民國九十八年一月二日(2009.1.2)
海峽交流基金會董事長江丙坤表示，根據海基會與大陸海峽兩岸關係協會的規劃，今年上半年的協商議題仍以技術性、經貿性議題為主，暫時不會涉及政治性議題。
民國九十八年一月七日至十日(2009.1.7-10)
海峽交流基金會發布新聞稿表示，海基會董事長江丙坤率團前往深圳、東莞、廣州及南京等地探訪台商，並與大陸海峽兩岸關係協會會長陳雲林會面。
民國九十八年一月八日(2009.1.8)
海峽交流基金會與大陸海峽兩岸關係協會在廣州舉行台商座談會，聽取台商在大陸生產經營的問題，以及對兩岸經濟交流合作的意見和建議。
民國九十八年一月九日(2009.1.9)
海基會董事長江丙坤會見廣東省副省長萬慶良時表示，為解決台商融資難題，他願意提供台灣中小企業信保基金成立和運作機制資料，協助大陸各地方政府成立類似擔保機制，解決兩岸中小企業融資難題。目前已有上海、昆山願意成立擔保公司。
民國九十八年一月九日(2009.1.9)
大陸海峽兩岸旅遊交流協會發佈公告，推出大陸居民赴臺旅遊新措施，將旅遊團人數下限，由「十人以上」改為「五人以上」；將旅遊團在臺停留期間，由「不超過十天」改為「不超過十五天」。
民國九十八年一月十日(2009.1.10)
海基會與大陸海協會在南京召開長三角地區台商座談會，瞭解台商對當前台資企業生產經營的情況和加強兩岸經濟交流合作的意見和建議。海基會董事長江丙坤、海協會常務副會長鄭立中等出席。
民國九十八年一月廿二日(2009.1.22)
大陸海協會宣布，河北等12個省(自治區)成為大陸居民赴台旅遊的第二批開放區域。加上首批開放的區域，大陸目前共有25個省、直轄市的居民可申請赴台旅遊。
民國九十八年一月廿二日(2009.1.22)
行政院大陸委員會發言人劉德勳表示，陸委會正式授權海基會，去函海協會，表達希望協商包括金融、定期航班與陸資來台三項議題。其中金融議題方面，主要是銀行、證券期貨與保險監理備忘錄（MOU）。
民國九十八年二月十九日(2009.2.19)
中共國台辦副主任鄭立中強調，三次江陳會確定由大陸舉辦；暫時不會觸及簽訂CECA的問題。
民國九十八年二月廿四日(2009.2.24)
海基會發布「對綜合性經濟合作協議之基本態度」一文指出，目前主管機關經濟部刻正根據我國產業政策發展需要，會同陸委會積極研議中，尚未形成具體的協商策略與方案，更未授權海海基會展開協商。
民國九十八年三月四日(2009.3.4)
大陸海峽兩岸關係協會會長陳雲林出席全國政協大會時對記者表示，由於兩岸兩會協商已經制度化，預計下半年將再次前往台灣與海基會董事長江丙坤進行會談。
民國九十八年三月五日(2009.3.5)
大陸海峽兩岸關係協會會長陳雲林接受新華社專訪時表示，要持續深化兩岸交流合作、推進協商談判。海協會將以繼續完善兩岸直接「三通」、推動兩岸經濟關係正常化為今年協商的工作重點，進而推動簽定綜合性經濟合作協議，逐步建立具有兩岸特色的經濟合作機制。今年上半年，兩會將就開通兩岸空中定期航班、加強兩岸金融合作暨建立兩岸銀行、證券、保險及貨幣領域合作機制、共同打擊犯罪以及兩岸雙向投資問題展開協商與對話，爭取上半年在大陸舉辦的第三次兩會領導人會談中簽署一批新的協議。
民國九十八年三月六日(2009.3.6)
海峽交流基金會董事長江丙坤表示，第三次江陳會高層對話中將針對兩岸經濟合作架構協議（ECFA）交換意見，若取得對方同意，再討論是否納入第四次江陳會協商議題。目前能確定的是，將會針對共同打擊犯罪與司法互助、定期航班、金融合作3項議題進行協商。
民國九十八年三月九日(2009.3.9)
海峽交流基金會舉辦成立18週年慶祝活動，董事長江丙坤表示，海基會未來將繼續推動兩岸制度性協商，希望今年上半年能完成有關兩岸共同打擊犯罪、司法互助，以及定期航班和金融等議題。
