民国一百零二年一月一日(2013.1.1)
马英九总统以「奋起行动，扭转未来」为题发表元旦祝词时表示，两岸和平是亚太和平的基础之一，也是促进经济发展与提振投资意愿的必要条件，未来中华民国要继续在东亚扮演推动和平与促进繁荣的建设性角色。总统也表示，盼望与中国大陆新领导人习近平先生，在巩固「九二共识，一中各表」的基础上，持续推动两岸和平发展，全面扩大与深化两岸交流，并将加速「两岸经济合作架构协议」（ECFA）的後续协商，进一步放宽陆资与陆生来台及陆客自由行，以及通盘检讨与修正「两岸人民关系条例」。此外，政府也将积极推动两岸两会互设办事机构。总统并表示，两岸人民同属中华民族、都是炎黄子孙，两岸领导人都应该将确保台海永久和平当成首要之务。而两岸交流越制度化，两岸人民对彼此的认识越深入，两岸的和平也就越巩固。
民国一百零二年一月三日(2013.1.3)
行政院大陆委员会公布最新民调显示，高达7成6(76.4%)的民众支持政府进一步深化两岸在人权、法治、经贸、文教、公民社会等各项交流，以增进两岸民众的相互了解；并有4成2(42.8%)的民众认为持续推动两岸民主、人权、法治等领域的对话与深度交流，对大陆将发挥正面的影响。有6成7(67.1%)的民众认为政府应适度开放陆资来台，且有6成(60.3%)民众表示开放大陆资金来台投资，有利平衡两岸投资发展，对两岸经贸往来有所助益。对两会互设办事机构，有64.2%的民众持赞成的立场。至於办事机构的功能与职掌，有70.2%民众赞同海基会在大陆设立的办事机构，能落实官方办事机构的功能与业务。整体而言，大多数(71%)的民众认为两岸的海基会和海协会互相设立办事机构，有助於两岸关系的发展。此外，在通盘检讨修正两岸人民关系条例方面，有多数(72.4%)民众认为政府全面检讨并分阶段修正，符合民众实际需求，并能落实来台湾的大陆人民的人权及平等权(67.5%)，对於政府规划分阶段进行两岸人民关系条例修法政策亦予以肯定。
民国一百零二年一月七日(2013.1.7)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，部分人士使用「内地」称呼中国大陆，陆委会认为并不妥适。政府向来支持两岸演艺与流行音乐等多方面交流，同时在「黄金十年．和平两岸」施政主轴中，已揭示拓展台湾影音、出版品进入大陆，以推广台湾核心价值与软实力。陆委会呼吁国人在两岸交流相关场合，应秉持对等尊严原则，使用符合现行法令规定及国内民众感受的用语称呼大陆。
民国一百零二年一月八日(2013.1.8)
针对大陆媒体「南方周末」新年特刊遭到大陆官方删改事件，行政院大陆委员会发布新闻稿表示，尊重新闻自由是普世价值，媒体言论自由应受到保障。同时，陆委会非常关心大陆新闻自由的相关发展，希望透过两岸媒体的互动与交流，让大陆感受到台湾自由的新闻环境，促进两岸资讯对等流通，并带给大陆新闻环境改革的动力。
民国一百零二年一月十四日(2013.1.14)
马英九总统出席「102年全国大专校院校长会议」致词时表示，政府将以中国大陆「二一一」工程所涵括学校为目标，逐步扩大对其学校学历之承认范围，并积极招收大陆专科学生至我国2年制技术学院进修，以持续提升我国高等教育之竞争力及合作机会。
民国一百零二年一月廿三日(2013.1.23)
马英九总统出席「2013年世界自由日庆祝大会、世盟中华民国总会第57次会员代表大会暨世亚盟年会」时强调，台湾过去历经戒严时期与两岸对抗，令人深刻体认「没有和平，就不易有自由与民主」，决定以和平方式解决两岸争端，因而快速改善两岸关系，目前双方已签署包括开放直航、陆客来台、核能安全及共同打击犯罪等18项协议及达成两项共识。显示两岸可透过和平方式消弭歧见，并能「搁置争议、共创双赢」，有效化解冲突。总统进一步表示，两岸关系改善後，我国的国际空间也随之扩大，同时政府期盼与中国大陆的对话，从经济、贸易、文化，进一步扩展到人权与法治，让对岸民众了解我方的努力与作为，以及对民主的实践。
民国一百零二年二月四日(2013.2.4)
马英九总统致函天主教教宗本笃16世，响应教宗「2013年世界和平日」文告。总统表示政府以建立两岸互信及推展和平交流做为政策主轴之一，我方在「九二共识、一中各表」及「互不承认主权、互不否认治权」之基础上，秉持「搁置争议」、「共创双赢」及「对等互惠」原则，与中国大陆签署18项协议及达成2项共识，为两岸和平、稳定及繁荣奠定基础。
总统指出，我方已就钓鱼台列屿主权议题提出「东海和平倡议」，希望「有意义对话以搁置领土争议」及「经由合作开发共享资源」，并力促台、日及中国大陆三方从「三组双边对话」迈向「一组三边协商」，以解决区域争端，达成东海和平之目标。
民国一百零二年二月六日(2013.2.6)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员在年终记者会表示，将逐步落实「黄金十年?和平两岸」国家愿景揭櫫的政策方针，积极优先推动三项大陆工作重点：
（一）「扩大并深化两岸各层面交流」：政府将循序渐进推动两岸经贸关系，除将加速进行ECFA的後续协商，包括服务贸易、货品贸易、争端解决协议等，并将持续进行两岸经贸政策之松绑调整，及完备相关安全管理机制。另将持续配合教育部全面检视陆生来台就学相关配套措施，及加强推动两岸环保、人权、妇女、新闻等领域的民间团体交流互动，以及两岸资讯对等及自由流通。
（二）「通盘检讨与修正两岸人民关系条例」：今年上半年的检讨重点，包括：在公务部门从事不涉及公权力行使之劳务性工作、民事章选法规则的检讨、大陆地区人民继承，以及配合两岸互动新局及经贸需求，重新检讨大陆广告管理规范等事项。
（三）「推动两岸两会互设办事机构」：初步规划在大陆台商、台生等聚集处，逐步设置多个海基会办事机构，并希望具备经贸、文教、交流、联系、急难救助协处等综合性服务功能，以服务国人为首要目标。我方也将在「对等、尊严」的前提下与陆方进行协商，并尽早完成设置。
王主委也表示，希望大陆方面务实面对两岸隔海分治的现实，在各个领域，包括国际社会与NGO合作等方面，相互尊重、友善对待。
民国一百零二年二月十八日(2013.2.18)
马英九总统出席「2013年大陆台商春节团拜暨联谊餐会」致词表示，政府在中华民国宪法架构下，维持台湾海峡「不统、不独、不武」的现状，并在「九二共识、一中各表」的基础上推动两岸和平发展，未来将朝进一步扩大并深化两岸交流、两岸两会互设办事机构、通盘检讨并修正「两岸人民关系条例」等三项目标努力迈进。
民国一百零二年二月十八日(2013.2.18)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席海基会「2013大陆台商春节联谊活动」致词时表示，政府将持续秉持「搁置争议、共创双赢」的原则，在「九二共识，一中各表」的基础上，逐步推动及巩固两岸和平发展。王主委也表示，今年优先推动的工作重点，包括：在「扩大及深化两岸交流」方面，将加快ECFA後续协商的进度，包括争取在今年上半年签署服务贸易协议，以及在今年底前完成货品贸易协议及争端解决协议的协商，并检讨松绑相关法规；在「通盘检讨两岸条例」方面，将依据急迫性，分区块、分阶段尽速完成；在「两岸两会互设办事机构」方面，将以「公开透明」的原则充分与国会和社会各界沟通，盼尽早完成设置。
