馬英九總統在高雄港出席慶祝長榮海運立敏輪兩岸直航首航儀式時表示，兩岸直航代表兩項意義，一方面是兩岸和解不再走過去對立衝突的路線，也就是用談判取代對立、以和解取代衝突，兩岸共同謀求和平與繁榮；另一方面則從經濟面著眼，兩岸在空運、海運直航上，都可以節省大量的時間及成本。
總統進一步表示，兩岸直航後，不但在海運或空運節省運輸成本，也為兩岸佈局展現新情勢，他期盼大家能利用此一新情勢重新規劃企業佈局。
總統表示，高雄港自2000年起，在世界貨櫃運輸的地位不斷下滑，但開放直航後，高雄港無論在兩岸間的運量，或未來轉口貨運量，都將有增加的空間，但商機並非從天而降，是要靠自己的努力爭取。
總統表示，兩岸直航是歷史新階段，要好好思考、規劃如何將機會發揮最大的效果，他鼓勵所有參與兩岸直航工作的政府相關部門及民間企業，不但要貫徹所投入的努力，也要展現執行力，進而提升台灣的國際競爭力。
資料來源：總統府網站，民國97年12月15日