民國九十八年三月九日(2009.3.9)
大陸海協會會長陳雲林接受中新網專訪時表示，今年將以繼續完善兩岸直接「三通」、推動兩岸經濟關係正常化為協商工作的重點，進而推動簽訂綜合性經濟合作協議，逐步建立具有兩岸特色的經濟合作機制。根據兩會制度化協商慣例，今年上半年將在大陸舉辦的第三次兩會領導人會談，雙方初步確定此次會談重點商談兩岸空中定期航班、加強兩岸金融合作、兩岸共同打擊犯罪暨司法聯繫與協助等議題，並就兩岸雙向投資問題進行對話，爭取簽署一批惠及兩岸同胞的新協議。
民國九十八年三月十二日(2009.3.12)
海基會副董事長兼秘書長高孔廉表示，第三次「江陳會」的四項議題，包括共同打擊犯罪、金融合作、定期航班與陸資來台等，政府將在對等尊嚴、務實穩健、對台灣有利的原則及基礎上，完成協商簽署協議。
民國九十八年三月十七日(2009.3.17)
大陸海峽兩岸關係協會會長陳雲林在2009年第5期「求是」雜誌，發表題為「開創兩岸關係和平發展的新局面」的文章，表示，堅持大陸和台灣同屬一個中國，是兩岸協商談判的政治基礎，堅持「九二共識」就是堅持雙方對於大陸和台灣同屬一個中國的認同。有了這一政治基礎，兩岸雙方就能夠建立互信、擱置爭議、求同存異、共創雙贏，兩岸協商就能夠有效推進。「台獨」分裂勢力及其活動是兩岸關係發展和兩岸協商談判的最大破壞力量，必須堅決予以反對和遏制。
民國九十八年三月廿一日(2009.3.21)
海基會董事長江丙坤出席「第三屆海峽兩岸客家高峰論壇」時指出，目前陸委會已授權海基會協商的議題有兩岸金融合作簽署銀行、證券期貨、保險監理三項了解備忘錄（MOU），以及定期航班、陸資來臺、兩岸共同打擊犯罪。
民國九十八年三月廿三日(2009.3.23)
海基會發表新聞稿表示對「綜合性經濟合作協議」之基本態度指出，海基會的角色，主要是聯繫安排工作，至於實質協商內容，則由政府相關部會官員與大陸對口部門的官員面對面直接商談。
民國九十八年三月廿五日(2009.3.25)
海基會召開董監事會議，江丙坤董事長表示，4月開始，海基會與大陸海協會將有一連串的互動，包括海協會副會長安民將率經貿訪問團來台參訪，落實兩會常態化交流；以及兩會將舉行第三次「江陳會談」，就兩岸共同打擊犯罪及司法互助、定期航班、金融合作與陸資來台等四項議題進行協商。
民國九十八年四月六日至十二日(2009.4.6-12)
大陸海協會副會長安民率「海協會經貿交流考察團」抵達台灣，進行為期七天的訪問。
民國九十八年四月十八日(2009.4.18)
海基會高孔廉副董事長在兩會「預備性磋商」致詞時表示，今年兩會進行的第三次「江陳會談」，將就定期航班、金融合作、共同打擊犯罪、陸資來台四項議題進行協商。
民國九十八年四月廿五日(2009.4.25)
大陸海協會常務副會長鄭立中和海基會副董事長高孔廉共同主持工作性磋商，就兩岸空中定期航班、兩岸金融合作、兩岸共同打擊犯罪及司法互助三項議題，以及大陸資本赴台投資等事宜進行最後溝通。
民國九十八年四月廿六日(2009.4.26)
第三次「江陳會談」在大陸南京正式召開。海基會江董事長丙坤與大陸海協會陳會長雲林代表雙方簽署「海峽兩岸共同打擊犯罪及司法互助協議」、「海峽兩岸金融合作協議」以及「海峽兩岸空運補充協議」等3項協議，雙方並就共同推動陸資來台投資獲致共識。
民國九十八年四月廿六日(2009.4.26)
海基會在南京會談協議簽署儀式後舉行記者會，海基會董事長江丙坤表示，兩岸經濟合作架構協議，將來可通過兩會安排，讓相關部門討論，只要兩岸有共識，隨時都可以作為新的兩會會談議題。而副董事長兼秘書長高孔廉則指出，關於陸資赴台投資問題，台灣方面會在未來1到2個月內公佈陸資赴台的相關規定和配套措施，內容包括投資項目及投資方式。
民國九十八年五月廿六日(2009.5.26)