民国一百零二年二月廿日(2013.2.20)
马英九总统出席外交部举办的「中华民国102年新春联欢晚会」时强调，政府坚持在中华民国宪法下，维持海峡两岸「不统、不独、不武」的现状，并在「九二共识」的基础上，持续推动两岸和平发展。「两岸关系和平发展」与「国际关系持续扩大」两者不冲突，两岸已从过去的恶性循环转变为良性循环。
民国一百零二年二月廿五日(2013.2.25)
行政院大陆委员会针对国民党荣誉主席连战与中共总书记习近平会晤发布新闻稿表示，任何有助两岸沟通的交流活动，政府乐观其成。政府将持续秉持「九二共识、一中各表」所蕴含搁置争议、相互尊重的精神，期盼两岸关系能在一个稳定繁荣的基础上，共同为两岸人民谋求更大的福祉与利益。
民国一百零二年三月五日(2013.3.5)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，新闻自由是普世价值，大陆方面应积极尊重、维护与保障新闻自由，并重申两岸新闻交流最重要的是资讯对等交流与自由流通，两岸应优先处理的新闻交流议题应是大陆停止封锁台湾新闻网站，同意台湾杂志到大陆发行，以及停止大陆电台干扰台湾电台节目的播出。
民国一百零二年三月七日(2013.3.7)
马英九总统出席「傅尔布莱特年度研讨会」时表示，自今年秋天开始，将有更多陆生来台就学，且计划开放技职体系学生来台，完成2年的学业课程後即可获得正式学位，期使两岸青年於人生的早期阶段即能获得更多相互交流的机会，为未来和平稳定的发展奠下重要基础。
民国一百零二年三月十四日(2013.3.14)
行政院大陆委员会发布新闻稿针对近期大陆召开「两会」会议，并提出未来两岸关系发展相关看法表示，未来我政府将优先推动维护两岸人民权益及促进台海和平的大陆政策，包括在交流面、法制面的深化与调整，以及推动两会互设办事机构，进一步服务国人。对於大陆「全国人大」会议选出新任领导人习近平，期许双方珍惜两岸良性互动与交流所积累的丰硕成果，共同为两岸人民幸福努力。陆委会指出，展望两岸新局，我政府仍将依循「九二共识，一中各表」的既定立场，期盼双方能继续秉持「搁置争议、共创双赢」的原则，持续深化互信，以追求和平稳定、互利双赢的两岸关系。
民国一百零二年三月十七日(2013.3.17)
行政院大陆委员会发布新闻稿针对大陆举行「全国人大」会议闭幕後中外记者会之相关发言表示，中国大陆近期在行政革新、经济民生及社会公平正义方面，提出许多改革方向，我政府表达肯定，并期许未来两岸之间能够针对相关的改革发展面向，共同合作、相互提升，进一步促进两岸关系的互信与互利。陆委会表示，两岸近5年来的良性互动成果，得来不易，双方应善加珍惜。未来我政府将秉持既定的政策目标与推动步伐，持续推动两岸制度化协商，扩大、深化两岸各领域的交流互动，增进两岸互信。陆委会强调，中华民国是我们的国家，台湾是我们的家园，两岸应秉持「相互尊重、互利共荣」的精神，共同为两岸和平稳定与人民福祉而努力。
民国一百零二年三月廿一日(2013.3.21)
马英九总统出席美国商会「2013年亚太区美国商会年度大会」暨「2013谢年饭」时表示，政府积极改善两岸关系，迄今双方签署18项协议及2项共识，不但扩大两岸经贸关系，也增加外商来台投资诱因。两岸两会将互设办事处，期使两岸事务制度化，除可成为台湾最佳防线之一，并可强化对双边人民之服务，进一步提升我与大陆之关系。
民国一百零二年三月廿一日(2013.3.21)
行政院大陆委员会吴美红主任秘书在例行记者会表示，3月中旬，两岸双方已就两岸两会互设办事机构议题进行第二次副秘书长层级非正式沟通，双方同意将「两岸两会互设办事机构」议题，正式列入两会协商议程，并适时启动正式业务沟通。
民国一百零二年三月廿二日(2013.3.22)
行政院大陆委员会公布最新民调显示，近8成的民众（79.3%）支持两岸持续进行电视、电影、广播、新闻等大众传播领域的交流，促进两岸资讯的流通；并有7成2的民众（71.9%）肯定两岸媒体的交流，可让大陆媒体实际体会台湾新闻自由的环境。而对於大陆管制台湾新闻网站的作法，将近7成民众（69.8%）认为对两岸新闻资讯的自由流通会产生不好的影响。至於长期观察的两岸议题，民调结果显示，主张「广义维持现状」的民众仍占大多数（86.1%），维持一定的稳定性。对目前两岸交流的速度，认为「刚刚好」的民众有45.2%，另认为「太快」及「太慢」的比例分别为31%及13.2%。此外，有近7成（68.7%）的民众支持政府持续透过制度化协商来处理两岸的交流问题。
民国一百零二年三月廿六日(2013.3.26)
行政院大陆委员会主任委员王郁琦接受中央社专访时指出，两岸不是国与国关系，海基会和大陆海协会互设办事机构避免形成此一印象，并表示办事机构涵盖经贸、文化、教育、联系、交流、急难救助协处等功能，双方已达成初步共识。对於办理旅行证件等业务，两岸将持续沟通，政府也会积极争取，以提供两岸人民更好的实质服务。王主委也表示，修改陆配取得身分证年限与推动陆生纳保是近期推动重点工作，希望让陆配与陆生享有公平对待。此外，王主委指出当前两岸协商议题非常多，同时考虑台湾内部仍没有达成共识，两岸政治性议题或和平协议目前没有急迫性，不是政府优先推动事项。
民国一百零二年四月二日(2013.4.2)
马英九总统接见参加「2013博鳌亚洲论坛」我方代表团时表示，过去4年多来，两岸间已签署18项协议并达成2项共识，未来数月内将针对「服务贸易」部分进行协商，以及於年底前完成「货品贸易」协商。总统进一步指出，两岸应持续进行经济合作，尤其是落实ECFA各项协议的执行。总统强调，两岸政策系在中华民国宪法架构下，维持台海「不统、不独、不武」的现状，并在「九二共识、一中各表」的基础上，推动两岸交流，经过5年多的实践，证明这是一条可行的道路，不仅能促进两岸交流，更为我开启国际参与的大门。
民国一百零二年四月七日(2013.4.7)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，为因应大陆地区人类H7N9流感疫情升高，卫生署已将「H7N9流感」公告为第五类法定传染病，并成立中央流行疫情指挥中心。陆委会表示，已透过海基会运用台商经贸网及台商协会，加强卫教的宣导，并协助蒐集了解大陆相关疫情资讯。陆委会强调，由於两岸人员互动频繁，将配合中央流行疫情指挥中心的作业，持续关注大陆的疫情发展，适时采取必要的防疫作为。
