| 1日 |
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陳水扁總統於元旦祝詞中表示，海峽兩岸應該秉持「善意和解、積極合作、永久和平」的原則，共同推動兩岸關係的良性發展。在和解、合作與和平的前提下，我們不會片面改變以「四不一沒有」為主軸的各項承諾。海峽兩岸有必要將「建立和平穩定的互動架構」，作為現階段共同努力的重大目標。
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中共「國家副主席」胡錦濤在「全國政協」新年茶話會上指出，將在「一個中國」原則基礎上，推動恢復兩岸對話與談判，加強兩岸人員相互往來與交流，積極推動兩岸直接「三通」，同時也堅持反對任何「臺獨」分裂活動。 |
| 7日 |
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中共「國臺辦主任」陳雲林會見我方新聞主管參訪團時表示，對於兩岸會談，雙方應該回到「九二共識」的基礎進行會談協商。 |
| 15日 |
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中共「副總理」錢其琛於大陸「全國臺辦主任會議」閉幕式上表示，只要承認大陸和臺灣同屬於一個中國，承認「九二共識」，兩岸即可恢復對話、協商。兩岸「三通」是經濟事務，「三通」談判可以不涉及「一個中國」的政治含意。 |
| 16日 |
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陳水扁總統接見美國聯邦眾議院訪問團時指出，我們無法接受對岸所謂「一個中國」原則與「一國兩制」，在外交上更受到對岸打壓與飛彈部署的威脅，因此，不論是「三通」、直航等議題都無法坐下來談，我們期盼建立兩岸和平穩定的架構來加以化解。 |
| 21日 |
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陸委會主委蔡英文於九十一年終記者會上表示，我們希望兩岸關係未來走向長期且是結構性的穩定，而要建構「和平穩定的互動架構」，雙方必須要有一個健康的溝通機制。 |
| 22日 |
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經濟部跨部會審查會議第一階段審查臺積電赴大陸投資八吋晶圓廠案，會議決議原則同意放行，但臺積電必須通過第二階段審查（十二吋晶園廠已量產），始能將八吋晶圓廠設備進口至大陸正式生產。 |
| 24日 |
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中共「副總理」錢其琛於紀念「江八點」八周年座談會上表示，「三通」是兩岸之間的事，是經濟問題，「三通」商談不是政治談判，可以不涉及「一個中國」的政治含意。在兩岸的民間行業組織就「三通」的技術性、業務性問題達成共識後，由各方自行取得確認，就可以通起來。 |
| 26日 |
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我方華航包機首度飛抵上海浦東機場，在搭載242名臺商及其眷屬後，原機經香港飛返桃園中正機場，完成春節包機的歷史性首航。 |
| 29日 |
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行政院農委會即日起首度開放大陸漁工上岸住進基隆、蘇澳、新竹、臺中等四個岸置中心過春節。 |
| 3日 |
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兩岸出版業者首次聯合於臺北市舉行「二００三兩岸圖書展」。 |
| 4日 |
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受ＳＡＲＳ疫情影響，陸委會呼籲兩岸交流尚未入境者予以延後，而交流活動延期舉行。 |
| 9日 |
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財政部正式核准國內銀行國際金融業務分行（ＯＢＵ）對臺商放款及外匯指定銀行（ＤＢＵ）與大陸銀行直接通匯申請案，近期內兩岸人民將可透過ＤＢＵ直接通匯。 |
| 11日 |
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針對中共領導人近日表示願意推動兩岸共同防疫的交流，陸委會表示歡迎，並表示願意藉由交流，一方面了解大陸ＳＡＲＳ疫情進一步的資訊，一方面也願意將臺灣具體的防疫經驗與大陸分享。惟臺灣不是中華人民共和國的一省，對於中共官員藉機打壓的作法，我們不歡迎。 |
| 18日 |