海基會董事長江丙坤表示，兩會協商議題必須由行政院大陸委員會偕同相關部會凝聚共識，才會向大陸方面提出。因此，目前第四次「江陳會談」僅針對避免雙重課稅、漁業勞務合作、農產品檢驗檢疫、產品標準化檢測與認證合作等四項議題，民眾關切的互設辦事處不在議題中。
民國九十八年五月廿七日(2009.5.27)
海基會公布川震重建我方捐款使用情形，去年9月12日已將政府機關所開設之「中國大陸四川震災捐款專戶」所募得的新台幣12億元，轉贈大陸海協會，並指定用於「社區重建」及「校園重建」項目。海協會亦函告我方捐款使用情形，並表示我方捐款多用於校園重建，援助項目或已完成規劃，或已進入施工階段。
民國九十八年六月一日(2009.6.1)
海基會邀集大陸各地台協會長、台企負責人、政府相關部會首長等參加大陸台商端午聯誼活動，行政院長劉兆玄也出席晚宴。
民國九十八年六月九日(2009.6.9)
大陸海協會理事周寧率領的大陸司法交流參訪團拜會海基會，並就共同打擊犯罪及司法互助的有關業務問題，與台灣方面專家進行座談。
民國九十八年六月十六日(2009.6.16)
大陸東莞發生台商2死1重傷事件，海峽交流基金會經貿處長陳榮元表示，已去函海峽兩岸關係協會請求協助，目前也正協助家屬前往大陸處理後事。
民國九十八年六月廿四日(2009.6.24)
海基會江丙坤董事長在第七屆董監事第三次聯席會議致詞時表示，對於兩岸協商，總統指示應秉持「三先三後」的原則，即「先易後難、先急後緩、先經後政」，第三次江陳會談，已將「兩岸農產品檢疫檢驗、兩岸避免雙重課稅、兩岸漁業勞務合作及兩岸標準檢測及認證合作」等四項議題，列為第四次會談優先協商議題，但是若主管機關有實際需要，並且和對方達成共識，也可隨時增加。
民國九十八年七月五日(2009.7.5)
海基會副董事長高孔廉率團前往青島，進行環渤海灣的探訪臺商之旅，並向大陸官商界人士說明臺灣開放大陸資金赴臺投資方案。
民國九十八年七月九日(2009.7.9)
海基會副董事長高孔廉出席長春台協座談會時指出，兩岸在洽簽雙向投資保障協定前，不妨可先將過去國、共平台上的「台商權益保障工作會談」，移往海基、海協平台，以便即時回應大陸台商需求。
民國九十八年七月十四日(2009.7.14)
海峽交流基金會董事長江丙坤率「關懷川震重建暨台商訪問團」，到四川汶川地震災區訪問。
民國九十八年七月十八日(2009.7.18)
海峽交流基金會和大陸海峽兩岸關係協會深圳共同舉辦台商座談會，就加強兩岸經濟合作、協助台資企業紓困與發展，攜手應對國際金融危機等問題，聽取在大陸投資的部分台商和台資企業代表的意見和建議。
民國九十八年七月廿三日(2009.7.23)
海協會長陳雲林出席「華晶科技新品發表會」時表示，「第四次江陳會」「地點不重要，重要的是雙方共同準備好討論的題目。」
民國九十八年七月廿八日(2009.7.28)
海協會新聞交流參訪團拜會海基會，並參加兩岸新聞資訊交流座談會。海基會副董事長高孔廉在會談中表示，兩岸要進一步邁向和平發展，不僅要靠兩會正式的協商機制，也要靠兩岸媒體發揮正面報導的力量，才能不斷擴大良性循環的效果。
國台辦新聞局局長楊毅則表示，希望兩岸雙方本著先易後難的原則，推動兩岸新聞交流實現正常化，推動儘早實現兩岸媒體互設常駐機構。
民國九十八年七月廿九日(2009.7.29)
海基會董事長江丙坤表示，自從台灣公告兩岸間接貿易投資辦法以來，雙方還有很多經貿事項需要商談，等談完經貿議題後，文化教育等交流是未來兩岸協商的課題。
民國九十八年八月二日(2009.8.2)
由大陸國台辦新聞局長楊毅所率領的海協會新聞交流參訪團結束在台參訪行程，返回大陸。
民國九十八年八月四日(2009.8.4)
大陸「第十八屆海峽兩岸關係學術研討會」在江蘇南京舉行，主題為「兩岸關係和平發展的機遇與挑戰」。