民国一百零二年四月十三日(2013.4.13)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，行政院院会於102年4月11日通过「大陆地区处理两岸人民往来事务机构在台湾地区设立分支机构条例草案」，并送请立法院审议。本草案内容采概括授权方式，一方面系因两岸条例也采取相同的立法体例，另一方面系考量双方刻正进行沟通与协商，为符合法律保留原则并确保我方谈判空间，相关办法及授权事项於协商确定後，将报请行政院核定，并依中央法规标准法及立法院职权行使法之规定，践行国会监督程序，政府就法制面与执行面一定会进行充分准备及完善配套，在协商过程中也将秉持对等、尊严的原则，就协商进度与协商共识，以公开透明之原则，充分与国会、社会进行沟通、说明，减少民众的疑虑。
民国一百零二年四月十六日(2013.4.16)
马英九总统与美国史丹福大学「民主、发展暨法治中心」(Center on Democracy, Development, and the Rule of Law, CDDRL)进行视讯会议时指出，我国政府为确保台海和平，以「九二共识」为基础提出许多务实作法，包括在中华民国宪法架构下，维持「不统、不独、不武」的三不政策，同时建立互信，并使两岸人民受惠。我方主张「主权互不承认，治权互不否认」，让两岸能进行实质交流，不因对主权问题的歧见而受影响。
总统表示，政府对两岸对话的规划是「先急後缓、先易後难、先经後政」，透过这种「堆积木」的作法，是追求台海永久和平的唯一路径。两岸在过去五年间签署18项协议，内容涵盖直航、观光、经济合作、智慧财产权、核能安全及司法互助等议题。未来三年，两岸可望完成「经济合作架构协议」(ECFA)下的服务贸易及货品贸易协商，教育及文化的交流也将大幅增加。此外，双方亦规划在对方的主要城市设置办事机构，以服务往来於两岸间的7百万人民，及照顾流通於两岸间、价值1千6百亿美元的货品及服务。
民国一百零二年四月廿二日(2013.4.22)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，针对大陆四川省雅安日前发生强震，造成人员严重伤亡，我政府基於人道关怀，行政院决定参照大陆青海玉树地震、甘肃舟曲土石流等灾害，由政府捐助美金100万元，并透过海基会转交大陆海协会，协助当地震灾重建。
民国一百零二年四月廿九日(2013.4.29)
马英九总统出席「辜汪会谈20周年纪念茶会」，致词时表示，政府推动大陆政策及两岸关系，必将在中华民国宪法架构下，秉持「以台湾为主，对人民有利」的原则，依循「先急後缓、先易後难，先经後政」的优先顺序来处理。两岸这五年来和平互利的交流，为东亚与世界树立了一个以和平方式解决争端的正面范例，期望两岸能持续在「九二共识，一中各表」的基础上，推动和平与繁荣；同时在「主权互不承认，治权互不否认」的认知下，扩大与深化两岸在经贸、文化、科技、环境、社会、法治及人权等各个领域的交流互动，促进两岸人民更深入的了解与更广泛的合作。
民国一百零二年四月廿九日(2013.4.29)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席「辜汪会谈20周年纪念茶会」，致词时指出，1993年，两岸因「辜汪会谈」终结了历经数十年的隔阂，而当年所搭建的两岸制度化协商管道，也解决了两岸交流衍生的问题，维护两岸人民的权益与福祉，「辜汪会谈」树立两岸「搁置争议、相互尊重、对等互动」的协商典范。近5年来，两会高层共举行了8次会谈，并透过两会的电话热线，即时、有效地解决两岸互动往来的各项问题与争议。更重要的是，透过18项协议的签署，建立两岸政府间「机制对机制」的平台，让双方能够在许多跨境行动上充分合作。未来，政府仍将持续扩大、深化两岸各层面的交流，让两岸人民有更多的机会互动，了解彼此，进一步能够相互包容，两岸关系才能走得更稳健、更长远。
民国一百零二年五月七日(2013.5.7)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员接受中国时报专访表示，两岸政治议题复杂，大陆如能正视「互不否认治权」，就是两岸关系的一大进展；政府现阶段优先推动的事项，包括：扩大深化两岸交流、互设办事机构、通盘检讨两岸关系条例。对於两岸新闻交流，王主委呼吁大陆应正视台湾的期待，开放网路封锁、解决广播电波盖台、开放杂志登陆发行；陆委会也将持续补助民间团体，邀陆媒来台参访，体验台媒的新闻自由环境。此外，王主委表示，两岸签署服贸协议，将扩大台湾的投资机会、增加就业机会，对於部分产业受到冲击，政府也会妥适安排。
民国一百零二年五月七日(2013.5.7)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员接受联合报专访表示，两岸两会互设办事机构，是要就近服务在地的大陆台商、台生等，政府将极力争取办事机构拥有旅行签证与人道探视的实质功能；双方也会订定办事机构的行为规范，不能任意干涉对方内部事务。王主委表示，台湾在两岸互动中，以包容多元文化、实践民主制度，及尊重人权等价值，引以为傲。我们应尽最大努力接纳陆配，使其融入台湾社会；并善待陆生，让他们内化台湾引以为傲的价值。
民国一百零二年五月十六日(2013.5.16)
马英九总统出席「2013世界国际法学会亚太论坛」开幕式致词表示，两岸关系不是国与国关系，而是一种特殊的关系，两岸之间没有国际法上的承认问题。政府提出两岸「互不承认主权，互不否认治权」主张，符合中华民国宪法，在宪法架构下，维持「不统、不独、不武」台海现状，这是对两岸现状最务实的描述与解释，也是消除双方敌意、搁置主权争议并促进两岸发展最好的方法。未来，政府将持续扩大及深化两岸互动，推动互设办事机构及通盘检讨「两岸人民关系条例」等，以达两岸和平繁荣发展的目标。
民国一百零二年五月十六日(2013.5.16)
行政院大陆委员会发布新闻稿指出，菲律宾射杀我国渔民事件与中国大陆所主张的「一个中国原则」毫无关系，我们认为的「一中」就是中华民国，希望各方能充分认知此点，避免处理事件过程中，伤害我方人民感情。
民国一百零二年五月廿七日(2013.5.27)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员在「两岸服务贸易协议」背景说明会致词时表示，政府秉持「以台湾为主、对人民有利」、「对等、尊严、互惠」及「国家需要、民意支持、国会监督」的原则，推动两岸制度化协商。有关服务业的市场开放，由各服务业主管机关依据「利益极大化、冲击极小化」的原则，与陆方主管部门进行沟通，以确保我方利益。王主委进一步表示，两岸服务贸易协议是两岸签署的第19个协议，也是两岸间依据ECFA及WTO服务贸易总协定（GATS）第5条完成的第一个自由贸易协议，有助於相关国家加速与台湾签署自由贸易协定的进程，并对台湾申请加入「跨太平洋战略经济夥伴」（TPP）及「区域全面经济夥伴关系」（RCEP）等区域经济整合协定的战略目标，累积更厚实的基础。同时，签署服务贸易协议是扩大及深化两岸交流的指标性工作，展现政府施政的决心；也显示双方落实ECFA的诚意，展现互信基础的扩大，相信在这样的基础上，ECFA後续的货品贸易协议、争端解决协议，或是其他的两岸协商议题，终将能顺利签署。王主委也表示，两岸服务贸易协议的协商为後续进一步的协商打下基础，两岸经贸迈入全面交流与合作的时代，并具体提升ECFA效益。
