民國82年04月30日內政部(82)臺內警字第8274943號令訂定發布全文16條；並自發布日起施行
民國84年08月23日內政部(84)臺內警字第8481491號令修正發布全文21條；並自發布日起施行
民國89年03月06日內政部(89)臺內警字第8981176號令修正發布第3至5條、第7條、第11條、第13條、第14條條文；並增訂第15條之1條文
民國89年12月20日內政部(89)臺內警字第8981830號令修正發布第15條之1條文
民國91年08月28日內政部臺內警字第0910078126號令修正發布第4條、第5條、第7條、第11條、第14條、第17條條文
民國93年03月01日內政部臺內警字第0930079891號令修正發布名稱及全文19條；並自93年03月01日施行 (原名稱：臺灣地區人民進入大陸地區許可辦法)
民國95年10月19日內政部台內警字第0950922152號令修正發布全文 20條；並自95年10月19日施行（歷史條文）
民國97年07月03日內政部台內移字第0971032160號令修正發布第4、5、13、15、16、17及20條條文；增訂第10-1；並自同日施行（歷史條文）
民國97年12月30日內政部台內移字第0970995393號令修正發布；並自發布日起施行（歷史條文）
民國99年09月01日內政部台內移字第0990928838號令修正發布第5條、第8條、第9條、第10條條文；並自發布日起施行（歷史條文）
民國103年10月28日內政部台內移字第10306063582號令修正發布第8條條文；並自發布日起施行（歷史條文）
民國104年12月30日內政部台內移字第1040955489號令修正發布全文12條，並自發布日起施行
第一條 本辦法依臺灣地區與大陸地區人民關係條例（以下簡稱本條例）第九條第九項規定訂定之。
第二條 本辦法之主管機關為內政部。
第三條 本辦法所稱公務員，指公務員服務法第二十四條規定之人員。
本辦法所稱簡任（或相當簡任）第十一職等以上公務員及警監三階以上警察人員，指所任職務之職務列等或職務等級跨列簡任（或相當簡任）第十一職等以上及警監三階以上者。
本辦法所稱特定身分人員，指下列各款人員：
一、本條例第九條第三項所定國家安全局、國防部、法務部調查局及其所屬各級機關未具公務員身分之人員。
二、本條例第九條第四項第二款所定未具公務員身分之人員。
三、本條例第九條第四項第三款及第四款所定人員。
本辦法所稱涉及國家機密人員，指本條例第九條第四項第二款及第三款所定人員。
第四條 未涉及國家機密之簡任（或相當簡任）第十一職等以上之公務員、警監三階以上之警察人員及前條第三項第一款人員，應向主管機關申請，經許可後，始得進入大陸地區。
本條例第九條第四項各款人員，申請進入大陸地區，應經主管機關會同國家安全局、法務部及行政院大陸委員會組成之審查會共同審查許可；必要時，得徵詢申請人（原）服務機關（構）或委託機關意見。
第五條 各機關（構）、委託機關或受託團體、機構，應將本條例第九條第四項第一款至第三款及第五款人員，列冊函送內政部移民署（以下簡稱移民署），並副知當事人；人員異動時，亦同。
本條例第九條第四項第四款人員，原服務機關（構）、委託機關或受託團體、機構應於其退離職前，造具名冊送達移民署，並副知當事人。
第六條 擔任行政職務之政務人員、直轄市長、縣（市）長及涉及國家機密人員，符合下列各款情形之一者，始得申請進入大陸地區：
一、在大陸地區有設戶籍之配偶或四親等內之親屬。
二、其在臺灣地區配偶或四親等內之親屬進入大陸地區，罹患傷病或死亡未滿一年，或有其他危害生命之虞之情事，或確有探視之必要。
三、進入大陸地區從事與業務相關之交流活動或會議。
四、經所屬機關（構）遴派或同意出席專案活動或會議。
前項涉及國家機密人員為中央各機關（構）所派駐外人員、任職國家安全局、國防部、法務部調查局與其所屬各級機關（構）人員及其他從事有關國防或機密科技研究者，不得以前項第一款事由申請進入大陸地區。
第七條 第三條第二項及第三項第一款未涉及國家機密人員申請進入大陸地 區，應於預定進入大陸地區當日之二個工作日前，向主管機關申請。
本條例第九條第四項各款人員申請進入大陸地區，應於預定進入大陸地區當日之七個工作日前，向主管機關申請。
因辦理兩岸協商、執行特種勤務或處理緊急事故申請進入大陸地區，經主管機關同意者，不受前二項所定申請時間之限制。
第八條 依本辦法申請進入大陸地區之現職人員，應填具進入大陸地區申請表及檢附必要佐證資料，並詳閱公務員及特定身分人員進入大陸地區注意事項後簽章，由所屬中央機關（構）、直轄市、縣（市）政府、委託機關或其授權機關審核其事由，並附註意見後，以網際網路方式向主管機關申請。但申請文件機密等級屬機密以上者，應以紙本方式申請之。
前項申請人為直轄市長、縣（市）長以外機關首長者，應於主管機關許可前，報經所屬機關之上一級機關核准。
依本辦法申請進入大陸地區之退離職人員，應填具進入大陸地區申請表及檢附必要佐證資料，並詳閱公務員及特定身分人員進入大陸地區注意事項後簽章，由原服務機關（構）、委託機關審核其事由，並附註意見後，以網際網路方式，向主管機關申請；原服務機關（構）、委託機關經裁撤或改組者，應由承受其業務之機關（構）或其直接上級機關申請之。
第九條 依本辦法申請進入大陸地區檢附之相關文件不全得補正者，主管機關應通知申請人及前條第一項或第三項機關（構）限期補正；屆期不補正或補正不全者，駁回其申請；不能補正者，逕駁回其申請。
第十條 臺灣地區公務員及特定身分人員進入大陸地區，不得有下列情事：
一、從事妨害國家安全或利益之活動。
二、違反本條例第五條之一或第三十三條之一第一項規定，擅自與大陸地區人民、法人、團體或其他機關（構），簽署協議或為其他任何形式之合作行為。
三、洩漏或交付法令規定應保守秘密之文書、圖畫、消息、物品或資訊。
四、從事其他法令所禁止或應經業務主管機關許可而未經許可之事項。
前項人員在大陸地區受強暴、脅迫、利誘或其他手段，致有違反前項規定或相關法令之虞，應立即或於回臺後一個月內通報(原)服務機關（構）、委託機關或監督機關長官；必要時，請法務部調查局協助處理。
依本辦法申請進入大陸地區之現職人員，不得從事入學進修、選修學分、專題研究等各種型態之進修活動。
第十一條 第八條第一項人員於返臺上班後一星期內，應填具赴大陸地區返臺意見反映表，送交所屬機關（構），機關首長送交所屬機關之上一級機關，縣（市）長送交主管機關，直轄市長送交行政院，受委託人員送交委託機關；第八條第三項人員送交原服務機關（構）、委託機關備查。有具體情事渉及其他主管機關業務者，移請各相關主管機關處理。
第十二條 本辦法自發布日施行。