民國九十八年八月十日(2009.8.10)
大陸海峽兩岸關係協會兩次致函台灣海峽交流基金會，向遭受颱風「莫拉克」侵襲的台灣同胞表示誠摯慰問，並願意根據台方需要，提供必要援助。
民國九十八年八月十日(2009.8.10)
海基會回函向海協會來函對於莫拉克颱風造成我方損害表達慰問表示致謝；另並就莫拉克颱風造成大陸方面之損害表示深切關懷與慰問。
民國九十八年八月十二日(2009.8.12)
大陸海峽兩岸關係協會向受「莫拉克」颱風影響的台灣民眾捐款人民幣一億零六百萬元，港幣五百萬元。
民國九十八年八月十四日(2009.8.14)
海基會代表政府感謝大陸海協會捐助組合屋安置災民。
民國九十八年八月十八日(2009.8.18)
在海基會的聯繫協調下，大陸捐贈的首批救援物資運抵高雄。海基會發言人馬紹章副秘書長表示，對於大陸方面的愛心與關心，海基會代表政府及人民表達誠摯感謝。
民國九十八年八月十九日(2009.8.19)
海基會高孔廉副董事長接見大陸海協會馬曉光副秘書長，代表政府和災區民眾對大陸方面積極協助賑災表示感謝。
民國九十八年八月十九日(2009.8.19)
大陸協會副秘書長馬曉光與海基會副董事長兼秘書長高孔廉會面時表示，希望海基會進一步提出救災物資需求，包括食品、物品、台灣救災急需的重型直升運輸機等，大陸方面將傾力提供。
民國九十八年八月廿一日(2009.8.21)
大陸海峽兩岸關係協會致函台灣海峽交流基金會，告知首批三名大陸技術人員將於22日晚抵達高雄，並表示，大陸方面願意繼續向台灣受災人民提供各類救災物資與機械（包括民用直升機），以及通過適當渠道派遣醫療隊、救援隊、工程建設隊赴台協助救災及災後重建工作。
民國九十八年八月廿三日(2009.8.23)
海基會已函告海協會組合屋檢測合格，並就海協會來函對於莫拉克颱風遇難民眾致哀、受災民眾慰問事回函致謝。
民國九十八年八月廿四日(2009.8.24)
大陸海協會馬曉光副秘書長拜會海基會，代表該會捐贈三萬美元給受災嚴重的高雄縣甲仙鄉小林村。
民國九十八年九月一日(2009.9.1)
海基會江丙坤董事長會見中共上海市委訪問團，代表政府和民眾對大陸方面積極協助賑災表示感謝。
民國九十八年九月四日(2009.9.4)
海基會江丙坤董事長接見海協會理事李禮輝暨中國銀行台灣金融考察團時表示，兩岸金融業應加強合作；江董事長並代表災區民眾與我方政府感謝中國銀行台灣金融考察團代表捐助八八水災賑災款新台幣90萬元。
民國九十八年九月十七日(2009.9.17)
海峽兩岸關係協會會長陳雲林在「2009南京臺灣名品交易會」開幕時表示，兩岸雙方一直在就ECFA議題接觸協商中，第4次「江陳會」只要準備好了就會談。
民國九十八年九月廿三日(2009.9.23)
海基會江丙坤董事長於第七屆董監事會聯席會議致詞時表示，第四次「江陳會談」預定今年年底在我方舉行，目前雙方均按既定的時程進行規劃，相關議題也陸續展開業務溝通。
民國九十八年十月四日(2009.10.4)
海基會江董事長在「大陸台商秋節座談聯誼會」晚宴致詞時表示，年底第四次會談即將登場，將聚焦在通商的議題上，包括漁業勞務合作、農產品檢疫檢驗、標準檢測與合作、避免雙重課稅等四項議題，未來兩岸還有很多議題。另外最受關注的就是ECFA，如何讓台灣在國際區域經濟整合的潮流下免於邊緣化，讓台灣的產品在全世界各地有公平的待遇，這是政府積極規劃推動的政策與目標。
民國九十八年十月十三日(2009.10.13)
海基會發佈新聞表示，該會副董事長兼秘書長高孔廉與大陸海協會常務副會長鄭立中，於10月13日在杭州，針對第四次江陳會談的各項事宜，進行程序性的商談。
民國九十八年十月廿八日(2009.10.28)
由江丙坤董事長率團的「海基會新聞交流團」，在北京人民大會堂會見海協會會長陳雲林。