民国一百零二年五月三十一日(2013.5.31)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员在接受自由时报专访时表示，推动两岸两会互设办事机构最主要是基於现实需求，双方都认为服务两岸人民是最主要的目的，办事处的功能在推动经贸、文化、教育、社会相关的交流与联系，与急难救助的协处。政府了解互设办事机构具有高度的政治敏感性，因此政府与陆方经过两次两会副秘书长层级非正式沟通及两次主管机关间正式业务沟通後，已立即对国会媒体说明；旅行证件、通报、人道探视是国人关切的议题，此有助政府在面对陆方时，得以让对方知道相关议题必须严肃面对，未来政府也会以相同态度持续这麽做。
民国一百零二年六月四日(2013.6.4)
马英九总统在发表「六四」二十四周年感言时指出，近五年两岸关系大为改善，然而两岸间在人权实践上的落差，一直是拉近两岸人民心理距离的障碍，这种障碍透过两岸间人权经验的交流与对话，可以逐步缩小。大陆当局应以更宽广的胸襟包容异议人士，并衷心期望大陆新的领导阶层抓住机遇，开创人权新局。
民国一百零二年六月四日(2013.6.4)
行政院大陆委员会就「六四事件」24周年发布新闻稿表示，对「六四事件」的重新省思，是中国大陆深化改革的重要指标，中国大陆应以积极、坦诚的态度，正视「六四事件」的历史事实与对大陆改革发展的正面意义，并呼吁中国大陆从人道善待「六四」参与者及其家属做起，主动展现抚平伤口的诚意，在政治体制改革、人权促进与保障等方面，展现开创性决心，提升人民福祉。同时两岸也可以在交流、对话的过程中，就各项改革面向相互分享多元价值，促进两岸公民社会正向发展，以进一步深化双方互信、互利的关系，为两岸人民的幸福创造更有利的环境。
民国一百零二年六月六日(2013.6.6)
马英九总统在接受日本「共同通信社」专访时表示，两岸关系不是国与国的关系，是一种特殊的关系，因此双方签了18项协议，都不是在国与国的基础上签订，但并不妨害协议在双方所管辖的区域内发生效力。政府用务实的态度设计两岸交流的体系，并证明是可行的、成功的。
民国一百零二年六月十日(2013.6.11)
马英九总统在接见中国国民党吴伯雄荣誉主席大陆访问团时表示，政府以「一中各表、九二共识」等原则推动两岸关系，并在中华民国宪法的架构下，维持台海不统、不独、不武的现状，这些主张已成为发展两岸关系的重要基础。总统并表示，两岸之间不是国与国的关系，不会将我方在大陆设立的办事机构或大陆在台湾设立的办事机构当成外交使领馆；同时，有关人员的身分及保障、证照的申办及受刑人的探视等方面，都会有相关规定，但并非以两个国家的关系来看待，最主要的是，在我们的宪法架构下，我们不可能把海峡对岸看做是一个国家。
民国一百零二年六月十二日(2013.6.12)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，政府推动两岸关系的和平发展，系依据中华民国宪法及两岸人民关系条例，以务实定位两岸关系，也就是「一个中华民国、两个地区」。在国家定位上，政府依据中华民国宪法施政，绝无自我矮化或附和大陆「一个中国」原则的情形，并强调两岸两会互设办事机构是为了服务及保障两岸民众的权益。在协商过程中，包括社会各界关切的旅行证件申办、遭限制人身自由国人的人道探视，以及双方派驻人员的行为规范等各项权益保障与约束事宜，均不免具有政治敏感性，政府并未全然将之视为事务性议题，谈判过程中也都务实面对，并且积极争取我方最大利益，协商过程及相关法制作业也秉持一贯公开透明原则，充分向各界进行沟通，并接受国会监督。
民国一百零二年六月十四日(2013.6.14)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员在参加「2013大陆台商端午节座谈联谊活动」致词时表示，今年陆委会的3大工作重点「扩大及深化两岸交流」、「通盘检讨两岸条例」以及「两岸两会互设办事机构」等，已有具体进展，包括： 在「扩大及深化两岸交流」方面，「两岸投保协议」在今年2月1日生效之後，在我方提议之下，大陆方面已同意双方每3个月进行一次协处案件的检讨会议，确保协议的落实执行；此外，「两岸服务贸易协议」是两岸签署的第19个协议，将有助於相关国家与台湾签署自由贸易协定的进程，以及累积台湾申请加入TPP及RCEP的基础，对於吸引外资及陆资也都会有实质的效益。在「两岸两会互设办事机构」方面，目前双方已经进行多次业务沟通，对於办事机构推动两岸经贸、文化、社会、教育交流与联系，以及急难救助协处方面功能，双方已有共识。在「通盘检讨两岸条例」方面，除已送请立法院审议的法律修正案外，陆委会已会同相关机关修订33项两岸关系条例相关子法，相关修订将采滚动方式，与时俱进，持续进行检讨。
民国一百零二年六月十四日(2013.6.14)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，中华民国是主权独立的国家，依据宪法及两岸人民关系条例的规定，对两岸的定位就是「一个中华民国、两个地区」；因此，不论是所谓的「一中原则」、「一中架构」、「一中概念」，我政府对两岸关系的立场从未改变，「一个中国」就是中华民国。
民国一百零二年六月十八日(2013.6.18)
行政院大陆委员会公布针对两岸两会互设办事机构的民调结果显示，有7成以上民众赞同政府推动两会互设办事机构，直接服务与协助两岸人民(71.1%)，并有助两岸相互了解、降低敌意(75.4%)。另有近8成(78.7%)的民众认为海基会派驻大陆机构应具有办理旅行证件、通报与探视遭强制措施限制自由的台湾人民等业务功能。此外，有近7成(67.9%)民众赞同制定「大陆地区处理两岸人民往来事务机构在台湾地区设立分支机构条例」草案，做为未来海协会来台湾设立办事机构的许可和管理依据；并有7成2民众支持优先将法案送请立法院审议，以国会监督做为行政机关与大陆协商的基础。
调查结果也显示，有6成4民众赞成依对等原则，两岸直接指派政府官员於互设办事机构办理业务。此外，有8成4的民众支持政府争取海基会派驻大陆办事机构和人员的保障和便利待遇；并有8成民众认为两会以行为规范约束双方派驻人员，有助於保障我社会安全。
民国一百零二年六月廿二日(2013.6.22)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，服务贸易协议是ECFA完整版图中的一部分。此项协议的洽签，为我方业者赴大陆发展创造利基，有效提升及扩大ECFA具体效益。政府将在此基础上，进一步推进ECFA後续的货品贸易与争端解决之协商进程。另一方面，两岸服务贸易协议的签署，也是向国际社会传达台湾贸易将进一步自由化的讯息，有助台湾积极参与区域经济整合。
陆委会表示，有关第十次会谈协商议题部分，包括ECFA後续协商议题的货品贸易及争端解决、两岸避免双重课税、两岸两会互设办事机构等已有协商基础，并有阶段性成果；其他如气象、地震等议题，陆委会将协调主管机关，审慎研议并推动协商工作。另一方面，针对已签署的协议，陆委会也将持续协调相关部会，检视执行情形，并促使大陆方面合作改善，以扩大发挥协议执行成效。
