馬英九總統在記者會中指出，新政府兩岸政策基本的原則，是在中華民國憲法的架構下，維持海峽兩岸「不統、不獨、不武」的現狀，而在具體的政策上，秉持「以台灣為主、對人民有利」的原則來推動。
總統強調，中華民國當然是一個主權獨立的國家，已經存在97年，這是不能改變的事實，沒有人能夠改變的。台灣的前途是由台灣2300萬人民來決定。
總統表示，一向反對任何在台海使用武力的主張，「不統、不獨、不武」，就是這個意思。因此，一方面要追求兩岸的和平，一方面也要維持堅強的國防、維持兩岸和平，我們採取各種方式，包括促進雙方的往來、貿易、投資、旅遊、金融，讓雙方能夠在許多其他的方面建立良好的關係，降低衝突的風險。
總統強調，會接見海基會、海協會參加協商的人員，接見的身分是中華民國總統。中華民國是一個主權獨立的國家，主權獨立已經97年了，是以這個身分接見，接見的地方是在我們總統府所屬的台北賓館，接見的節目是由總統府的官員安排，清清楚楚，我的身分沒有任何改變。
總統再次強調，兩岸關係是非常複雜的關係，但是一定要好好的處理，不論是有關台灣的主體性、國家的主權，以及有關國防跟外交，都是非常的審慎。我們努力拓展國際空間，也不只是限於邦交國跟無邦交國，對於參加國際組織以及國際活動，也都會積極的推動。
資料來源：總統府網站，民國97年11月6日