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陸委會主委蔡英文接見由美國參議院多數黨領袖費利斯特（Sen. Bill Frist）所率領的國會議員訪問團時表示，中共在對台的作法上極力想要消滅中華民國，分化我政府與人民，並以協商為手段，迫使我接受其所謂「一個中國」的政治主張，以致我方請求協助的事項常無下文，兩岸民間交流衍生的問題缺乏有效解決管道。兩岸在客觀局勢上無法相互抗衡，但是如果臺灣想要「以小博大」，特別需要國際社會的協助與支持，希望美國能在兩岸關係中扮演平衡者的角色。 |
| 20日 |
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中共「台灣同胞投資企業協會管理暫行辦法」即日起實施，辦法中規定台資企業協會會長由台商擔任，會長、副會長必須遵守「一個中國」原則，擁護國家統一。 |
| 21日 |
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為了避免兩岸人員往來影響嚴重急性呼吸道症候群（ＳＡＲＳ）防疫工作，內政部警政署境管局宣布，大陸配偶以探親、探病、團聚事由來臺停留期間屆滿之日為九十二年四月三十日至五月三十日間者，自動延長停留時限至五月三十一日止。 |
| 23日 |
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行政院為處理嚴重急性呼吸道症候群（ＳＡＲＳ）疫情，召開第一次跨部會會議決議，自即日起暫停北京、廣東、山西、內蒙等疫情集中地區之大陸專業人士來臺；延緩大陸人民來臺探親、探病；暫停港澳疫情集中區之觀光客來臺；公教人員並暫停所有赴大陸洽公、探親、探病行程等交流。 |
| 25日 |
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因香港嚴重急性呼吸道症候群（ＳＡＲＳ）疫情尚未減緩，陸委會宣布，四月二十八日起全面暫停香港居民來臺「十四天臨時入境停留（落地簽證）措施」一個月；依一般程序申請入臺證仍照常受理；若有探病、奔喪或緊急商務等急需來臺，可申請快證服務。 |
| 27日 |
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行政院公告之「政府因應和平醫院集體感染嚴重急性呼吸道症候群（ＳＡＲＳ）疫情持續擴大採取之措施」中，規定自四月二十八日起大陸人民、大陸配偶及其子女、香港居民入臺者，將一律採取十天「專案防疫強制居家隔離」。 |
| 29日 |
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陸委會主委蔡英文在「辜汪會談十週年」談話稿中表示，我們紀念辜汪會談十週年的意義，充分展現政府及朝野各界一向珍惜兩岸制度化溝通協商管道建立之不易，更顯示我們十年來從不會藉由兩岸互動來否定對方存在的積極態度。政府一再呼籲兩岸早日恢復制度化協商，就是希望能促進中共正視我們一貫的立場始終沒有改變。 |
| 9日 |
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中共「公安部」表示，因嚴重急性呼吸道症候群（ＳＡＲＳ）疫情停留大陸因而導致簽證逾期的臺灣居民，可向居住地的公安機關出入境管理部門申請延長停留。 |
| 11日 |
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大陸東莞臺商協會向中共「東莞市政府」提出成立首家臺商醫院，已獲得批准，為大陸首度審核同意臺商投資醫院案件。 |
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中共「教育部」核定新增廈門大學中醫系、集美大學、福州大學、福建農林大學、福建醫科大學等五所為單獨對臺灣學生招生的大學。 |
| 14日 |
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由於中國大陸及香港嚴重急性呼吸道症候群（ＳＡＲＳ）疫情尚未穩定，為避免大陸配偶因探親、團聚停留期滿，需返回大陸地區而增加遭受感染機會，行政院ＳＡＲＳ防治及紓困委員會境外管制組宣布，大陸配偶在臺停留即日期滿者，將再自動展延停留期限至九十二年六月三十日止。 |
| 17日 |
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行政院ＳＡＲＳ防治及紓困委員會境外管制組宣布，有關金門縣政府建議暫停辦理金廈通航一個月事宜，經陳報行政院核定，比照馬祖「小三通」調整模式，自今日起暫停金門與大陸客、貨船之往來，其他運作如人貨進出申請及貨物中轉等，仍予維持。至於此項暫停措施，將視疫情情況適時進行檢討。 |
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陸委會公布「民眾對當前兩岸關係之看法」民意調查資料顯示，對於發展外交和兩岸關係之優先性，36.8﹪的民眾認為「發展台灣與其他國家的關係」比較重要，29.9﹪認為「發展兩岸關係」比較重要；對於目前兩岸經貿交流的速度，有31.4﹪的民眾認為「太快」，有31.3﹪的民眾認為「剛剛好」，有18.6﹪的民眾認為「太慢」；如果臺灣的ＳＡＲＳ疫情繼續惡化，有78.1﹪的民眾贊成政府應該繼續暫時全面停止境外病例集中區人員的入、出境；對於開放兩岸直航的時間，有59.2﹪認為應該「慢慢來」，有27.1﹪認為應該「愈快愈好」；有72.6