民国一百零二年六月廿九日(2013.6.29)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，政党交流是民间交流的一环，也是民主社会的常态，但只要是涉及公权力事项之处理，仍须回归政府制度化管道处理。国共之间党对党的意见交流，对促进两岸交流深化与务实对话，扮演一定角色，执政党对相关政策的建议仅为政策参考，是「以党辅政」，没有「以党领政」的疑虑。陆委会强调，政府对於任何政党投入两岸交流或提出两岸关系建言，都表示欢迎。
民国一百零二年七月三日(2013.7.3)
马英九总统出席「ECFA服务贸易协议商机论坛」致词时表示，签署「两岸服务贸易协议」对台湾是个前进大陆市场的好机会；对於可能受贸易自由化影响之产业、企业与劳工，政府已拟定「因应贸易自由化产业调整支援方案」，针对不同对象采行振兴辅导、体质调整及损害救济等支援策略，提升其竞争力及辅导转型。总统并强调，为避免台湾在国际经济整合过程中被边缘化，政府将持续洽谈「货品贸易协议」，完备ECFA各项功能，让台湾创造更多贸易自由化条件，为我国未来加入「跨太平洋夥伴协议」（TPP），以及「区域全面经济夥伴协定」(RCEP)奠定有利基础。
民国一百零二年七月三日(2013.7.3)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席「102年度分区学者座谈会」时表示，两岸服务贸易协议为台湾服务业业者争取到大陆的庞大市场与广大商机，更为台湾加入区域经济整合奠定基础。王主委强调，透过两岸服务贸易协议的签署，以及未来两岸经济合作架构协议（ECFA）的後续协议，都是为台湾日後加入「跨太平洋战略经济夥伴」（TPP）及「区域全面经济夥伴关系」（RCEP）等区域经济整合协定及贸易自由化做好准备。王主委并表示，在推动两岸两会互设办事机构方面，两岸协商过程顺利，并已达成诸多共识，至於国内朝野高度关注的人道探视功能，我方仍会积极向对岸争取，政府也会秉持公开、透明的原则，随时向国人报告最新进展。
民国一百零二年七月五日(2013.7.5)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员接受NOWNEWS专访时表示，服务贸易协议所引发争议，政府会充分进行说明。同时，也会尊重立法院的审查程序。对於两岸两会互设办事机构，不少人担忧海协会在台机构，恐演变为香港中联办，这是绝对不会发生的情况；且当对岸人员到台湾，一定要有行为规范，这点双方在协商过程中，已有非常清楚的表达，对方也完全了解。此外，未来两会办事机构人员派驻，所有人员都需经过对方同意。
民国一百零二年七月八日(2013.7.8)
马英九总统接见「财团法人财经立法促进院」财金专家学者时表示，签订「两岸服务贸易协议」是为了开拓台湾整体对外经济版图，并维持市场占有率。对於外界担心台湾产业可能面临的冲击，政府已对外澄清，计程车、中药零售及出版等产业均未列入开放。总统并进一步表示，未来如发生垄断或寡占等情事，政府除可适用相关法规，必要时甚至可要求陆方撤资，而「两岸服务贸易协议」亦订有紧急情况的磋商条款。若确有厂商受害，也可依「两岸经济合作架构协议」签署前所订定的「因应贸易自由化产业调整支援方案」，予以协助。
民国一百零二年七月十一日(2013.7.11)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席中华民国旅行商业同业公会全国联合会之「两岸服务贸易协议内容说明会」时表示，「服贸协议」开放两岸旅行社互设，业者担心市场开放会造成冲搫，政府部门会进行审慎的评估与考量；且陆资来台投资观光游乐业，要依据我国相关法令来处理、严密审查，并不会对我国内旅游市场造成太大影响。王主委也表示，大陆方面在服务贸易开放80项服务业，包括电子商务、文创、运输、金融和观光旅游等，这些都超越世界贸易组织(WTO)待遇；而我方所开放的64项产业中，政府也已经建立完善的审核机制，对陆资来台设下必要关卡，不会产生太大的冲击。
民国一百零二年七月十九日(2013.7.19)
马英九总统接见「世界台湾商会联合总会」第19届重要干部回国访问团表示，两岸恢复制度化协商以来，迄今年6月，双方已签署19项协议及2项共识，改变两岸的经济情势。同时，我国也连续5年获邀以观察员身分率团出席「世界卫生大会」（WHA）；并加入「政府采购协定」（GPA），此均显示政府改善两岸关系的同时，也促成我国际参与的增加，两者形成相辅相成的良性循环。此外，签订「两岸服务贸易协议」政府没有开放大陆劳工来台工作、大陆人民来台投资移民、大陆计程车业者来台投资、大陆出版业来台投资及大陆中药材零售业来台投资等「五个没有」，希望台湾服务业能把握商机、稳健向前。
民国一百零二年七月廿日(2013.7.20)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员在高雄市左营区旧城城隍庙「庙口宣讲活动」中表示，政府基於三大理由与大陆签署两岸服务贸易协议，包括大陆市场广大，要为国人抓住大陆商机；吸引陆资来台，为台湾子弟增加在地工作机会；以及台湾加入区域经济整合。王主委并强调，服贸协议只开放大陆资金来台，并没有开放大陆劳工来台工作，国人对此无须忧心。
民国一百零二年七月廿三日(2013.7.23)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席全国商业总会「两岸服务贸易协议说明会」致词时表示，两岸服务贸易协议是两岸依据ECFA和WTO服务贸易总协定所完成的第一个自由贸易协定，象徵与实质意义兼具。两岸不仅在投资意愿、贸易环境和市场开拓方面都创造了有利空间，也对ECFA後续协议的协商增添积极的推进力。未来，服贸协议往来制度化後，将可以使我方业者享有提高持股比例、增加业务范围和贸易便利化等开放内容，协助台商以优惠的条件拓展大陆服务业市场，无论大企业或中小企业，都能够藉由这次协议，让台湾的品牌及产品可以更深入大陆的市场。同时也扩大吸引陆资来台投资，让市场更加活络。王主委并表示，服贸协议也规定，必须确保用合理、客观且公正的方式，执行所有影响服务贸易的措施，双方也约定建立联系机制，作为处理协议以及相关事项的方式，这些规范都有助於处理台商赴陆所遭遇到的潜规则问题。
王主委也指出，服贸协议确实会带来影响，我方市场相对应的开放，也势必产生若干冲击，不过整体而言，绝对是「利大於弊」的影响；因为台湾是有实力的，台湾社会所孕育出来的人文素养，让台湾的服务业变成我们的强项，台湾的服务业是市场开放中的获益者，不需要过度担心害怕。
民国一百零二年七月廿五日(2013.7.25)
马英九总统接受美国「彭博新闻社」（Bloomberg News）专访时表示，两岸领导人见面，包括场合、身分等等都非常重要，因为身为中华民国的总统，到任何地方去，都要维持这样的身分。我们没有排除与中国大陆领导人习近平晤面，但必须国家有这个需求，且获得人民的支持，并有一些条件需要双方共同创造。