民國九十八年十一月三日(2009.11.3)
海基會副董事長高孔廉與大陸海協會常務副會長鄭立中，針對第四次江陳會談準備事宜，舉行第二次程序性商談。雙方商定在本年12月下旬舉行第四次江陳會談前，並視實際需要再進行後續程序性商談之後，循例舉行正式的預備性磋商。
民國九十八年十一月五日(2009.11.5)
海協會會長陳雲林在湖南衡陽，會見包括海基會副董事長許勝雄在內，參加「第五屆湘台經貿交流合作會」的台商代表。
民國九十八年十一月十三日(2009.11.13)
海基會高孔廉副董事長赴台中拜會胡志強市長，感謝台中市對籌辦第四次江陳會談所提供之諸多協助。高孔廉副董事長兼秘書長並率海基會人員，赴相關場所勘察。
民國九十八年十一月十五日(2009.11.15)
基會高孔廉副董事長會見海協會王在希副會長率領的「文化教育交流團」，雙方就兩岸文化教育交流事項廣泛交換意見。高副董事長表示，台灣在多年前提出「兩岸交流、文化為先」的想法，因為兩岸的經貿互補性雖然高，但文化互補性更高，在加強經貿交流同時，要多增加新聞、文化及教育的交流。
民國九十八年十二月十日(2009.12.10)
海基會副董事長高孔廉與大陸海協會常務副會長鄭立中在福建福州舉行海協會、海基會第四次副會長級預備性磋，商定兩會領導人第四次會談於12月21日至25日在台中市舉行；並對第四次「陳江會」議題及協議交換意見。
民國九十八年十二月十日(2009.12.10)
海協會常務副會長鄭立中在第四次副會長級預備性磋商中表示，海協會將向海基會轉交3億元人民幣捐款，用於台灣災區的橋樑、學校等公共活動設施重建。
民國九十八年十二月十七日(2009.12.17)
海基會江董事長在第四次「江陳會談」會前記者會表示，第四次「江陳會談」的意義，可以用「對等協商，為民謀福，完善環境，永續發展」來形容。
民國九十八年十二月十八日(2009.12.18)
大陸海協會會長陳雲林表示，兩會領導人在台灣舉行的第二次會談，標誌著兩會制度化協商機制已日漸成熟完善。兩會協商在大陸和台灣輪流舉行，充分體現了海協會與海基會是平等協商、互相尊重、善意溝通的。也表示，商簽兩岸經濟合作框架協議是一個單純的經濟問題，旨在促進兩岸經濟共同發展，提升兩岸同胞共同福祉，實現互利雙贏，不涉及任何政治敏感問題。我們願意通過兩會啟動專家級的協商，我們也充分尊重台灣方面的意見。
民國九十八年十二月廿一日(2009.12.21)
海基會高孔廉副董事長在兩會預備性磋商致詞時表示，對於未來兩岸協商，有三個希望，「希望」雙方能擱置爭議，務實協商，不要過度政治化的引申；「希望」大陸能發揮仁者智慧，充分尊重台灣人民的想法；也「希望」大陸考量兩岸規模的差異，處處從大處著眼。
民國九十八年十二月廿二日(2009.12.22)
第四次兩岸兩會領導人會談簽署「海峽兩岸農產品檢疫檢驗合作」、「海峽兩岸標準計量檢驗認證合作」、「海峽兩岸漁船船員勞務合作」等3項協議，累計兩會共簽12項協議，達成1項共識。
民國九十八年十二月廿二日(2009.12.22)
海峽交流基金會董事長江丙坤在第四次「江陳會談」成果說明會表示，現階段兩岸協商落實推動兩岸關係「先經後政、先急後緩、先易後難」的原則，讓兩岸的交流與互動可以在更堅實的制度基礎上繼續往前邁進。有關兩岸避免雙重課稅及加強稅務合作議題，將儘速透過兩會安排後續協商，以便適時達成協議，完成簽署；「兩岸經濟合作架構協議（ECFA）」列為下次會談重要推動的議題；另外，「智慧財產權保護」也列為第五次會談的協商議題。
民國九十八年十二月廿二日(2009.12.22)
大陸海峽兩岸關係協會會長陳雲林在會見行政院大陸委員會賴幸媛主任委員時表示，當前及今後一段時間，經濟議題仍將是兩會商談的重點。海協會願與海基會一起，在推進兩岸經濟合作的同時，逐步增加文化、教育、新聞、科技交流議題的內容。