行政院大陸委員會賴幸媛主任委員在新聞局有關「第二次江陳會」的記者會中表示，海基會在陸委會充分授權下，配合相關部會協商完成了四項議題的簽署，奠定兩岸兩會制度化協商正常運作機制，對促進兩岸關係正常發展具有重要意義。這些意涵包括：進一步落實制度化協商機制，大幅提升兩岸互動層級，突出兩岸現階段協商重點，體現兩岸對等協商與互動的新模式，穩定兩岸關係、促進區域和平。
賴主委指出，馬總統及她本人在會見陳雲林會長一行時，特別強調兩岸應「正視現實、互不否認、為民興利、兩岸和平」，以及兩岸在國際空間及軍事對立的不合理現實，有助大陸方面及國際社會瞭解我方的立場與原則。
賴主委最後指出，未來雙方將針對下一階段優先協商議題進行討論，包括：加強兩岸交流秩序（共同打擊犯罪、擴大食品衛生安全合作、農產品檢疫檢驗）；兩岸金融合作（建立銀行監理合作機制、兩岸證券及期貨監理備忘錄，推動兩岸金融往來）；兩岸經貿合作（兩岸投資保障協議、避免雙重課稅、兩岸經貿糾紛調處機制、兩岸標準檢測及認證合作，及兩岸智慧財產權保護）等領域，雙方都有很高的意願進行後續磋商，有共識者將納入下一次會談簽署協議的範圍。
資料來源：陸委會網站，民國97年11月7日