﹪的民眾不贊成中共「一國兩制」的主張；主張廣義維持現狀的民眾仍占絕大多數（82.2﹪），與歷次調查結果趨勢一致。 |
| 19日 |
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第五十六屆世界衛生組織大會（ＷＨＡ）在日內瓦揭幕，由於中共及古巴等國代表發言反對，我國加入世界衛生組織觀察員的臨時動議案無法列入議程。 |
| 23日 |
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聯合國記者協會邀請我國駐紐約辦事處代表，就我國第七度提出以觀察員身分參與世界衛生組織大會（ＷＨＡ）受中共政治干預而未能如願，以及我國對抗ＳＡＲＳ疫情的作法向該會簡報，卻因中共阻撓而無法進入聯合國。 |
| 25日 |
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對於大陸海協會有意捐贈抗ＳＡＲＳ醫療物資，我方海基會回函表示，建議中共優先將有關醫療物資留在大陸，作為急需醫療物資的大陸醫療及染病人員使用，期望儘早有效控制大陸的疫情，早日減輕我方和全球的恐慌。 |
| 27日 |
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陸委會主委蔡英文接受美國商業週刊訪問時表示，中共不應以政治理由阻止中華民國加入世界衛生組織，中華民國有權利和必要替自己在國際社會中講話，世界衛生組織是一個功能性的組織，不是政治組織。 |
| 1日 |
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美國總統布希於法國艾維昂世界八大工業國（Ｇ８）高峰會議場合與中共「國家主席」胡錦濤會晤時表示，美國遵守美「中」三份聯合公報、臺灣關係法和不支持「臺灣獨立」的「一個中國」政策；美國將根據臺灣關係法，儘可能協助臺灣自衛，提供必要防禦性武器。胡錦濤表示，「臺灣問題」始終是「中」美關係最重要、最敏感的核心問題，中共堅持「和平統一、一國兩制」的基本方針。 |
| 6日 |
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行政院ＳＡＲＳ防治及紓困委員會境外管制組宣布，為活絡國內商務活動，自六月九日起，國人、外籍人士、香港居民、大陸人士因商務（工作）事由自「最近有ＳＡＲＳ地區性傳播的地區」來（返）臺，及經經濟部投審會許可赴大陸投資之臺商及其員工返臺從事商務（工作）活動者，解除Ｂ級居家隔離管制，改行「入境者從事商務（工作）活動行為準則」。 |
| 13日 |
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行政院ＳＡＲＳ防治及紓困委員會境外管制組宣布，自六月十四日起在大陸地區從事「三來一補」廠商經向經濟部簡易登記後可申請放寬入境者Ｂ級居家隔離管制。 |
| 19日 |
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鑒於國內疫情趨於緩和，在配合整體防疫政策下，陸委會陳報行政院決定，自即日起局部恢復「小三通」貨運往來，有關恢復「小三通」客、貨往來，仍將視疫情狀況再進行檢討。 |
| 21日 |
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大陸上海地區35位學生在華東台商子女學校參加臺灣的國中基本學力測驗，由我教育部人員全程監考，這是上海地區第一次和臺灣同步舉辦學力測驗。 |
| 23日 |
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財政部發布修正後的「臺灣地區與大陸地區保險業務往來許可辦法」，開放兩岸再保險業務直接往來，並准許國內保險經紀人、代理人及公證人到大陸設立辦事處。 |
| 30日 |
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由於國內ＳＡＲＳ疫情趨緩，為利恢復國人正常商貿活動，行政院ＳＡＲＳ防治及紓困委員會境外管制組宣布，自七月四日起，國人、外籍人士及港澳居民自大陸地區返（來）臺者解除Ｂ級居家隔離管制，改採自我健康管理機制。 |
| 2日 |
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陳水扁總統發表「九三軍人節」談話時宣示，政府絕對不會以犧牲國家的主權、安全與尊嚴，作為改善兩岸關係的代價或籌碼。中華民國是一個主權獨立的國家，對岸的中華人民共和國也是，這不但是歷史事實，也是對現況最真實的描述。 |
| 5日 |
