布「臺灣地區與大陸地區海運直航許可管理辦法」，並公告臺灣地區與大陸地區直航港口，有關兩岸海運通航事項。
民國九十七年十二月十四日(2008.12.14)
中華郵政公司公告，自97年12月15日起開辦兩岸直接通郵業務，開啟兩岸郵政業務合作。
民國九十七年十二月十五日(2008.12.15)
馬英九總統出席慶祝長榮海運立敏輪兩岸直航首航儀式時表示，兩岸直航代表兩項意義，一方面是兩岸和解不再走過去對立衝突的路線，也就是用談判取代對立、以和解取代衝突，兩岸共同謀求和平與繁榮；另一方面則從經濟面著眼，兩岸在空運、海運直航上，都可以節省大量的時間及成本。
民國九十七年十二月十八日(2008.12.18)
行政院長劉兆玄在行政院會上表示，兩岸海空運直航正式啟動，不僅是歷史性的一刻、開啟兩岸和平發展的新頁。隨著大三通的展開，兩岸交流將更加密切，同時也會衍生更多的問題等待協商處理，陸委會應妥善規劃後續協商議題，逐步在兩岸兩會制度性協商的框架下為兩岸的和平發展做好準備。
民國九十七年十二月廿日(2008.12.20)
馬英九總統在泰國英文報「民族報」發表專文指出，中國大陸如能摒棄外交零和思維，停止對台灣國際活動空間的打壓，尊重台灣人民參與國際社會的願望，兩岸將可攜手合作增進人類福祉與促進區域和平與安全，才是實現台海永久和平的最佳途徑。
民國九十七年十二月廿日(2008.12.20)
行政院大陸委員會發布新聞稿指出，外界關切官員以個人名義參加「國共論壇」情形，基於彰顯行程活動之透明性，及讓機關瞭解參加活動的整體情形，陸委會因此建議參與之官員，返臺後宜向服務機關提具參訪報告。
民國九十七年十二月廿一日(2008.12.21)
馬英九總統出席「中華民國釋憲60年」研討會，致詞時表示，他在政見中提到「不統、不獨、不武」，不統是任內不會與中國大陸討論兩岸統一的問題，不獨是我們不會追求法理台獨，不武是反對使用武力解決台灣問題，這個主張是在中華民國憲法的框架下維持台海現狀。而兩岸非國與國關係，是因為中華民國是一個主權獨立的國家，不可能承認中國大陸是一個主權獨立國家，一個是國家、一個不是，所以兩岸當然不是國與國的關係。在憲法增修條文第11條架構下，中國大陸就是大陸地區，因此完全沒有自我矮化的問題，完全依憲法增修條文及兩岸人民關係條例所規定。
民國九十七年十二月廿三日(2008.12.23)
行政院大陸委員會就大貓熊來台事宜指出，中國大陸核發之大貓熊出口證明完全參照過去台灣自中國大陸進口保育類動植物之證書及格式，證書之進口地點及進口口岸分別以「台灣台北」及「TW TAIPEI」表述我方，並無任何矮化的問題。至於出口地點及出口口岸分別以「四川汶川縣」及「CHENGDU」表述，是依實際情形記載，我方不應自我矮化為「城市對城市」的模式。
民國九十七年十二月廿四日(2008.12.24)
行政院大陸委員會賴幸媛主任委員出席「新時代、新兩岸關係」彰化縣菁英座談會時表示，新政府的大陸政策是以保障臺灣安全、彰顯臺灣的主體性、繁榮臺灣經濟及維持臺海和平穩定與東亞的和平發展為目標。近期政府推動之兩岸兩會制度化協商及各項大陸政策開放措施，都是秉持「以臺灣為主，對人民有利」的原則，及在「深耕臺灣、全球連結」的總體經濟發展戰略下的積極作為，目的是為提升臺灣的競爭力，而非向中國大陸傾斜。
民國九十七年十二月廿四日(2008.12.24)
新聞局長史亞在年終記者會宣布，將陸續開放大陸歌手、兩岸合拍電視劇和電影演員、技術人員來台拍片，及大陸發片歌手來台舉行演唱會等。而政府也希望大陸開放刊號、書號給我出版業者，協助業者拓展華文市場，這已納入兩岸兩會協商的項目之一。
民國九十七年十二月廿五日(2008.12.25)
行政院長劉兆玄在院會中聽取內政部報告「臺灣地區公務員及特定身分人員進入大陸地區許可辦法」等修正草案後表示，放寬簡任第11職等以上公務員及政務人員赴大陸從事公務及交流活動，並開放大陸高階政務人員來台參訪，是我們執行開放、展現自信的具體表現，不僅有助於公務員深入瞭解中國大陸，同時對營造兩岸良性互動，也有正面意義。
民國九十七年十二月廿五日(2008.12.25)
內政部入出國及移民署修正、公布「臺灣地區公務員及特定身分人員進入大陸地區許可辦法」、「簡任第十職等及警監四階以下未涉及國家安全機密之公務員及警察人員赴大陸地區作業要點」及「大陸地區專業人士來臺從事專業活動許可辦法」等3法案。
民國九十七年十二月廿五日(2008.12.25)
行政院大陸委員會公布最新民調顯示，近七成民眾（67.9%）贊同兩岸直航有助於提升台灣競爭力，同時也有六成以上的民眾 （61.7%）認為直航對台灣經濟發展有「好的影響」。
民國九十七年十二月廿八日(2008.12.28)
馬英九總統出席行政院大陸委員會主辦的「行政院暨所屬機關高階主管大陸工作研習會」時表示，政府各部會在兩岸關係中，應主動找出「以台灣為主對人民有利」的政策，並設法成為可以讓海基會與海協會進行談判、討論的議題，兩岸間的交流並非只限於交通、經濟，在文化、教育環保等議題都可能有需要進行談判。
民國九十七年十二月卅一日(2008.12.31)
針對中共國家主席胡錦濤談話，行政院大陸委員會新聞稿表示，兩岸雙方應本「擱置爭議，追求雙贏」，繼續邁出穩健步伐，透過良性互動，共創兩岸關係和平發展新局。有關和平協議與軍事互信機制等議題，將在兩岸關係達到相當程度的互信後研議推動，目前雙方處理的經濟、文化交流事務與協商，都是民眾最關切、亟待解決的議題，也都是為累積互信奠定堅實基礎。大陸當局應深刻體認台灣人民對於參與國際社會的期望與需求，將和平發展理念延伸至兩岸在國際、軍事與政治層面的互動，展現智慧開創兩岸共存共榮之道。