兩岸兩會於99年6月29日簽署「海峽兩岸經濟合作協議」，協議文本內容為序言、五章、十六條，主要內容包括：雙方將「遵循平等互惠、循序漸進的原則」，「本著世界貿易組織（WTO）基本原則，考量雙方的經濟條件，逐步減少或消除彼此間的貿易和投資障礙，創造公平的貿易與投資環境」；明定協議的目標及合作措施；貨品貿易協議、服務貿易協議與投資協議等之後續協商範圍及啟動時程；經濟合作範圍有智慧財產權保護、金融、海關、貿易便捷化、電子商務、產業合作、提升中小企業競爭力以及經貿團體互設辦事機構等領域；早期收穫規定雙方在協議生效後，儘速享有部分貨品降免稅與服務業開放利益的項目，並建立相關配套措施，例如臨時貿易救濟規則、臨時原產地規則等；相關配套安排，例如例外條款、爭端解決機制、機構安排（由雙方成立「兩岸經濟合作委員會」）、文書格式、附件及後續協議（構成本協議的一部分）、修正、生效、終止條款等。
效益：
兩岸協議執行成效專區