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陸委會公布「民眾對兩岸三通的看法」民意調查資料顯示，有74.4％的民眾認為應該「有條件開放」兩岸直航，至於未來開放直航最應優先考慮的條件，有58.8%的民眾認為國家安全最重要；有六成左右民眾擔心開放兩岸直航後會造成失業率增加、資金、人才外流等問題；有62.3％民眾不同意大陸方面所提必須把三通看作一個國家的內部事務的主張，有64％民眾不放心由一般民間團體代表政府去進行兩岸三通的談判；但如果由政府全程主導，而民間團體在政府的指示下從旁提供協助，有68.2％民眾表示放心；有67.7％民眾贊成兩岸通航應採取逐步開放的方式，有57.9％認為兩岸直航的時間應該「慢慢來」。 |
| 10日 |
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陸委會主委蔡英文主持「航空貨運便捷化」措施記者說明會，並宣布在兩岸尚未協商「直航」之前，將在不違反現行兩岸航空貨運政策架構下，進行局部改善措施，推動「單向」、「有限度」、「間接」貨運包機。 |
| 14日 |
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我方海巡署馬祖海巡隊在連江縣東莒外海，發現大陸籍漁船越區非法捕撈，海巡員登船檢查，遭大陸漁民抗拒並挾持海巡員江少南及Ｍ16步槍乙枝，前往大陸福建平潭梅花港。 |
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海基會去函大陸海協會請其協調確保我方海巡員江少南人身安全，並儘早安排返回臺灣事宜。 |
| 15日 |
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陳水扁總統參加九十二年大陸臺商負責人秋節聯誼暨臺商盃高爾夫球賽晚宴時表示，現階段最重要的工作是要務實面對兩岸貨運便捷的必要性與迫切性，並進行貨運便捷化的措施，以加速直航的各項準備工作。 |
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經協調後，我方陸委會、海巡署、連江縣政府、海基會等單位代表，搭乘閩珠壹號輪前往大陸福州馬尾港接回被挾持之海巡員江少南返回馬祖。 |
| 17日 |
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財政部長林全宣布核准玉山銀行赴大陸廣東東莞市設立辦事處，以提供當地臺商更多的金融服務。截至目前已核准在大陸設有辦事處的行庫包括：北京為合庫、中信銀；上海為世華、一銀、土銀、臺銀；深圳為華銀；昆山為彰銀。 |
| 19日 |
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交通部公布「國籍航空公司申請飛航大陸間接貨運包機作業程序」，規定航空公司申請間接貨運包機去程及回程均應中途停降香港或澳門機場，而大陸地區貨運包機的航點限定上海浦東或虹橋機場；臺灣地區限定中正或高雄國際機場，實施期間自九月二十五日起，試辦一年。 |
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行政院公布「自由貿易港區申請設置辦法」，放寬跨國企業邀請大陸人士來自由港區從事商務，對其在港區外的食宿、假日旅行等活動，因屬商務活動的輔助性質，將不予禁止。 |
| 24日 |
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中共「國臺辦」發言人李維一針對我方間接貨運包機政策表示，按照一個國家內部事務、直接雙向、互惠互利的原則處理直航相關事宜，這樣才能維護兩岸的共同利益，任何人企圖把兩岸直航說成是「國與國」之間的通航，或在技術層面把兩岸航線變相「國際化」，大陸方面都反對。 |
| 26日 |
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為適應兩岸經貿情勢及民間商業需求，陸委會副主委陳明通宣布行政函釋，跨國企業在大陸地區產製、且具國際性流通物品，以相同商標或品牌經許可進入臺灣地區者，即日起得在臺從事廣告活動。 |
| 27日 |
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我方ＩＤＦ戰鬥機在澎湖海域失事，兩名飛行員跳傘逃生。因大陸漁民協助救援，國防部委託海基會致函大陸海協會，轉達軍方對大陸漁民的感謝。 |
| 2日 |
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美國國務院發言人包潤石於例行記者會表示，美國反對臺海兩岸任何一方單方面改變臺灣海峽現狀的企圖。呼籲兩岸自行克制，不要發表或進行任何足以提高兩岸緊張關係或妨礙對話的言論或行動。 |
| 3日 |