民国一百零二年七月廿五日(2013.7.25)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席「两岸企业家峰会」成立大会致词时表示，两岸经贸的交流与合作，奠定双方和平稳定发展的基础，而经济上的互利与互补，也为两岸人民带来福祉与红利；两岸经贸关系也存在著竞争，如何在确保台湾经济自主性的前提下，让两岸优势互补的关系持续朝正面的方向发展，如何将利益极大化，风险极小化，一直是政府推动两岸经贸政策的重要课题。政府和业界可以透过各种平台，让社会大众感受到两岸经贸合作的正面效益，将更有利於政府推动两岸经贸政策与法规松绑工作。中国大陆在世界经济体系里的地位越来越重要。王主委表示，在区域经济整合的趋势下，两岸不仅需要从更宏观的视野和格局，来思索两岸产业合作和企业合作的战略和战术，也需要企业界从实际操作面，由下而上，给予政府支持和建议。
民国一百零二年七月廿七日(2013.7.27)
马英九总统出席「两岸服务贸易协议」庙口宣讲活动致词时表示，3年前政府与中国大陆签署「两岸经济合作架构协议」（ECFA），其中「两岸服务贸易协议」即为其中一部分，而年底亦盼与对岸签署「两岸货品贸易协议」，以促成其他国家与我国签署「经济合作协议」，并有效降低我出口关税。总统强调，「开放带来兴旺，闭锁必然萎缩」是台湾历史上重要的定律，因此台湾一定要对外开放，否则市场规模将愈来愈小，而签署「两岸服务贸易协议」所带来的利益绝对大於弊害。
民国一百零二年八月一日(2013.8.1)
马英九总统在接见中华民国全国工业总会全体理、监事时表示，我与中国大陆将持续洽谈「货品贸易协议」，以完备ECFA各项功能，让台湾创造更多贸易自由化条件，为我国在未来加入「跨太平洋夥伴协定」（TPP），以及「区域全面经济夥伴协定」（RCEP）奠定有利基础。
民国一百零二年八月三日(2013.8.3)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席花莲县胜安宫举办庙口宣讲活动时表示，两岸服务贸易协议的签署，是台湾经济持续发展的重要一步；服贸协议没有开放大陆劳工来台，也没有开放大陆投资移民、计程车业、印刷业，以及中药零售业等来台。王主委进一步表示，在开放过程中，政府一定会谨慎把关、有效控管，建立有效的审核机制，绝对会把对台湾产业的冲击降到最低。
民国一百零二年八月五日(2013.8.5)
马英九总统出席「2013年东海和平论坛」开幕式时表示，政府大幅改善两岸关系，并与中国大陆签署19项协议及达成2项共识，且在许多领域已获得具体成果，此显示两岸关系现正处於60年来最稳定与和平的状态。总统表示，「东海和平倡议」是两岸和平之後续发展，中华民国希望从两岸开始，推展到东海与南海，逐步将此等海域变成「和平与合作」之海，继续在新时代扮演「负责任的利害关系者」与「和平缔造者」。
民国一百零二年八月十日(2013.8.10)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席南投县草屯镇敦和宫庙口宣讲活动时表示，两岸服务贸易协议的签署，就是著眼大陆市场的广大商机，让台湾优质的服务业者，用超越外商的优惠条件进军大陆。王主委进一步指出，政府向大陆争取到比其他国家更有利的条件，台商可藉此拓展事业版图；同时，在相互开放市场的情况下，吸引更多陆资投资台湾，活络台湾经济环境，并增加就业机会，让台湾子弟可以留在家乡发展。王主委并表示，部分人士和媒体对服贸协议有一些误解，政府一定会持续对外沟通，把最正确的资讯传达给社会大众。
民国一百零二年八月十一日(2013.8.11)
马英九总统出席美国侨宴欢迎餐会致词时表示，政府在「九二共识、一中各表」基础上推动两岸交流，双方迄今签订19项协议，为海峡两岸自1949年隔海分治後，64年来关系最稳定的阶段；两岸已从过去的杀戮战场变成目前的和平大道，并已相互摸索出合作之道，未来政府将持续与对岸进行「货品贸易协议」谈判，并进一步深化双方交流，期能互设办事机构及全盘检讨「两岸人民关系条例」。
民国一百零二年八月廿四日(2013.8.24)
马英九总统访视「美食达人股份有限公司」（85度C）时表示，「两岸服务贸易协议」系「以台湾为主、对人民有利」的协议，让台湾业者藉由相关优惠条件赴中国大陆拓展商机，帮助台湾发展经济，这正是政府签订「两岸服务贸易协议」的原因。总统进一步表示，台湾要与全球打交道，须展现出开放市场的诚意及决心，让外界了解台湾愿意加入世界经济的整合，此对未来我参与「跨太平洋夥伴协定」（TPP）及「区域全面经济夥伴协定」（RCEP）具助益性，可避免台湾在区域经济整合的过程中被边缘化。
民国一百零二年八月廿九日(2013.8.29)
马英九总统在接见中华民国农会暨中华民国全国渔会理事、监事及总干事时表示，两岸服务贸易协议在农业开放方面，我方仅承诺开放畜牧业之顾问服务业，且民国98年6月即已开放此项目，迄今4年来并无陆资来台投资该服务业，该协议对台湾农业并无影响。总统并表示，未来若确定开放陆资来台投资「外销用」农产品物流中心，依规定必须采取合资方式，且陆资比例不得超过50%，我方仍具有掌控权主导未来营运方向，政府对此绝对会严格把关，俾让我国农产品外销的效益提升、农民收益提高。
民国一百零二年九月十日(2013.9.10)
马英九总统访视「东京著衣公司」致词时表示，「两岸服务贸易协议」中，大陆对台开放的80项承诺均超过其对「世界贸易组织」（WTO）的承诺，亦优於其对其他国家的开放程度，有意赴陆发展的业者应掌握此一良机；而大陆的服务业来台发展，亦可增加我国的就业机会，此均显示该协议对我方有利。此外，针对部分厂商担心因大陆业者来台竞争而受损，政府也已编列10年982亿元的经费，采取振兴辅导、体质调整及损害救济等策略，协助受影响之产业。
民国一百零二年九月十二日(2013.9.12)
马英九总统访视「乐陞科技公司」时表示，政府与大陆签署「两岸服务贸易协议」，是协助业者排除进入市场的障碍。大陆刻正推动的「十二五计画」，以服务业发展为重点项目之一，台湾的厂商应抓住机会，向大陆进军。马总统进一步指出，目前我国内生产毛额（GDP）的成长高达七成须仰赖出口，但服务业所占比例极低，国内服务业厂商前往大陆开疆辟土，能带动我国服务业发展，提升产业对整体经济的贡献。
民国一百零二年九月廿四日(2013.9.24)
马英九总统接见国际狮子会300G2区重要干部致词时表示，我与中国大陆签署「两岸经济合作架构协议」（ECFA）後，使得过去60年来台湾对大陆的农产品贸易逆差自今年起转为顺差，显见此种自由贸易型态的协议甚具助益。总统进一步表示，政府与大陆签署「两岸服务贸易协议」，完全没有开放大陆劳工来台，而大陆市场广大，台湾服务业具备实力及深具在全球布局的勇气，政府应提供业者发展的机会，让业者能逐渐壮大。总统也表示，希望「两岸服务贸易协议」能尽速通过，让台湾在自由贸易领域与全世界接轨。
