大陸委員會

海基會性質上屬於民間團體，在業務執行上，主要是受政府委託處理兩岸往來涉及公權力之協商、交流與服務事宜。陸委會與海基會之間具有下列兩方面的關係：

監督關係

依據臺灣地區與大陸地區人民關係條例第4條第2項、第4條之4等相關條文、財團法人法、民法第32條及陸委會組織法第2條規定，陸委會對海基會的業務有監督之責。

委託關係

陸委會與海基會在法律上的另一層關係就是委託關係，屬於特別監督程序，雙方的權利義務，依照委託契約約定，雙方互動關係（如指示、請求報告、履行）亦以委託契約為依據。