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中共「總理」溫家寶預定於十二月七日至十日訪問美國華盛頓、紐約及波士頓，並安排與美國總統布希見面，此行焦點議題，主要包括「臺灣問題」和改善美、「中」兩國經貿關係。 |
| 4日 |
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陳水扁總統接見美國參議員賓格曼時表示，防衛性公投是為維持現狀，絕對不涉統獨爭議，也不違背「四不一沒有」政策，主要是為鞏固心防和讓大陸了解臺灣人民真正心聲。 |
| 6日 |
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美國國務卿鮑爾表示，布希總統將再度對來訪的中共「總理」溫家寶重申，美國將徹底遵行在「三個公報」及「臺灣關係法」架構下的「一個中國」政策，以及美國不支持獨立運動，不支持「臺灣獨立」。 |
| 8日 |
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針對中共「總理」溫家寶在聯合國對記者發表相關談話，陸委會表示，兩岸問題的癥結在於中共當局不願面對兩岸關係的現實，以致一直迴避兩岸直接對話與協商。縱使近來中共當局一再提出預設政治障礙，阻礙兩岸溝通對話，陸委會依舊持續呼籲中共當局要早日移除障礙，與我方進行對話，才能為促進兩岸良性關係作出貢獻。 |
| 9日 |
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美國總統布希與中共「總理」溫家寶於白宮舉行記者會，布希表示，美國的政策是「一個中國」政策，基於三個聯合公報與臺灣關係法，反對任何旨在片面改變臺灣現狀的決定。溫家寶則表示，解決「臺灣問題」，大陸的立場是「和平統一、一國兩制」，願意盡最大誠意和努力。 |
| 10日 |
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陳水扁總統於接見美國眾議員柏頓時表示，防衛性公投是為了避免戰爭、免除人民恐懼、維持臺灣現狀，我們無意改變臺灣現狀，也不允許臺灣現狀被改變。我們要維持一個和平、穩定的臺灣現狀，而不是一個充滿武力威脅、飛彈部署的現狀。 |
| 17日 |
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中共「國臺辦」公布兩岸三通政策說明書，明確界定三通是兩岸中國人內部的事務；兩岸空中、海上通航即是兩岸航線。 |
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陸委會針對中共「國臺辦」公布兩岸三通政策說明書表示，希望中共能夠以真正務實的態度排除兩岸協商的障礙。尤其直航及三通涉及諸多公權力事項，兩岸經由正式協商，做好雙方都可以接受的安排，不僅是維護與尊重雙方各自的立場與制度，也可以為兩岸互動爭取雙贏之結果。 |
| 23日 |
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針對媒體報導有多位在大陸臺商遭中共當局以間諜罪名逮捕乙事，陸委會發布新聞稿指出，近來有人將臺商失去聯絡事件刻意泛政治化，並在未經查明事實真相之前，引述香港媒體的說法，即任意指稱這些案件為「間諜」案，這是對失聯臺商及其家屬的侵害，對此陸委會表達高度遺憾。 |
| 25日 |
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中共國家領導人胡錦濤首度以「國家主席」身分與大陸各地臺資協會會長見面，同時強調不以政治分歧影響兩岸經濟合作的主張，只要是對臺灣同胞來大陸投資經商、興辦實業有利的事情；只要是對兩岸經濟、科技和文化等領域的交流和合作有利的事情；只要是對兩岸關係發展和統一有利的事情，都會盡最大努力推動，並願意就加強兩岸經濟合作問題聽取臺灣工商界人士的意見和建議。 |
| 26日 |
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游錫堃院長針對中共「國家主席」胡錦濤與臺資協會會長見面乙事表示，中國大陸方面若真有善意，應積極推動：一、春節包機順利成行；二、不要阻擋海基會到廣州、北京及上海設分支機構，就近照顧臺商；三、海基會與大陸政府針對臺灣的人身安全、財產自由權益等事宜進行正式協商；四、撤除瞄準臺灣飛彈，並向臺灣及世人宣布，不再以軍事武力威脅臺灣人民。 |
| 30日 |
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行政院核定「試辦金門馬祖與大陸地區通航實施辦法」延展一年，自民國九十三年一月一日至十二月三十一日止。 |
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陳水扁總統於年終談話中表示，我們呼籲對岸的北京當局，公開放棄武力的威脅、撤除針對性的飛彈部署，否則，再多的鄉愁、再多的柔性訴求也無法拉近臺灣人民的心。 |