民国一百零二年九月卅日(2013.9.30)
马英九总统出席「世界台湾商会联合总会第19届年会暨第3次理监事联席会议」开幕典礼时表示，政府订定「壮大台湾、连结亚太、布局全球」之经济策略，恢复与中国大陆中断10年的协商，双方迄今共签署19项协议，且每项协议均为和平种子，让两岸和平发展成为常态，并促使双边人才与资金交流成为60年来最兴旺的时刻。总统强调，两岸关系的改善带动国际关系的突破，台湾不能缺席区域经济整合，政府采取「多方接触、逐一洽签」方式，扩大台湾参与区域经济整合之机会，藉此营造更公平与税赋更少的竞争环境，并创造足够条件，期能进一步参与「跨太平洋夥伴协定」（TPP）及「区域全面经济夥伴协定」（RCEP）。总统进一步表示，洽签两岸服务贸易协议可协助我国内企业转型，并可藉由开拓大陆市场，进而进军全世界。
民国一百零二年十月六日(2013.10.6)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，王主委於「萧习会」後，与国台办张志军主任於会场外自然互动、短暂寒暄，并互称官职衔，代表两岸「正视现实、互不否认」的具体实践，也是两岸官方互动正常化的良好开端，对於未来陆委会与国台办的常态互动具有重要意涵。陆委会强调，这次王主委与国台办张志军互称官职衔，展现双方相互尊重及务实面对的态度，对於双方互信的深化及两岸良性互动具有重要意义。
民国一百零二年十月八日(2013.10.8)
马英九总统接见美国智库「大西洋理事会」（Atlantic Council）访华团时表示，过去5年多来，我与中国大陆关系获得大幅改善，双方互动密切，迄今共签署包括三通直航、陆客来台、「两岸经济合作架构协定」（ECFA）及「两岸服务贸易协议」等19项协议，使两岸关系在冲突60年来获得突破性发展，海峡和平已成为常态现象。总统并指出，两岸关系的改善也给予我国际关系更大空间，例如我方已五度以观察员身分参加「世界卫生大会」（WHA），并加入「政府采购协定」（GPA）；日前并以中华台北身分、理事会主席特邀贵宾名义参与「国际民航组织」（ICAO）大会，是我失去联合国代表权42年後首度与会，具有重要指标意义。未来政府将持续透过各种管道改善两岸及国际关系，同时努力维持各方平衡局面，期以和平方式解决国际争端，并以国际合作方式增进经贸关系。
民国一百零二年十月九日(2013.10.9)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席「港澳人士来台庆祝中华民国102年国庆晚宴」致词时表示，陆委会在「萧习会」过程中，达成过去未曾有过的「三个突破」。第一个突破是，「萧习会」由陆委会与大陆国台办直接联系，沟通相关的安排，回归由政府进行制度面的处理；第二个突破是，以陆委会主委的身分，全程参与「萧习会」，突破过去此一场合无现任官员与会的惯例；第三个突破是，与国台办张志军主任在「萧习会」後进行短暂的互动，过程中双方以职衔互称，代表两岸「正视现实、治权互不否认」的具体实践，也是两岸官方互动正常化的良好开端，对於未来两岸间的常态互动有重要意涵。陆委会表示，王主委在与大陆国台办张志军主任的互动过程中，也提出未来将推动陆委会跟国台办负责人的定期互访，以及建立陆委会与国台办的常态性沟通联系机制。日後这两项提议的落实，除了平时可以增进双方在业务上的的沟通效率，当突发事件发生时，双方也可以减少误判情形的发生。
民国一百零二年十月十日(2013.10.10)
马英九总统伉俪出席「中华民国中枢暨各界庆祝102年国庆大会」致词时表示，两岸人民同属中华民族，两岸关系不是国际关系。五年多来，两岸在「一中各表」的「九二共识」基础上签署19项协议，实现海空运直航、陆客来台、司法互助、经济合作等交流。当前两岸应该不断透过沟通协商增加彼此的政治互信；不断地扩大深化两岸交流互动来增进人民福祉；同时推动互设两岸两会办事机构来强化为民服务。
民国一百零二年十月十六日(2013.10.16)
马英九总统接见第3届「台美日安全对话研讨会」与会贵宾致词时表示，政府在中华民国宪法架构下，维持台海「不统、不独、不武」的现状，并在「九二共识、一中各表」的基础上，推动两岸和平发展，使双方关系达到60年来最好的阶段。日前萧前副总统在APEC会议期间与中国大陆领导人习近平会谈，双方对於改善关系皆有进一步共识；而行政院陆委会主委王郁琦也与大陆国台办主任张志军会面，双方不仅互称官衔，并约定未来相互访问，此对两岸关系除带来正面发展，同时亦符合我国「互不承认主权、互不否认治权」主张。
民国一百零二年十月六廿二日(2013.10.22)
马英九总统接见「第九届两岸经贸文化论坛」我方代表团致词时表示，政府在中华民国宪法架构下，维持台海「不统、不独、不武」现状，并在「九二共识、一中各表」的基础上推动两岸和平发展。在两岸交流方面，政府系秉持「先急後缓、先易後难、先经後政」的原则，先讨论具有迫切性的议题，且在「以台湾为主、对人民有利」的原则下，也不会设限或回避具政治敏感性的议题。总统进一步表示，以「两岸互设办事机构」为例，该机构本身是中性的，但该议题系具有政治敏感性，政府对此不仅不回避，并持续进行相关谈判。总统并表示，根据宪法，中华民国是主权独立国家，中国大陆仍然是我们的领土。两岸关系不是国际关系，而是一种特殊关系。
民国一百零二年十月廿四日(2013.10.24)
马英九总统接受美国「华盛顿邮报」（The Washington Post）专访时表示，两岸协商的原则是「先急後缓、先易後难、先经後政」，两岸互设机构议题具有高度政治敏感性，但机构本身是中性的，政府并没有刻意不去碰政治问题，当时机成熟，且有迫切性，就可以提前讨论。关於「和平协议」议题，最好须是经过公民投票；而「军事互信机制（mutual military confidence-building measures）」议题，亦具有敏感性，目前台湾内部尚未取得共识。此外，两岸领导人会面，一定要在国家有需要、人民能支持，以及对等尊严的状态下才有可能进行。
民国一百零二年十月廿六日(2013.10.26)
王郁琦主任委员出席102年「青年学生大陆政策研习营」致词时表示，两岸事务性议题不免涉及政治意涵，双方应该展现智慧，务实面对现实并妥适处理。王主委进一步表示，「两岸两会互设办事机构」政策攸关我方民众、台商及学生赴大陆的权益与福祉，虽属事务性的议题，但其中像办理证件、人道探视等，难免具有政治敏感性。只要是攸关民众权益的事情，都是双方必须务实面对处理的议题，政府也不会回避。
民国一百零二年十月廿九日(2013.10.29)
马总统接见欧洲议会外交委员会访华致词时表示，与中国大陆之渔业争议，希望透过合作建立共同养护及管理区域，以保障渔业资源，减少不必要的摩擦。总统认为，政府改善两岸关系的同时，我国际关系亦获得改善，国际关系与两岸关系从过去的「恶性循环」转变为「良性循环」。
民国一百零二年十一月十三日(2013.11.13)
马英九总统出席「102年侨务委员会议」闭幕典礼时表示，政府以和解及合作之方式为海峡两岸创造和平与繁荣，国际空间因此获得扩展，两者互为「良性循环」。总统也表示，过去5年多来，政府与中国大陆签署19项协议，尽管双方经贸往来日趋密切，但台湾并未因此增加对中国大陆的依赖。此外，签署「两岸服务贸易协议」，可让相对成熟的台湾服务业者前往仍有许多成长空间的大陆市场拓展商机。
民国一百零二年十一月十三日(2013.11.13)
行政院大陆委员会王郁琦主委出席「第17届两岸新闻报导奖」时表示，两岸新闻媒体交流的重点在於新闻资讯能否自由流通，目前两岸资讯的传播始终在不对等的状态，在台湾可透过各种媒体管道接收到大陆的资讯，但大陆人民接收台湾资讯的管道却受到限制，无法深入了解台湾社会丰富多元的价值，期许大陆方面能够体认两岸资讯自由流通、对等交流的重要性，进而解除对台湾资讯的封锁与限制。
民国一百零二年十一月廿八日(2013.11.28)
马英九总统接见参加「区域安全与跨境犯罪国际研讨会」与会贵宾时表示，海峡两岸过去因政治与军事对立，造成双方未就共同打击犯罪事项建立任何机制，2009年我政府与中国大陆签订「海峡两岸共同打击犯罪与司法互助协议」，对跨境犯罪侦查及处理产生极大助益；而我与大陆的合作并不局限於两岸之间，双方亦可分别派员前往第三地侦讯，再各自遣返嫌犯回国，此亦为我与其他国家共同打击犯罪所追求之目标。
民国一百零二年十一月廿八日(2013.11.28)
马英九总统与五院正、副院长及秘书长茶叙时表示，两岸签署「服务贸易协议」後，在台外商与邻近国家皆关注我政府是否有足够的决心与诚意落实该协议，且该协议完成审查後，两岸将进行後续的货品贸易谈判，因此，期盼立法院尽速完成该协议的审查工作，以加速我国贸易自由化的进程。
民国一百零二年十二月五日(2013.12.5)
马英九总统接见美国前副国务卿史坦柏格（James B. Steinberg）致词时表示，政府积极推动「活路外交」，使中华民国的国际关系与两岸关系，由过去的「恶性循环」转变成「良性循环」；而我与中国大陆签署「两岸经济合作架构协议」（ECFA）後，分别与日本签署「台日投资协议」，与纽西兰签署「台纽经济合作协议」（ANZTEC），再与新加坡签署「台星经济夥伴协议」（ASTEP），充分展现我国走向自由贸易的决心与努力。总统并表示，我国在1950年代划设之「防空识别区」，与中国大陆划设的「东海防空识别区」重叠，中国大陆在划设前并未与我方谘商，此举对於两岸关系的正面发展并无任何助益，也呼吁周边各国应与中国大陆就「东海防空识别区」重叠的部分进行双边协商，透过对话与谈判来解决此一争端，期让东海恢复成「和平与合作之海」。
民国一百零二年十二月五日(2013.12.5)
行政院大陆委员会发布新闻稿表示，政府政策上并不支持公务员赴大陆进修，但因现行公务人员训练进修法及台湾地区与大陆地区人民关系条例，对於公务员能否赴大陆进修并无禁止规定，以致仍有部分公务员赴大陆进修之情形。考量现行两岸情势，公务员赴大陆进修涉及敏感，并不适宜。陆委会表示，政府未来将拟订具体方案措施，从人事管理、赴陆入出境管理等各层面上逐步完善相关规范，强化落实对公务员赴大陆进修之管理。
民国一百零二年十二月十日(2013.12.10)
马英九总统接见「软实力之父」美国哈佛大学教授、前国防部助理部长约瑟夫?奈伊（Joseph Nye）博士致词时表示，针对中国大陆划设「东海防空识别区」，总统并进一步重申，中华民国政府已发表四点声明：第一，我国对钓鱼台列屿享有主权，政府将全力扞卫主权、保卫渔民；第二，我国军在双方重叠之防空识别区内的演习及训练活动将不受影响，我方会向陆方表达严正关切；第三，呼吁相关各方就重叠的防空识别区进行双边协商，以解决争议；第四，对於通过防空识别区的民航机，我方将应航空公司要求，将其所提报的飞航资讯转报中国大陆民航当局，主要是为了飞航的安全及乘客的福祉。总统并强调，我国向以和平方式解决争端做为政策主轴，希望此次亦能使东海恢复「和平与合作之海」的原貌。
民国一百零二年十二月十日(2013.12.10)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员在「第三届两岸交流纪实文学奖」颁奖典礼开幕致词时表示，两岸之间的政治现实让两岸人民有先天上的隔阂，因此也常因为不了解而有误解。陆委会做为两岸政策的主管机关，对自身的期许不仅仅在於完善两岸往来的制度化发展，更希望能够促进两岸人民对彼此有更深入且完整的认识，并且应该要成为推动这种互信互谅的先行者和维护者。
民国一百零二年十二月十一日(2013.12.11)
行政院大陆委员会王郁琦主任委员出席全国商业总会「两岸租税协议说明会」致词时表示，政府考量两岸经贸往来日益密切，为提升台商在大陆的竞争力及增加我国投资环境的吸引力，经与大陆方面沟通并达成共识，双方同意推动「两岸租税协议」的签署，以避免重复课税，同时建立两岸税务合作机制、解决租税争议，并维护租税公平，在经过双方业务主管部门持续沟通，目前已有良好进展。在今年6月第九次两岸两会高层会谈时，双方已表示将「两岸租税协议」纳入第十次两岸两会高层会谈的协商议题，但为确保协议对我方的利益，将在获得各界支持及国内共识後，再正式推动签署协议。
民国一百零二年十二月十二日(2013.12.12)
马英九总统接见美国纽约大学法学院亚美研究所共同主任孔杰荣（Jerome A. Cohen）教授时表示，针对中国大陆划设「东海防空识别区」，各方勿升高紧张情势，应进行双边对话以解决防空识别区重叠之争议；另在民航方面，我国参照「国际民航组织」（ICAO）的建议，将航空公司所提报的飞航计画转报相关国家的民航主管机关，以确保飞航安全。
民国一百零二年十二月廿五日(2013.12.25)
马英九总统接受「亚洲周刊」专访时表示，两岸领导人会面，仍需要创造一些条件，目前还在创造条件的过程中。我们没有一定要将「马习会」排除，但必须在「国家有需要」及「人民愿意支持」的情况下进行，才能够真正地解决问题，且不管到哪里，我都是中华民国总统。总统也表示，对於两岸互设办事机构，由海基会及海协会负责，目的系为服务两岸人民，虽然在政治上很敏感，性质上是中性的，目前问题症结在於大陆始终没有同意「海基会派驻人员可探视在大陆监狱的台湾人」。此倘若无法克服，两岸互设办事处的协议很难签成。总统并表示，国台办与陆委会为主管两岸关系的机关，双方负责人能见面会谈，这是两岸关系进步的象徵，双方都乐观其成。另外，总统也针对政府对陆生的政策指出，政府的政策是主张扩大开放，因为学生的交流对双方都有帮助，但要稳健前进，不能躁进。
民国一百零二年十二月廿五日(2013.12.25)
行政院大陆委员发布新闻稿表示，两岸领导人见面必须在适当时机、适当场合，及以适当身分才能实现。马总统不论出席何种场合都是中华民国总统的身分，陆委会评估已排除总统以政党领导人身分见面，陆委会也认为两岸在亚太经济合作会议(APEC)见面是适当的场合，政府会依照过去惯例，争取我总统以经济体领袖之身分出席APEC会议。陆委会表示，只要有利两岸关系良性互动，政府都会去推动，也会审慎评估、妥适处理。